Endringer i mottakernes tarmmikrobiota etter fekal mikrobiotatransplantasjon

Clostridioides dificile-infeksjon (CDI) er den vanligste årsaken til nosokomial diaré, og den vanligste helsevesen-assosierte infeksjonssykdommen i USA, og står for 15 % av de totale infeksjonene, nesten 30 000 dødsfall per år, en estimert økonomisk kostnad på 5 milliarder dollar /år.

I det siste tiåret er det meste av byrden knyttet til CDI avhengig av tilbakefall av CDI (rCDI) (3). rCDI er kjent for å forlenge sykehusinnleggelseslengden, og å være assosiert med økt sykelighet og dødelighet.

Videre er rCDI ofte, mer enn primærinfeksjon, assosiert med livstruende komplikasjoner, inkludert pseudomembranøs kolitt, giftig megacolon, sjokk, perforering, blodbaneinfeksjon (BSI), sepsis, forårsaket av tarmbakterier eller sopp med en dødelighet på nesten 50 % , og døden.

Fekal mikrobiotatransplantasjon (FMT), definert som infusjon av avføring fra friske givere til mottaker med lidelser assosiert med dysbiose, er kjent for å være et svært effektivt behandlingsalternativ mot CDI. FMT er også mer effektivt enn standardbehandling med vankomycin, og det anbefales av internasjonale retningslinjer for behandling av gjentatte CDI.

Til tross for den økende mengden av bevis om den kliniske effekten av FMT for behandling av rCDI, er mekanismer for denne kliniske effekten også ukjente.

Metagenomikkanalyse er kjent som et godt alternativ for å undersøke tarmmikrobiota og estimere mikrobiell mangfold. Målet med denne studien er å evaluere endringer i mikrobiell sammensetning hos rCDI-pasienter etter FMT, ved hjelp av metagenomikkanalyse.

Etterforskerne vil gjennomføre en enkeltsenter observasjonsperspektivstudie. Pasienter vil bli rekruttert blant dem som henvises til gastroenterologienheten til Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". Pasienter med alle inklusjonskriterier og ingen av eksklusjonskriteriene (detaljert i den spesifikke delen av denne nettsiden) vil bli vurdert for denne studien.

Før FMT-prosedyren vil demografiske data bli samlet inn av personalet for mage-tarmsykdom.

Videre vil pasienter bli bedt om å gi avføringsprøver som skal samles i en steril, forseglet beholder og oppbevares ved -80 °C for metagenomisk vurdering av tarmmikrobiom og meta-transkriptomvurdering av mikrobiologipersonalet.

Pasienter vil i henhold til klinisk praksis motta FMT-prosedyre ved koloskopi. Hver pasient i studien vil motta avføring fra én enkelt donor uten noen spesifikk mottaker-donor-match. Utvelgelsen av avføringsdonorer vil bli utført av personalet på gastroenterologienheten i henhold til protokoller som tidligere er anbefalt av internasjonale retningslinjer og i henhold til den nye anbefalingen som ble pålagt av reorganiseringen av fekal mikrobiotatransplantasjon under COVID-19-pandemien. Alle fekale infusater vil bli produsert i den mikrobiologiske enheten på sykehuset vårt. Kun frossen avføring vil bli brukt. Tilberedning av frossen avføring vil følge protokoller fra internasjonale retningslinjer.

Oppfølgingsbesøk vil bli utført av leger fra gastroenterologisk enhet. Alle pasienter vil bli fulgt opp i 3 måneder etter avsluttet behandling.

Oppfølgingsbesøk vil bli planlagt i uke 1, uke 2, uke 4 og uke 12, etter avsluttet behandling. Ved hvert besøk vil etterforskerne samle avføringsprøver for mikrobiomanalyse.

Studieresultater er detaljert i den spesifikke delen av denne nettsiden. For mikrobiomanalyse vil statistiske forskjeller mellom gruppegjennomsnitt beregnes ved hjelp av en to-halet Wilcoxon-Rank Sum Test, gjennom R statistisk programvarepakke (R Core Team, Wien, Østerrike).