Avera/Sema4 腫瘍学および分析プロトコル (ASAP)
悪性腫瘍と診断された、またはがんを発症するリスクがある参加者における電子健康記録の包括的な分子プロファイリングと深い臨床注釈の実装
この研究の目的は、大規模な統合されたコミュニティベースのヘルスケアシステムでケアを受ける参加者に存在する分子特性の幅を理解することです。 包括的なゲノム プロファイリングとプロテオミクスを使用して、研究者は、さまざまな疾患の進行段階とがんの種類にわたる参加者の前がん状態または悪性状態の根底にあるゲノム ドライバーを特定しようとしています。
包括的な分子プロファイリングは、全エクソーム配列決定、全トランスクリプトーム配列決定、プロテオミクス、および全ゲノム配列決定の選択されたインスタンスを使用した体細胞腫瘍検査 (組織および/または血液) で構成されます。 さらに、研究者は、影響を受けた参加者集団で広範な遺伝性がん検査を実施しようとしています。 遺伝的検査は、罹患した参加者のスクリーニング、予後、および治療に影響を与えるだけでなく、遺伝カウンセリングおよびカスケード検査にも広範な影響を及ぼします。
ゲノム情報の価値を最大化するために、このプロトコルに同意した参加者は、電子カルテを (遡及的および前向きに) 抽出し、精選し、注釈を付け、テストの実行を通じて得られたゲノム情報にリンクします。 このデータの長期的な価値を考えると、参加者は、サンプルをバイオバンクに保存し、匿名化された情報を将来の研究に使用することに自発的に同意することも求められます。
この参加者集団全体で収集された情報は、研究者のがん生物学に関する知識の向上、臨床転帰に関連するバイオマーカーの発見と検証、およびがん研究を促進するための共同プロジェクトでの共有に役立ちます。
調査の概要
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Rachel Elsey, PharmD
- 電話番号:605-322-3225
- メール:rachel.elsey@avera.org
研究連絡先のバックアップ
- 名前:Avera Precision Research Team
- 電話番号:888-422-1410
- メール:McK-MBX-PrecisionResearch@avera.org
研究場所
-
-
Minnesota
-
Marshall、Minnesota、アメリカ、56258
- 募集
- Avera Cancer Institute - Marshall
-
コンタクト:
- Rachel Elsey, PharmD
- 電話番号:605-322-3225
- メール:rachel.elsey@avera.org
-
-
South Dakota
-
Aberdeen、South Dakota、アメリカ、57401
- 募集
- Avera Cancer Institute - Aberdeen
-
コンタクト:
- Rachel Elsey, PharmD
- 電話番号:605-322-3225
- メール:rachel.elsey@avera.org
-
Mitchell、South Dakota、アメリカ、57301
- 募集
- Avera Cancer Institute - Mitchell
-
コンタクト:
- Rachel Elsey, PharmD
- 電話番号:605-322-3225
- メール:rachel.elsey@avera.org
-
Pierre、South Dakota、アメリカ、57501
- 募集
- Avera Cancer Institute - Pierre
-
コンタクト:
- Rachel Elsey, PharmD
- 電話番号:605-322-3225
- メール:rachel.elsey@avera.org
-
Sioux Falls、South Dakota、アメリカ、57105
- 募集
- Avera Cancer Institute
-
コンタクト:
- Rachel Elsey, PharmD
- 電話番号:605-322-3225
- メール:rachel.elsey@avera.org
-
Yankton、South Dakota、アメリカ、57078
- 募集
- Avera Cancer Institute - Yankton
-
コンタクト:
- Rachel Elsey, PharmD
- 電話番号:605-322-3225
- メール:rachel.elsey@avera.org
-
-
参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
- 18歳以上である必要があります
- 精密検査を受けているか、前がん状態の追跡を受けているか、がんの診断を受けている必要があります
- -研究に参加する前に、IRBが承認した最新の同意書に自発的に署名して理解する必要があります
除外基準:
- 同意書に記載された事項と手続きを理解できない参加者
- -研究要件に同意または順守できないと見なされる精神疾患の病歴または既知の参加者
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
|---|---|
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包括的な分子プロファイリングに参加している患者の割合
時間枠:5年
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5年
|
|
カスケード遺伝子検査に紹介された患者の割合
時間枠:5年
|
5年
|
|
分子標的臨床試験に紹介された患者の割合
時間枠:5年
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5年
|
二次結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
|---|---|
|
包括的な分子プロファイリングにより治療が変更された患者の割合
時間枠:5年
|
5年
|
|
薬理ゲノミクス検査により治療が変更された患者の割合
時間枠:5年
|
5年
|
|
マイクロバイオームの収集と分析に参加している患者の割合
時間枠:5年
|
5年
|
協力者と研究者
協力者
捜査官
- 主任研究者:Rachel Elsey, PharmD、Avera Cancer Institute
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- O'Donnell PH, Dolan ME. Cancer pharmacoethnicity: ethnic differences in susceptibility to the effects of chemotherapy. Clin Cancer Res. 2009 Aug 1;15(15):4806-14. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-09-0344. Epub 2009 Jul 21.
