Muutokset vastaanottajien suolen mikrobiotossa ulosteen mikrobiotan siirron jälkeen

Clostridioides difficile -infektio (CDI) on yleisin sairaalaripulin syy ja yleisin terveydenhuoltoon liittyvä tartuntatauti Yhdysvalloissa. Se muodostaa 15 % kaikista infektioista, lähes 30 000 kuolemantapausta vuodessa, mikä on arviolta 5 miljardin dollarin taloudellinen kustannus. /vuosi.

Viimeisen vuosikymmenen aikana suurin osa CDI:hen liittyvästä taakasta on riippuvainen toistuvasta CDI:stä (rCDI) (3). rCDI:n tiedetään pidentävän sairaalahoidon kestoa ja liittyvän lisääntyneeseen sairastuvuus- ja kuolleisuusasteeseen.

Lisäksi rCDI on usein enemmän kuin primaarinen infektio, joka liittyy hengenvaarallisiin komplikaatioihin, mukaan lukien pseudomembranoottinen paksusuolentulehdus, toksinen megakooloni, sokki, perforaatio, verenkiertoinfektio (BSI), sepsis, jonka aiheuttavat suolistobakteerit tai sienet ja joiden kuolleisuusaste on lähes 50 %. , ja kuolema.

Ulosteen mikrobiotasiirron (FMT), joka määritellään ulosteiden infuusiona terveiltä luovuttajilta vastaanottajalle, jolla on dysbioosiin liittyviä häiriöitä, tiedetään olevan erittäin tehokas hoitovaihtoehto CDI:tä vastaan. FMT on myös tehokkaampi kuin tavallinen vankomysiinihoito, ja sitä suositellaan kansainvälisissä ohjeissa CDI:n toistuvan uusiutumisen hoitoon.

Huolimatta lisääntyvästä määrästä näyttöä FMT:n kliinisestä tehokkuudesta rCDI:n hoidossa, tämän kliinisen tehon mekanismeja ei myöskään tunneta.

Metagenominen analyysi tunnetaan hyvänä vaihtoehtona tutkia suoliston mikrobiota ja arvioida mikrobien monimuotoisuutta. Tämän tutkimuksen tavoitteena on arvioida muutoksia mikrobikoostumuksessa rCDI-potilailla FMT:n jälkeen metagenomiikkaanalyysin avulla.

Tutkijat tekevät yhden keskuksen havainnointiperspektiivitutkimuksen. Potilaat rekrytoidaan niiden joukosta, jotka on lähetetty Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". Tässä tutkimuksessa otetaan huomioon potilaat, joilla on kaikki sisällyttämiskriteerit eikä yksikään poissulkemiskriteeri (tämän verkkosivuston erityisessä osiossa).

Ennen FMT-menettelyä ruoansulatuskanavan sairauksien henkilökunta kerää väestötietoja.

Lisäksi potilaita pyydetään antamaan ulostenäytteet, jotka kerätään steriiliin, suljettuun astiaan ja säilytetään -80 °C:ssa mikrobiologian henkilöstön suorittamaa suoliston mikrobiomin ja metatranskription metagenomista arviointia varten.

Kliinisen käytännön mukaan potilaat saavat FMT-toimenpiteen kolonoskopialla. Jokainen tutkimuksen potilas saa ulosteita yhdeltä luovuttajalta ilman erityistä vastaanottaja-luovuttaja-yhteyttä. Ulosteenluovuttajien valinnan suorittaa gastroenterologian yksikön henkilökunta noudattaen kansainvälisten ohjeiden aiemmin suosittelemia protokollia ja COVID-19-pandemian aikaisen ulosteen mikrobiotan uudelleenjärjestelyn määräämää uutta suositusta. Kaikki ulosteinfusaatit valmistetaan sairaalamme mikrobiologian osastolla. Vain jäädytettyjä ulosteita käytetään. Jäädytettyjen ulosteiden valmistuksessa noudatetaan kansainvälisten ohjeiden protokollia.

Seurantakäynnit tekevät gastroenterologian yksikön lääkärit. Kaikkia potilaita seurataan 3 kuukauden ajan hoidon päättymisen jälkeen.

Seurantakäynnit ajoitetaan viikoille 1, 2, 4 ja 12 hoitojen päätyttyä. Jokaisella käynnillä tutkijat keräävät ulostenäytteitä mikrobiomianalyysiä varten.

Tutkimustulokset on kuvattu tämän verkkosivuston erityisessä osiossa. Mikrobiomianalyysiä varten tilastolliset erot ryhmien keskiarvojen välillä lasketaan käyttämällä kaksisuuntaista Wilcoxon-Rank Sum Testiä R-tilastoohjelmistopaketin kautta (R Core Team, Wien, Itävalta).