Ændringer i modtagernes tarmmikrobiota efter fækal mikrobiotatransplantation

Clostridioides dificile infektion (CDI) er den mest almindelige årsag til nosokomiel diarré og den mest almindelige sundhedsrelaterede infektionssygdom i USA, der tegner sig for 15 % af de samlede infektioner, næsten 30.000 dødsfald om året, en anslået økonomisk udgift på 5 mia. /år.

I det sidste årti afhænger størstedelen af ​​byrden i forbindelse med CDI af recidiv CDI (rCDI) (3). rCDI er kendt for at forlænge indlæggelseslængden og være forbundet med øget sygelighed og dødelighed.

Desuden er rCDI ofte, mere end primær infektion, forbundet med livstruende komplikationer, herunder pseudomembranøs colitis, toksisk megacolon, shock, perforation, infektion i blodbanen (BSI), sepsis, forårsaget af tarmbakterier eller svampe med en dødelighed på næsten 50 % , og døden.

Fækal mikrobiotatransplantation (FMT), defineret som infusion af fæces fra raske donorer til modtagere med lidelser forbundet med dysbiose, er kendt for at være en yderst effektiv behandlingsmulighed mod CDI. FMT er også mere effektivt end standardbehandling med vancomycin, og det anbefales af International Guidelines til behandling af flere recidiv af CDI.

På trods af den stigende mængde af beviser om den kliniske effekt af FMT til behandling af rCDI, er mekanismer for denne kliniske effekt også ukendte.

Metagenomics-analyse er kendt som en god mulighed for at undersøge tarmmikrobiota og estimere mikrobiel diversitet. Formålet med denne undersøgelse er at evaluere ændringer i mikrobiel sammensætning hos rCDI-patienter efter FMT ved hjælp af metagenomisk analyse.

Forskerne vil udføre en enkelt-center observationsperspektivundersøgelse. Patienter vil blive rekrutteret blandt dem, der henvises til den gastroenterologiske enhed i Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". Patienter med alle inklusionskriterier og ingen af ​​eksklusionskriterierne (detaljeret i det specifikke afsnit på denne hjemmeside) vil blive taget i betragtning til denne undersøgelse.

Inden FMT-proceduren vil demografiske data blive indsamlet af personalet i mave-tarmsygdomme.

Desuden vil patienterne blive bedt om at give afføringsprøver, der skal indsamles i en steril, forseglet beholder og opbevares ved -80°C til metagenomisk vurdering af tarmmikrobiom og meta-transkriptomvurdering af det mikrobiologiske personale.

Patienter vil ifølge klinisk praksis modtage FMT-procedure ved koloskopi. Hver patient i undersøgelsen vil modtage fæces fra én enkelt donor uden nogen specifik modtager-donor-match. Udvælgelsen af ​​afføringsdonorer vil blive udført af personalet på den gastroenterologiske enhed i henhold til protokoller, der tidligere er anbefalet af internationale retningslinjer og i henhold til den nye anbefaling, som blev pålagt af reorganiseringen af ​​fækal mikrobiotatransplantation under COVID-19-pandemien. Alle fækale infusater vil blive fremstillet i den mikrobiologiske enhed på vores hospital. Der vil kun blive brugt frossen afføring. Tilberedning af frossen fæces vil følge protokoller fra internationale retningslinjer.

Opfølgningsbesøg vil blive udført af læger fra den gastroenterologiske afdeling. Alle patienter vil blive fulgt op i 3 måneder efter endt behandling.

Opfølgningsbesøg vil blive planlagt i uge 1, uge ​​2, uge ​​4 og uge 12 efter endt behandling. Ved hvert besøg vil efterforskerne indsamle afføringsprøver til mikrobiomanalyse.

Studieresultater er detaljeret i det specifikke afsnit på denne hjemmeside. Til mikrobiomanalyse vil statistiske forskelle mellem gruppemiddelværdier blive beregnet ved hjælp af en to-halet Wilcoxon-Rank Sum Test gennem R statistisk softwarepakke (R Core Team, Wien, Østrig).