Cambiamenti nei destinatari del microbiota intestinale dopo il trapianto di microbiota fecale

L'infezione da Clostridioides difficile (CDI) è la causa più comune di diarrea nosocomiale e la malattia infettiva associata all'assistenza sanitaria più comune negli Stati Uniti, rappresentando il 15% delle infezioni complessive, quasi 30.000 decessi all'anno e una spesa economica stimata di $ 5 miliardi /anno.

Nell'ultimo decennio, la maggior parte dell'onere relativo alla CDI dipende dalla recidiva CDI (rCDI) (3). È noto che la rCDI prolunga la durata dell'ospedalizzazione e che è associata a un aumento dei tassi di morbilità e mortalità.

Inoltre, la rCDI è spesso, più che un'infezione primaria, associata a complicazioni potenzialmente letali, tra cui colite pseudomembranosa, megacolon tossico, shock, perforazione, infezione del flusso sanguigno (BSI), sepsi, causata da batteri o funghi intestinali con un tasso di mortalità vicino al 50% , e la morte.

Il trapianto di microbiota fecale (FMT), definito come l'infusione di feci da donatori sani a riceventi con disturbi associati alla disbiosi, è noto per essere un'opzione terapeutica altamente efficace contro la CDI. FMT è anche più efficace del trattamento standard con vancomicina ed è raccomandato dalle linee guida internazionali per il trattamento delle recidive multiple di CDI.

Nonostante il crescente numero di prove sull'efficacia clinica della FMT per il trattamento della rCDI, anche i meccanismi di questa efficacia clinica sono sconosciuti.

L'analisi metagenomica è nota come una buona opzione per esaminare il microbiota intestinale e stimare la diversità microbica. Lo scopo di questo studio è valutare i cambiamenti nella composizione microbica nei pazienti con rCDI dopo FMT, utilizzando l'analisi metagenomica.

Gli investigatori effettueranno uno studio prospettico osservazionale a centro singolo. I pazienti saranno reclutati tra quelli afferenti all'unità di gastroenterologia della Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". I pazienti con tutti i criteri di inclusione e nessuno dei criteri di esclusione (dettagliati nella sezione specifica di questo sito Web) saranno presi in considerazione per questo studio.

Prima della procedura FMT, i dati demografici saranno raccolti dal personale delle malattie gastrointestinali.

Inoltre, ai pazienti verrà richiesto di fornire campioni di feci da raccogliere in un contenitore sterile, sigillato e conservato a -80°C per la valutazione metagenomica del microbioma intestinale e la valutazione del meta-trascrittoma da parte del personale di microbiologia.

I pazienti, secondo la pratica clinica, riceveranno la procedura FMT mediante colonscopia. Ogni paziente dello studio riceverà le feci da un singolo donatore senza alcuna specifica corrispondenza ricevente-donatore. La selezione dei donatori di feci sarà effettuata dal personale dell'unità di gastroenterologia seguendo i protocolli precedentemente raccomandati dalle linee guida internazionali e secondo la nuova raccomandazione imposta dalla riorganizzazione del trapianto di microbiota fecale durante la pandemia di COVID-19. Tutti gli infusi fecali saranno prodotti nell'unità di microbiologia del nostro ospedale. Verranno utilizzate solo feci congelate. La preparazione delle feci congelate seguirà i protocolli delle linee guida internazionali.

Le visite di controllo saranno eseguite dai medici dell'unità di gastroenterologia. Tutti i pazienti saranno seguiti per 3 mesi dopo la fine dei trattamenti.

Le visite di follow-up saranno programmate alla settimana 1, settimana 2, settimana 4 e settimana 12, dopo la fine dei trattamenti. Ad ogni visita gli investigatori raccoglieranno campioni di feci per l'analisi del microbioma.

I risultati dello studio sono dettagliati nell'apposita sezione di questo sito web. Per l'analisi del microbioma, le differenze statistiche tra le medie di gruppo saranno calcolate utilizzando un Wilcoxon-Rank Sum Test a due code, attraverso il pacchetto software statistico R (R Core Team, Vienna, Austria).