Veranderingen in ontvangers darmmicrobiota na fecale microbiota-transplantatie

Clostridioides difficile-infectie (CDI) is de meest voorkomende oorzaak van nosocomiale diarree en de meest voorkomende infectieziekte die verband houdt met de gezondheidszorg in de Verenigde Staten, goed voor 15% van de totale infecties, bijna 30.000 sterfgevallen per jaar en een geschatte economische kost van $ 5 miljard /jaar.

In het afgelopen decennium hangt het grootste deel van de last in verband met CDI af van recidief-CDI (rCDI) (3). Van rCDI is bekend dat het de duur van ziekenhuisopname verlengt en geassocieerd is met verhoogde morbiditeit en mortaliteit.

Bovendien wordt rCDI vaak, meer dan een primaire infectie, geassocieerd met levensbedreigende complicaties, waaronder pseudomembraneuze colitis, toxisch megacolon, shock, perforatie, bloedbaaninfectie (BSI), sepsis, veroorzaakt door darmbacteriën of schimmels met een sterftecijfer van bijna 50% , en de dood.

Fecale microbiota-transplantatie (FMT), gedefinieerd als de infusie van feces van gezonde donoren naar ontvanger met aandoeningen die verband houden met dysbiose, staat bekend als een zeer effectieve behandelingsoptie tegen CDI. FMT is ook effectiever dan de standaardbehandeling met vancomycine en wordt aanbevolen door internationale richtlijnen voor de behandeling van meervoudig recidieven van CDI.

Ondanks de toenemende hoeveelheid bewijs over de klinische werkzaamheid van FMT voor de behandeling van rCDI, zijn ook de mechanismen voor deze klinische werkzaamheid onbekend.

Metagenomics-analyse staat bekend als een goede optie om de darmmicrobiota te onderzoeken en de microbiële diversiteit in te schatten. Het doel van deze studie is om veranderingen in de microbiële samenstelling bij rCDI-patiënten na FMT te evalueren, met behulp van metagenomics-analyse.

De onderzoekers zullen een observatieperspectiefonderzoek in één centrum uitvoeren. Patiënten zullen worden geworven onder degenen die zijn doorverwezen naar de gastro-enterologie-eenheid van de Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". Patiënten met alle inclusiecriteria en geen van de exclusiecriteria (gedetailleerd in het specifieke gedeelte van deze website) komen in aanmerking voor deze studie.

Voorafgaand aan de FMT-procedure worden demografische gegevens verzameld door het personeel voor gastro-intestinale aandoeningen.

Bovendien zullen patiënten worden gevraagd ontlastingsmonsters te geven die in een steriele, afgesloten container moeten worden verzameld en bij -80°C moeten worden bewaard voor metagenomische beoordeling van het darmmicrobioom en meta-transcriptoombeoordeling door het microbiologisch personeel.

Patiënten zullen, volgens de klinische praktijk, een FMT-procedure ondergaan door middel van colonoscopie. Elke patiënt van het onderzoek krijgt feces van één enkele donor zonder enige specifieke match tussen ontvanger en donor. De selectie van ontlastingsdonoren zal worden uitgevoerd door het personeel van de gastro-enterologie-eenheid volgens protocollen die eerder werden aanbevolen door internationale richtlijnen en volgens de nieuwe aanbeveling opgelegd door de reorganisatie van fecale microbiota-transplantatie tijdens de COVID-19-pandemie. Alle fecale infuusproducten worden vervaardigd in de afdeling microbiologie van ons ziekenhuis. Er wordt alleen ingevroren ontlasting gebruikt. Bereiding van ingevroren feces zal volgens de protocollen van internationale richtlijnen verlopen.

Vervolgbezoeken worden uitgevoerd door artsen van de afdeling gastro-enterologie. Alle patiënten worden gedurende 3 maanden na het einde van de behandelingen gevolgd.

Vervolgbezoeken worden gepland in week 1, week 2, week 4 en week 12, na het einde van de behandelingen. Bij elk bezoek verzamelen onderzoekers ontlastingsmonsters voor microbioomanalyse.

Studieresultaten worden beschreven in het specifieke gedeelte van deze website. Voor microbioomanalyse zullen statistische verschillen tussen groepsgemiddelden worden berekend met behulp van een tweezijdige Wilcoxon-Rank Sum-test, via het R statistische softwarepakket (R Core Team, Wenen, Oostenrijk).