急性骨髄性白血病における内因性レトロウイルス (ERVAL)

同種造血幹細胞移植 (HSCT) は、多数の悪性血液疾患に対する唯一の治癒療法です。 この分野における最近の進歩にもかかわらず、再発率は依然として高く、死因の第 1 位となっています。 したがって、関連する新しい治療標的の同定が緊急に必要とされています。

ヒト内因性レトロ ウイルス (HERV) は、ヒトゲノムの 8% を占めています。 定常状態では (主にメチル化メカニズムによって) 沈黙しているが、HERV の再活性化は、自己免疫疾患やがんなどのさまざまな状態で報告されており、自然免疫および適応免疫応答を引き起こします。 利用可能なデータがほとんどない血液学の分野ではいくつかの疑問が提起されており、これらの疾患におけるHERVの正確な役割はまだ定義されていません.

私たちのチームは現在、さまざまな種類のがんにおけるHERVの役割に取り組んでいます. RNAseq データから過剰発現した HERV を識別するためのバイオインフォマティクス アプローチを開発しました。 また、HERV オープン リーディング フレームからのさまざまなペプチドの免疫原性を評価するための in vitro アッセイを開発し、さまざまな HERV 間で共有されるいくつかのエピトープが特定の CD8+ T 細胞応答を誘導できることを示しました。 最近では、TCGA からの 151 の急性骨髄性白血病 (AML) RNAseq データを分析し、この疾患で過剰発現している複数の HERV を特定しました。 診断時の患者の血液を用いた免疫原性試験が現在進行中です。

私たちのプロジェクトのこの部分の主な目的は、AML 患者の HSCT 後の移植片対白血病効果に関与する HERV 特異的 CD8+ T 細胞応答の確立を分析することです。 二次的な目的は、この反応と GVHD の発症や再発などのさまざまな臨床的要因との関係を分析することです。

AML患者からの末梢血単核細胞（PBMC）は、診断、完全寛解（HSCT前）およびHSCT後（M3、M6およびM12）の異なる時点で抽出および凍結されます。 この将来のプロトコルは現在、Centre Hospitalier Lyon Sud で進行中であり、約 30 のサンプルが既に利用可能です。

関連する HERV を選択した後、DNA バーコードによって識別される特定のデキストラマーが合成されます。 これらのデキストラマーにより、最大 1000 のエピトープに対する特定の T 細胞応答を識別できるため、最も一般的な HLA について、AML で過剰発現した HERV に対する特定の T 細胞をスクリーニングすることができます。 解凍後、PBMCに対してデキストラマー染色を行う。 陽性細胞はフローサイトメトリーによって選別され、シーケンスを実行する前に PCR によって DNA が拡張されるため、固有の DNA バーコードによって特定の配列を識別できます。

HSCT 後の HERV 特異的 CD8+ T 細胞応答の分析により、移植片対白血病効果の開始における HERV の役割をより明確にすることができます。 ＧｖＨＤを伴わない特異的Ｔ細胞応答は、腫瘍特異的抗原としてのそのようなペプチドの関連性を定義する。