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Génétique et génomique des maladies respiratoires exacerbées par l'aspirine (AERD) (AERD)

30 août 2021 mis à jour par: National Jewish Health
La maladie respiratoire exacerbée par l'aspirine (AERD) est une maladie relativement homogène caractérisée par un asthme sévère de l'adulte, le développement de croissances non cancéreuses dans le canal nasal (c.-à-d. polypes nasaux) et allergie à l'aspirine. La cause de l'AERD est inconnue, bien qu'elle résulte probablement d'agressions environnementales associées à une susceptibilité génétique. L'homogénéité de la maladie AERD augmente la possibilité de découvrir des contributeurs génétiques étroitement définis et en fait une population idéale pour étudier les changements génétiques et épigénétiques qui causent l'asthme. Les chercheurs ont récemment découvert que l'expression génique des gènes de croissance et de réparation épithéliales (EGR) est considérablement réduite dans les cellules épithéliales des voies respiratoires bronchiques des asthmatiques sévères par rapport aux asthmatiques moins sévères et aux témoins sains. Cette nouvelle découverte indique que l'intégrité épithéliale et les processus associés peuvent être d'une importance primordiale pour le développement de l'asthme sévère, et potentiellement du sous-type d'asthme sévère, l'AERD. Cette découverte a ensuite été étayée par un modèle de laboratoire ultérieur, qui a montré que le blocage d'un gène central de réparation et de différenciation épithéliale, le récepteur 2 du facteur de croissance épidermique humain (ERBB2), diminuait le temps de guérison des cellules épithéliales bronchiques après une blessure. Ainsi, l'objectif de l'étude proposée est de déterminer si le gène EGR est également régulé à la baisse dans l'AERD, un sous-type homogène d'asthme sévère. Dans le prolongement, les chercheurs détermineront également si des mutations génétiques et/ou des changements épigénétiques sont liés à et expliquent potentiellement cette régulation à la baisse des gènes EGR. Plus précisément, les chercheurs prévoient d'obtenir l'expression génique des cellules épithéliales des voies respiratoires nasales fraîchement brossées de 140 patients atteints d'AERD, 70 patients asthmatiques non sensibles à l'aspirine et 35 témoins sains, notant qu'il a récemment été démontré que l'expression des gènes épithéliaux nasaux reflète les changements épithéliaux pulmonaires dans voies respiratoires asthmatiques. L'écouvillonnage du canal nasal pour les cellules épithéliales permet d'évaluer l'expression génique des cellules épithéliales des voies respiratoires de manière non invasive. Notre conception expérimentale compare les profils d'expression des gènes AERD aux contrôles sains et détermine si les gènes EGR sont déprimés dans l'AERD par rapport aux contrôles de santé. En corollaire, les chercheurs cherchent à découvrir un profil d'expression génique spécifique à l'AERD qui pourrait un jour aider au diagnostic et élargir les connaissances actuelles sur les mécanismes de la maladie. Dans le prolongement, les chercheurs mettront en corrélation les changements d'expression génique, en particulier toute découverte de gènes EGR régulés à la baisse, avec les changements de méthylation (c'est-à-dire changements épigénétiques) et mutations génétiques.

Aperçu de l'étude

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

245

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

    • Colorado
      • Denver, Colorado, États-Unis, 80206
        • National Jewish Health

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

18 ans à 75 ans (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Les participants à l'AERD, un sous-type d'asthme sévère caractérisé par une inflammation de la cavité nasale, le développement de tumeurs non cancéreuses et une allergie à l'aspirine ; 35 participants témoins sains. Les populations seront recrutées à partir de visites cliniques ou d'enquêtes de recherche clinique, toutes volontaires.

