糞便微生物叢移植後のレシピエントの腸内微生物叢の変化

Clostridioides difcile 感染症 (CDI) は、院内下痢症の最も一般的な原因であり、米国で最も一般的な医療関連感染症であり、感染症全体の 15% を占め、年間 30,000 人近くが死亡し、推定経済的費用は 50 億ドルです。 /年。

過去 10 年間、CDI に関連する負担のほとんどは再発 CDI (rCDI) (3) に依存しています。 rCDI は入院期間を延長し、罹患率と死亡率の増加に関連することが知られています。

さらに、rCDI は多くの場合、一次感染だけでなく、偽膜性大腸炎、中毒性巨大結腸、ショック、穿孔、血流感染 (BSI)、敗血症などの生命を脅かす合併症を伴い、腸内細菌または真菌による死亡率は 50% 近くに達します。 、そして死。

糞便微生物叢移植 (FMT) は、健康なドナーから、腸内細菌叢に関連する障害を持つレシピエントへの糞便の注入として定義され、CDI に対する非常に効果的な治療オプションであることが知られています。 FMT はまた、バンコマイシンによる標準治療よりも効果的であり、CDI の多発再発治療のための国際ガイドラインによって推奨されています。

rCDI の治療に対する FMT の臨床効果に関する証拠が増えているにもかかわらず、この臨床効果のメカニズムも不明です。

メタゲノム解析は、腸内細菌叢を調べ、微生物の多様性を推定するための優れたオプションとして知られています。 この研究の目的は、メタゲノミクス解析を使用して、FMT 後の rCDI 患者の微生物組成の変化を評価することです。

研究者は、単一施設の観察的展望研究を実施します。 患者は、Fondazione Policlinico Universitario "A. ジェメリ」。 すべての選択基準を持ち、除外基準のいずれも持たない患者（このウェブサイトの特定のセクションで詳述）は、この研究で考慮されます。

FMT手順の前に、人口統計データが消化器疾患のスタッフによって収集されます。

さらに、微生物学スタッフによる腸内微生物叢のメタゲノム評価およびメタトランスクリプトーム評価のために、患者は糞便サンプルを無菌の密閉容器に収集し、-80°Cで保存するように求められます。

患者は、臨床診療に従って、大腸内視鏡検査による FMT 処置を受けます。 研究の各患者は、特定のレシピエントとドナーの一致なしに、1人のドナーから糞便を受け取ります。 糞便提供者の選択は、国際ガイドラインで以前に推奨されたプロトコルに従い、COVID-19 パンデミック時の糞便微生物叢移植の再編成によって課せられた新しい推奨事項に従って、消化器病棟のスタッフによって行われます。 すべての糞便注入剤は、当院の微生物学ユニットで製造されます。 凍結した便のみを使用します。 凍結糞便の調製は、国際ガイドラインのプロトコルに従います。

フォローアップの訪問は、消化器科の医師によって行われます。 すべての患者は、治療終了後 3 か月間経過観察されます。

治療終了後、1 週目、2 週目、4 週目、12 週目にフォローアップの来院が予定されています。 各訪問で、研究者はマイクロバイオーム分析のために便サンプルを収集します。

研究成果は、このウェブサイトの特定のセクションに詳述されています。 マイクロバイオーム分析では、グループ平均間の統計的差異は、R 統計ソフトウェア パッケージ (R Core Team、ウィーン、オーストリア) を通じて、両側 Wilcoxon-Rank Sum Test を使用して計算されます。