急性髓性白血病中的内源性逆转录病毒 (ERVAL)

同种异体造血干细胞移植（HSCT）是治疗多种恶性血液病的唯一方法。 尽管该领域最近取得了进展，但复发率仍然很高，并且是死亡的首要原因。 因此，迫切需要确定新的相关治疗靶点。

人类内源性逆转录病毒 (HERV) 占人类基因组的 8%。 虽然在稳态下沉默（主要通过甲基化机制），但已经描述了 HERV 在不同条件下的重新激活，例如自身免疫性疾病或癌症，导致先天性和适应性免疫反应。 在几乎没有可用数据的血液学领域提出了几个问题，而且 HERV 在这些疾病中的确切作用仍有待确定。

我们的团队目前正在研究 HERV 在不同类型癌症中的作用。 我们开发了一种生物信息学方法来从 RNAseq 数据中识别过表达的 HERV。 我们还开发了体外试验来评估来自 HERV 开放阅读框的不同肽的免疫原性，并表明不同 HERV 共享的几个表位可以诱导特定的 CD8+ T 细胞反应。 最近，我们分析了来自 TCGA 的 151 份急性髓性白血病 (AML) RNAseq 数据，并在该疾病中发现了多种过表达的 HERV。 目前正在对诊断时的患者血液进行免疫原性测试。

我们项目这一部分的主要目标是分析 HERVs 特异性 CD8+ T 细胞反应的建立，参与 AML 患者 HSCT 后的移植物抗白血病效应。 次要目标是分析这种反应与不同临床因素（例如 GVHD 的发作或复发）之间的关系。

来自 AML 患者的外周血单核细胞 (PBMC) 将在不同时间点提取和冷冻：诊断、完全缓解（HSCT 前）和 HSCT 后（M3、M6 和 M12）。 该前瞻性方案目前正在 Centre Hospitalier Lyon Sud 进行，已有大约 30 个样本可用。

选择相关 HERV 后，将合成由 DNA 条形码识别的特定葡聚糖。 这些葡聚糖允许识别针对多达 1000 个表位的特定 T 细胞反应，我们将能够针对最常见的 HLA 筛选针对在 AML 中过表达的 HERV 的特定 T 细胞。 解冻后将在 PBMC 上进行葡聚糖染色。 阳性细胞将通过流式细胞仪分选，DNA 将在进行测序前通过 PCR 扩增，从而通过其独特的 DNA 条形码识别特定序列。

HSCT 后 HERVs 特异性 CD8+ T 细胞反应的分析将使我们能够更好地定义 HERVs 在移植物抗白血病效应发作中的作用。 没有 GvHD 的特定 T 细胞反应将定义此类肽作为肿瘤特异性抗原的相关性。