La description

Critère d'intégration:

  • Diagnostic médical de l'asthme
  • Diagnostic par un médecin d'une maladie nasale chronique caractérisée par des polypes nasaux
  • Sensibilité à l'aspirine vérifiée par un challenge provocateur d'aspirine en clinique
  • Participant témoin sain

Critère d'exclusion:

  • Tabagisme actif
  • Grossesse
  • Antécédents de tabagisme supérieurs ou égaux à 10 paquets-années
  • Toute condition comorbide importante qui pourrait interférer par inadvertance avec les résultats de l'étude
  • Conditions nécessitant des poussées de corticostéroïdes oraux
  • Autres maladies pulmonaires importantes
  • Une autre maladie de l'avis de l'investigateur interdit la participation à l'étude

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cas-témoins
  • Perspectives temporelles: Éventuel

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Participants à l'AERD
Les participants avec de l'aspirine ont exacerbé la maladie respiratoire. Adultes allergiques à l'aspirine, polypes nasaux et asthme sévère de l'adulte.
Contrôles sains
Participants en bonne santé qui ne souffrent pas d'asthme.
Participants asthmatiques non sensibles à l'aspirine
Participants asthmatiques, mais qui n'ont pas de sensibilité à l'aspirine.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Évaluation de l'expression des gènes liés à l'EGR dans l'AERD
Délai: Jusqu'à la fin des études, 3 ans
Les chercheurs obtiendront l'expression génique globale de cellules épithéliales des voies respiratoires nasales fraîchement brossées de patients atteints d'AERD, de patients asthmatiques non sensibles à l'aspirine et de patients en bonne santé à l'aide d'échantillons d'écouvillonnage nasal et en exécutant RNAseq sur les cellules collectées. Les chercheurs compareront les profils des gènes AERD avec ceux des patients asthmatiques non sensibles à l'aspirine et des patients en bonne santé et détermineront si une régulation négative des gènes EGR se trouve dans l'AERD.
Jusqu'à la fin des études, 3 ans

Mesures de résultats secondaires

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Relation entre l'expression du gène EGR et la méthylation du gène épigénétique
Délai: Jusqu'à la fin des études, 3 ans
Déterminer si le profilage de la méthylation du génome entier est altéré en association avec les gènes EGR régulés à la baisse. Les chercheurs obtiendront des profils complémentaires de méthylation du génome entier des participants à l'étude et évalueront si les gènes EGR régulés à la baisse chez les patients AERD sont associés à des différences de méthylation par une analyse composite intégrant des données d'expression et épigénétiques. Le logiciel MethylMix R sera utilisé pour identifier les changements de méthylation associés aux changements d'expression génique. MethylMix intègre la méthylation de l'ADN à partir d'échantillons normaux et pathologiques avec une expression génique correspondante. En résumé, MethylMix définit les gènes hyper et hypométhylés en comparant les valeurs de méthylation des tissus malades par rapport à la normale.
Jusqu'à la fin des études, 3 ans
Influence de la variation génétique sur l'expression des gènes liés à l'EGR
Délai: Jusqu'à la fin des études, 3 ans
Déterminer si les mutations génétiques s'associent à une expression du gène EGR régulée à la baisse chez les patients atteints d'AERD. Nous obtiendrons des génotypes sur ces mêmes participants à l'étude et évaluerons si les gènes EGR régulés à la baisse sont associés à des mutations par une analyse composite intégrant l'expression et les génotypes. Le workflow de génotypage Affymetrix se compose de 4 étapes ; les 3 premières étapes utilisent un ensemble de packages logiciels autonomes et la 4ème étape utilise le package R SNPolisher. Le CQ de l'échantillon sera évalué par la statistique Dish-QC, en conservant les échantillons avec Dish-QC par défaut > 82 %. Les échantillons génotypés avec un taux de rappel inférieur à la valeur par défaut de 97 % seront exclus. Platewise QC sera évalué en calculant manuellement les statistiques « Plate Pass Rate » et « Average Plate Call Rate », avec des valeurs seuil par défaut de 95 et 99 %. L'étape de génotypage sera réexécutée pour les échantillons répondant aux critères de qualité. SNPolisher évaluera la qualité du signal et classera chaque sonde SNP.
Jusqu'à la fin des études, 3 ans

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

6 novembre 2018

Achèvement primaire (Anticipé)

1 avril 2022

Achèvement de l'étude (Anticipé)

1 avril 2022

Dates d'inscription aux études

Première soumission

5 décembre 2019

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

5 février 2020

Première publication (Réel)

10 février 2020

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

1 septembre 2021

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

30 août 2021

Dernière vérification

1 août 2021

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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