Изменения микробиоты кишечника реципиентов после трансплантации фекальной микробиоты

Инфекция Clostridioides difficile (CDI) является наиболее распространенной причиной внутрибольничной диареи и наиболее распространенным инфекционным заболеванием, связанным с оказанием медицинской помощи в Соединенных Штатах, на долю которого приходится 15% от общего числа инфекций, почти 30 000 смертей в год. предполагаемые экономические расходы составляют 5 миллиардов долларов. /год.

В последнее десятилетие большая часть бремени, связанного с ИКД, связана с рецидивирующей ИКД (рИКД) (3). Известно, что rCDI увеличивает продолжительность госпитализации и связана с повышенной заболеваемостью и смертностью.

Кроме того, рКДИ часто, помимо первичной инфекции, связана с опасными для жизни осложнениями, включая псевдомембранозный колит, токсический мегаколон, шок, перфорацию, инфекцию кровотока (BSI), сепсис, вызванный кишечными бактериями или грибками, с летальностью почти 50%. , и смерть.

Трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ), определяемая как переливание фекалий от здоровых доноров реципиенту с нарушениями, связанными с дисбиозом, известна как высокоэффективный вариант лечения ИКД. ТФМ также более эффективна, чем стандартное лечение ванкомицином, и рекомендуется Международными рекомендациями для лечения множественных рецидивов ИКД.

Несмотря на растущее количество данных о клинической эффективности FMT для лечения rCDI, механизмы этой клинической эффективности также неизвестны.

Метагеномный анализ известен как хороший вариант для изучения микробиоты кишечника и оценки микробного разнообразия. Целью данного исследования является оценка изменений микробного состава у пациентов с рИКД после ТФМ с использованием метагеномного анализа.

Исследователи проведут одноцентровое обсервационное перспективное исследование. Пациенты будут набираться среди тех, кто направлен в гастроэнтерологическое отделение Fondazione Policlinico Universitario "A. Джемелли». Пациенты со всеми критериями включения и ни с одним из критериев исключения (подробно описанные в соответствующем разделе этого веб-сайта) будут рассматриваться для участия в этом исследовании.

Перед процедурой ТФМ специалисты по желудочно-кишечным заболеваниям будут собирать демографические данные.

Кроме того, пациентам будет предложено сдать образцы стула, которые будут собраны в стерильный герметичный контейнер и храниться при температуре -80 ° C для метагеномной оценки кишечного микробиома и оценки мета-транскриптома персоналом-микробиологом.

Пациенты, в соответствии с клинической практикой, будут получать процедуру ТФМ с помощью колоноскопии. Каждый пациент исследования будет получать фекалии от одного единственного донора без какого-либо конкретного соответствия реципиент-донор. Отбор доноров стула будет осуществляться персоналом гастроэнтерологического отделения в соответствии с протоколами, ранее рекомендованными международными руководствами, и в соответствии с новыми рекомендациями, связанными с реорганизацией трансплантации фекальной микробиоты во время пандемии COVID-19. Все фекальные инфузии будут производиться в отделении микробиологии нашей больницы. Будут использоваться только замороженные фекалии. Подготовка замороженных фекалий будет соответствовать протоколам международных руководств.

Последующие визиты будут проводиться врачами гастроэнтерологического отделения. Все пациенты будут находиться под наблюдением в течение 3 месяцев после окончания лечения.

Последующие посещения будут запланированы на 1-й, 2-й, 4-й и 12-й неделе после окончания лечения. При каждом посещении исследователи будут собирать образцы стула для анализа микробиома.

Результаты исследования подробно описаны в соответствующем разделе этого веб-сайта. Для анализа микробиома статистические различия между средними группами будут рассчитываться с использованием двустороннего критерия суммы рангов Уилкоксона с помощью пакета статистического программного обеспечения R (R Core Team, Вена, Австрия).