- Shaw DM, Elger BS, Colledge F. What is a biobank? Differing definitions among biobank stakeholders. Clin Genet. 2014 Mar;85(3):223-7. doi: 10.1111/cge.12268. Epub 2013 Oct 16.
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- Beltran H, Eng K, Mosquera JM, Sigaras A, Romanel A, Rennert H, Kossai M, Pauli C, Faltas B, Fontugne J, Park K, Banfelder J, Prandi D, Madhukar N, Zhang T, Padilla J, Greco N, McNary TJ, Herrscher E, Wilkes D, MacDonald TY, Xue H, Vacic V, Emde AK, Oschwald D, Tan AY, Chen Z, Collins C, Gleave ME, Wang Y, Chakravarty D, Schiffman M, Kim R, Campagne F, Robinson BD, Nanus DM, Tagawa ST, Xiang JZ, Smogorzewska A, Demichelis F, Rickman DS, Sboner A, Elemento O, Rubin MA. Whole-Exome Sequencing of Metastatic Cancer and Biomarkers of Treatment Response. JAMA Oncol. 2015 Jul;1(4):466-74. doi: 10.1001/jamaoncol.2015.1313.
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- Samimi G, Bernardini MQ, Brody LC, Caga-Anan CF, Campbell IG, Chenevix-Trench G, Couch FJ, Dean M, de Hullu JA, Domchek SM, Drapkin R, Spencer Feigelson H, Friedlander M, Gaudet MM, Harmsen MG, Hurley K, James PA, Kwon JS, Lacbawan F, Lheureux S, Mai PL, Mechanic LE, Minasian LM, Myers ER, Robson ME, Ramus SJ, Rezende LF, Shaw PA, Slavin TP, Swisher EM, Takenaka M, Bowtell DD, Sherman ME. Traceback: A Proposed Framework to Increase Identification and Genetic Counseling of BRCA1 and BRCA2 Mutation Carriers Through Family-Based Outreach. J Clin Oncol. 2017 Jul 10;35(20):2329-2337. doi: 10.1200/JCO.2016.70.3439. Epub 2017 Apr 11.
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- Kuchenbaecker KB, Hopper JL, Barnes DR, Phillips KA, Mooij TM, Roos-Blom MJ, Jervis S, van Leeuwen FE, Milne RL, Andrieu N, Goldgar DE, Terry MB, Rookus MA, Easton DF, Antoniou AC; BRCA1 and BRCA2 Cohort Consortium; McGuffog L, Evans DG, Barrowdale D, Frost D, Adlard J, Ong KR, Izatt L, Tischkowitz M, Eeles R, Davidson R, Hodgson S, Ellis S, Nogues C, Lasset C, Stoppa-Lyonnet D, Fricker JP, Faivre L, Berthet P, Hooning MJ, van der Kolk LE, Kets CM, Adank MA, John EM, Chung WK, Andrulis IL, Southey M, Daly MB, Buys SS, Osorio A, Engel C, Kast K, Schmutzler RK, Caldes T, Jakubowska A, Simard J, Friedlander ML, McLachlan SA, Machackova E, Foretova L, Tan YY, Singer CF, Olah E, Gerdes AM, Arver B, Olsson H. Risks of Breast, Ovarian, and Contralateral Breast Cancer for BRCA1 and BRCA2 Mutation Carriers. JAMA. 2017 Jun 20;317(23):2402-2416. doi: 10.1001/jama.2017.7112.
- Peltomaki P. Update on Lynch syndrome genomics. Fam Cancer. 2016 Jul;15(3):385-93. doi: 10.1007/s10689-016-9882-8.
- Knerr S, Bowles EJA, Leppig KA, Buist DSM, Gao H, Wernli KJ. Trends in BRCA Test Utilization in an Integrated Health System, 2005-2015. J Natl Cancer Inst. 2019 Aug 1;111(8):795-802. doi: 10.1093/jnci/djz008.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- ASAP Protocol
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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