Cambios en la microbiota intestinal de los receptores después del trasplante de microbiota fecal

La infección por Clostridioides difficile (CDI) es la causa más común de diarrea nosocomial y la enfermedad infecciosa asociada a la atención médica más común en los Estados Unidos, representando el 15% de las infecciones totales, casi 30,000 muertes por año y un gasto económico estimado de $5 mil millones /año.

En la última década, la mayor parte de la carga relacionada con la CDI depende de la recurrencia de la CDI (rCDI) (3). Se sabe que la rCDI prolonga la duración de la hospitalización y se asocia con un aumento de las tasas de morbilidad y mortalidad.

Además, la rCDI a menudo, más que la infección primaria, se asocia con complicaciones potencialmente mortales, que incluyen colitis pseudomembranosa, megacolon tóxico, shock, perforación, infección del torrente sanguíneo (BSI), sepsis, causada por bacterias intestinales u hongos con una tasa de mortalidad cercana al 50 %. y muerte.

El trasplante de microbiota fecal (FMT), definido como la infusión de heces de donantes sanos a receptores con trastornos asociados a la disbiosis, es conocido por ser una opción de tratamiento altamente eficaz contra la ICD. El FMT también es más eficaz que el tratamiento estándar con vancomicina y las Directrices internacionales lo recomiendan para el tratamiento de la recurrencia múltiple de CDI.

A pesar del creciente cuerpo de evidencia sobre la eficacia clínica de FMT para el tratamiento de rCDI, también se desconocen los mecanismos para esta eficacia clínica.

El análisis metagenómico es conocido como una buena opción para examinar la microbiota intestinal y estimar la diversidad microbiana. El objetivo de este estudio es evaluar los cambios en la composición microbiana en pacientes con rCDI después de FMT, utilizando análisis metagenómicos.

Los investigadores llevarán a cabo un estudio de perspectiva observacional de un solo centro. Los pacientes serán reclutados entre los derivados a la unidad de gastroenterología de la Fondazione Policlinico Universitario "A. Gemelli". Los pacientes con todos los criterios de inclusión y ninguno de los criterios de exclusión (detallados en la sección específica de este sitio web) serán considerados para este estudio.

Antes del procedimiento FMT, el personal de enfermedades gastrointestinales recopilará datos demográficos.

Además, se solicitará a los pacientes que proporcionen muestras de heces para recolectarlas en un recipiente estéril y sellado y almacenarlas a -80 °C para la evaluación metagenómica del microbioma intestinal y la evaluación del metatranscriptoma por parte del personal de microbiología.

Los pacientes, de acuerdo con la práctica clínica, recibirán el procedimiento FMT por colonoscopia. Cada paciente del estudio recibirá heces de un único donante sin ninguna compatibilidad específica entre receptor y donante. La selección de donantes de heces será realizada por el personal de la unidad de gastroenterología siguiendo los protocolos previamente recomendados por las guías internacionales y de acuerdo con la nueva recomendación impuesta por la reorganización del trasplante de microbiota fecal durante la pandemia de COVID-19. Todas las infusiones fecales se fabricarán en la unidad de microbiología de nuestro hospital. Solo se utilizarán heces congeladas. La preparación de heces congeladas seguirá los protocolos de las directrices internacionales.

Las visitas de seguimiento serán realizadas por médicos de la unidad de gastroenterología. Todos los pacientes serán seguidos durante 3 meses después del final de los tratamientos.

Las visitas de seguimiento se programarán en la semana 1, la semana 2, la semana 4 y la semana 12, después de finalizar los tratamientos. En cada visita, los investigadores recolectarán muestras de heces para el análisis del microbioma.

Los resultados del estudio se detallan en la sección específica de este sitio web. Para el análisis del microbioma, las diferencias estadísticas entre las medias de los grupos se calcularán mediante una prueba de suma de rangos de Wilcoxon de dos colas, a través del paquete de software estadístico R (R Core Team, Viena, Austria).