Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Генетика и геномика аспиринового обострения респираторного заболевания (AERD) (AERD)

30 августа 2021 г. обновлено: National Jewish Health
Респираторное заболевание, обостряемое аспирином (AERD), представляет собой относительно гомогенное заболевание, характеризующееся тяжелой формой астмы у взрослых, развитием доброкачественных новообразований в носовом канале (т. носовые полипы) и аллергия на аспирин. Причина AERD неизвестна, хотя, вероятно, возникает в результате воздействия окружающей среды в сочетании с генетической предрасположенностью. Однородность заболевания AERD увеличивает возможность обнаружения узко определенных генетических факторов и делает его идеальной популяцией для изучения генетических и эпигенетических изменений, вызывающих астму. Исследователи недавно обнаружили, что экспрессия генов эпителиального роста и репарации (EGR) существенно снижена в эпителиальных клетках бронхиальных дыхательных путей у больных с тяжелой астмой по сравнению с менее тяжелыми астматиками и здоровыми людьми из контрольной группы. Это новое открытие указывает на то, что целостность эпителия и связанные с ней процессы могут иметь первостепенное значение для развития тяжелой астмы и, возможно, подтипа тяжелой астмы, AERD. Этот вывод позже был подтвержден в последующей лабораторной модели, которая показала, что блокирование центрального гена репарации и дифференцировки эпителия, рецептора 2 эпидермального фактора роста человека (ERBB2), сокращает время заживления клеток бронхиального эпителия после повреждения. Таким образом, цель предлагаемого исследования состоит в том, чтобы определить, подавляется ли ген EGR также при AERD, гомогенном подтипе тяжелой астмы. Кроме того, исследователи также определят, связаны ли генетические мутации и/или эпигенетические изменения с подавлением генов EGR и потенциально могут объяснить это. В частности, исследователи планируют получить экспрессию генов в клетках эпителия дыхательных путей, только что очищенных щеткой, у 140 пациентов с AERD, 70 пациентов с астмой, не чувствительных к аспирину, и 35 здоровых людей. астматические дыхательные пути. Мазок из носового канала на наличие эпителиальных клеток позволяет неинвазивно оценить экспрессию генов эпителиальных клеток дыхательных путей. Наш экспериментальный дизайн сравнивает профили экспрессии генов AERD со здоровым контролем и определяет, подавлены ли гены EGR при AERD по сравнению со здоровым контролем. Как следствие, исследователи надеются обнаружить профиль экспрессии генов, специфичный для AERD, который может однажды помочь в диагностике и расширить текущие знания о механизмах заболевания. Кроме того, исследователи будут коррелировать изменения экспрессии генов, особенно любое обнаружение генов EGR со сниженной регуляцией, с изменениями метилирования (т.е. эпигенетические изменения) и генетические мутации.

Обзор исследования

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Ожидаемый)

245

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

От 18 лет до 75 лет (Взрослый, Пожилой взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Участников AERD, подтип тяжелой астмы, характеризующийся воспалением носовой полости, развитием доброкачественных новообразований и аллергией на аспирин; 35 здоровых участников контроля. Популяции будут набраны из посещений клиник или клинических исследований, все добровольцы.

Описание

Критерии включения:

  • Врачебный диагноз астмы
  • Врачебный диагноз хронического заболевания носа с полипами носа
  • Чувствительность к аспирину, подтвержденная провокационной пробой аспирина в клинике
  • Здоровый участник контроля

Критерий исключения:

  • Активное курение
  • Беременность
  • Курение в анамнезе более или равно 10 пачко-лет курения
  • Любые серьезные сопутствующие заболевания, которые могут непреднамеренно повлиять на результаты исследования.
  • Состояния, требующие всплесков пероральных кортикостероидов
  • Другие серьезные заболевания легких
  • Другое заболевание, по мнению исследователя, запрещает участие в исследовании.

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Наблюдательные модели: Кейс-контроль
  • Временные перспективы: Перспективный

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Участники АЕРД
У участников с аспирином обострилось респираторное заболевание. Взрослые с аллергией на аспирин, полипами в носу и тяжелой астмой у взрослых.
Здоровые элементы управления
Здоровые участники, у которых нет астмы.
Участники с астмой, не чувствительные к аспирину
Участники с астмой, но не имеющие чувствительности к аспирину.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Оценка экспрессии генов, связанных с EGR, в AERD
Временное ограничение: По окончании учебы, 3 года
Исследователи получат генную экспрессию в свежесобранных эпителиальных клетках носовых дыхательных путей пациентов с AERD, пациентов с астмой, нечувствительных к аспирину, и здоровых пациентов, используя образцы назального мазка и запуская RNAseq на собранных клетках. Исследователи будут сравнивать профили генов AERD с пациентами с астмой, нечувствительными к аспирину, и здоровыми пациентами и определять, обнаруживается ли при AERD подавление генов EGR.
По окончании учебы, 3 года

Вторичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Связь экспрессии гена EGR с метилированием эпигенетического гена
Временное ограничение: По окончании учебы, 3 года
Чтобы определить, изменяется ли профилирование метилирования всего генома в связи с подавленными генами EGR. Исследователи получат дополнительные профили метилирования всего генома участников исследования и оценят, связаны ли подавленные гены EGR у пациентов с AERD с различиями в метилировании, с помощью комплексного анализа, объединяющего экспрессию и эпигенетические данные. Программное обеспечение MethylMix R будет использоваться для выявления изменений метилирования, связанных с изменениями экспрессии генов. MethylMix интегрирует метилирование ДНК нормальных и больных образцов с согласованной экспрессией генов. Таким образом, MethylMix определяет гипер- и гипометилированные гены, сравнивая значения метилирования пораженной ткани с нормальной.
По окончании учебы, 3 года
Влияние генетической изменчивости на экспрессию генов, связанных с EGR
Временное ограничение: По окончании учебы, 3 года
Определить, связаны ли генетические мутации со сниженной экспрессией гена EGR у пациентов с AERD. Мы получим генотипы этих же участников исследования и оценим, связаны ли гены EGR со сниженной регуляцией с мутациями с помощью комплексного анализа, объединяющего экспрессию и генотипы. Рабочий процесс генотипирования Affymetrix состоит из 4 шагов; первые 3 шага используют набор автономных программных пакетов, а 4-й шаг использует пакет R SNPolisher. Контроль качества образцов будет оцениваться по статистике Dish-QC, сохраняя образцы с Dish-QC по умолчанию > 82%. Генотипированные образцы с частотой вызовов ниже значения по умолчанию, равного 97%, будут исключены. Контроль качества планшета будет оцениваться путем ручного расчета статистики «Частота прохождения планшета» и «Среднего коэффициента обращения к планшету» с пороговыми значениями по умолчанию 95 и 99%. Этап генотипирования будет повторен для образцов, отвечающих критериям качества. SNPolisher оценит качество сигнала и классифицирует каждый зонд SNP.
По окончании учебы, 3 года

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

6 ноября 2018 г.

Первичное завершение (Ожидаемый)

1 апреля 2022 г.

Завершение исследования (Ожидаемый)

1 апреля 2022 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

5 декабря 2019 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

5 февраля 2020 г.

Первый опубликованный (Действительный)

10 февраля 2020 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

1 сентября 2021 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

30 августа 2021 г.

Последняя проверка

1 августа 2021 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться