Změny u příjemců střevní mikrobiota po transplantaci fekální mikrobioty

Infekce Clostridioides difficile (CDI) je nejčastější příčinou nozokomiálních průjmů a nejběžnější infekční nemocí související se zdravotní péčí ve Spojených státech, která představuje 15 % celkových infekcí, téměř 30 000 úmrtí ročně, odhadované ekonomické náklady 5 miliard USD. /rok.

V posledním desetiletí závisí většina zátěže související s CDI na recidivě CDI (rCDI) (3). Je známo, že rCDI prodlužuje délku hospitalizace a je spojen se zvýšenou morbiditou a mortalitou.

Kromě toho je rCDI často více než primární infekce spojena s život ohrožujícími komplikacemi, včetně pseudomembranózní kolitidy, toxického megakolonu, šoku, perforace, infekce krevního řečiště (BSI), sepse způsobené střevními bakteriemi nebo houbami s úmrtností téměř 50 %. a smrt.

Transplantace fekální mikrobioty (FMT), definovaná jako infuze stolice od zdravých dárců příjemci s poruchami spojenými s dysbiózou, je známá jako vysoce účinná možnost léčby proti CDI. FMT je také účinnější než standardní léčba vankomycinem a je doporučována Mezinárodními směrnicemi pro léčbu mnohočetné recidivy CDI.

Navzdory rostoucímu množství důkazů o klinické účinnosti FMT pro léčbu rCDI nejsou mechanismy této klinické účinnosti rovněž známy.

Metagenomická analýza je známá jako dobrá možnost pro zkoumání střevní mikroflóry a odhadování mikrobiální diverzity. Cílem této studie je vyhodnotit změny v mikrobiálním složení u pacientů s rCDI po FMT pomocí metagenomické analýzy.

Vyšetřovatelé provedou jednocentrovou observační perspektivní studii. Pacienti budou přijímáni z těch, kteří byli odesláni na gastroenterologickou jednotku Fondazione Policlinico Universitario „A. Gemelli". Do této studie budou zahrnuti pacienti se všemi zařazovacími kritérii a žádným vylučovacím kritériem (podrobně ve zvláštní části této webové stránky).

Před zákrokem FMT shromáždí personál gastrointestinálního onemocnění demografická data.

Kromě toho budou pacienti požádáni, aby poskytli vzorky stolice, které budou odebrány do sterilní, uzavřené nádoby a uloženy při -80 °C pro metagenomické hodnocení střevního mikrobiomu a meta-transkriptomové hodnocení pracovníky mikrobiologie.

Pacienti, podle klinické praxe, podstoupí FMT proceduru kolonoskopií. Každý pacient ve studii dostane stolici od jednoho jediného dárce bez jakékoli specifické shody příjemce-dárce. Výběr dárců stolice bude provádět personál gastroenterologické jednotky podle protokolů dříve doporučených mezinárodními směrnicemi a podle nového doporučení uloženého reorganizací transplantace fekální mikrobioty během pandemie COVID-19. Všechny fekální infuze budou vyráběny na mikrobiologickém oddělení naší nemocnice. Použijí se pouze zmrazené výkaly. Příprava zmrazeného trusu se bude řídit protokoly z mezinárodních směrnic.

Následné návštěvy budou provádět lékaři gastroenterologického oddělení. Všichni pacienti budou sledováni po dobu 3 měsíců po ukončení léčby.

Následné návštěvy budou naplánovány na 1. týden, 2. týden, 4. týden a 12. týden po ukončení léčby. Při každé návštěvě vyšetřovatelé odeberou vzorky stolice pro analýzu mikrobiomu.

Výsledky studie jsou podrobně uvedeny ve zvláštní části tohoto webu. Pro analýzu mikrobiomů budou statistické rozdíly mezi průměry skupin vypočteny pomocí dvoustranného Wilcoxon-Rank Sum Testu prostřednictvím statistického softwarového balíku R (R Core Team, Vídeň, Rakousko).