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Enterococcus Spp の表現型および遺伝子型の変異

2023年4月16日 更新者:Mai Gamal Abdel Naser Abbas Khalifa、Sohag University

Enterococcus Spp.の表現型および遺伝子型変異エジプトのソハグ大学病院で院内感染患者から分離

腸球菌は、短鎖および中鎖に配置されたグラム陽性の通性嫌気性球菌です。 腸球菌は消化管に存在し、通常は人間と共生して機能します。 ただし、尿路感染症 (UTI)、腹腔内感染症、菌血症、心内膜炎など、いくつかの感染症を引き起こす可能性があります。

確認された多くの種の中で、E. faecalis と E. faecium は、感染を引き起こし、抗菌薬耐性の脅威をもたらす可能性のある最も一般的な種であり、E. faecalis が感染の大部分を占めています。

調査の概要

詳細な説明

腸球菌は、短鎖および中鎖に配置されたグラム陽性の通性嫌気性球菌です。

腸球菌は消化管に存在し、通常は人間と共生して機能します。 ただし、尿路感染症 (UTI)、腹腔内感染症、菌血症、心内膜炎など、いくつかの感染症を引き起こす可能性があります。

確認された多くの種の中で、E. faecalis と E. faecium は、感染を引き起こし、抗菌薬耐性の脅威をもたらす可能性のある最も一般的な種であり、E. faecalis が感染の大部分を占めています。

腸球菌の病原性種は、アドヘシン、ゼラチナーゼ、腸球菌表面タンパク質、凝集物質、細胞溶解素などの多くの毒性因子をバイオフィルム形成とともに発現します。 これらの要因は、病原体が宿主組織に栄養を獲得することにより、侵入、付着、および生存する能力を高めます。 薬剤耐性株にそれらが存在すると、感染の重症度が高まります

腸球菌は、アミノグリコシドやβ-ラクタムベースの抗生物質などの抗生物質に対して本質的に耐性があります。 アミノグリコシドに対する中程度の耐性は、大きなアミノグリコシド分子に対する腸球菌細胞壁の固有の低い透過性によるものであり、E. faecalis よりも E. faecium でより一般的です。 本質的なβ-ラクタム耐性は、β-ラクタムに対する親和性が低いペニシリン結合タンパク質の過剰発現によるものであり、E. faecalis は E. faecium よりもペニシリンに対する耐性が高くなります。

さらに、腸球菌は抗菌薬に対する耐性を容易に獲得でき、バンコマイシン耐性腸球菌 (VRE) は、新しい抗生物質が必要な優先病原体の 1 つです。

さらに、バイオフィルムの形成は、腸球菌が宿主の免疫応答および抗生物質の阻害または殺傷効果を回避するための戦略の 1 つです。

この自己生成細胞外マトリックスは、腸球菌が成長するのに適した微小環境も提供し、細菌間の移動性遺伝要素 (MGE) の伝達を促進します。 腸球菌バイオフィルムは、人工弁心内膜炎、人工関節感染症、カテーテル関連感染症などの留置デバイス関連感染症に関与しています。

バイオフィルムを形成するバクテリアは、多くの抗生物質に対する耐性と免疫応答を示し、治療の失敗につながります。 バイオフィルム関連感染症の治療と根絶の難しさを考えると、バイオフィルムの形成を防ぐための抗生物質以外の治療オプションに対する満たされていないニーズがあります。

ナノ粒子は、その非常に小さいサイズとさまざまな抗菌特性から注目を集めています。 ナノ粒子は単位面積あたり細菌と相互作用できるため、ナノ粒子の抗菌活性をより強力にすることができます。 ナノ粒子は、細菌膜の破壊や細胞内成分の放出など、いくつかの殺菌経路を開始することもでき、細菌が耐性になるのを困難にします。

研究の種類

観察的

入学 (予想される)

100

連絡先と場所

このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。

研究連絡先

研究連絡先のバックアップ

研究場所

参加基準

研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。

適格基準

就学可能な年齢

1ヶ月~90年 (子、大人、高齢者)

健康ボランティアの受け入れ

なし

サンプリング方法

非確率サンプル

調査対象母集団

選択されたすべての患者は、完全な病歴聴取を受けます(個人的、臨床的、関連する併存症、薬物摂取歴、およびサンプリング前の入院期間)。

※採取された検体は、速やかに医療微生物・免疫学研究室に移送されます。

説明

包含基準:

  • 腸球菌によって引き起こされる可能性のある感染症に罹患しているすべての患者。

除外基準:

  • 腸球菌以外の感染症に罹患しているすべての患者

研究計画

このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。

研究はどのように設計されていますか?

デザインの詳細

コホートと介入

グループ/コホート
介入・治療
腸球菌を含むサンプル

腸球菌の分離株は、グラム染色、コロニー形態、カタラーゼ試験、および胆汁エスクリン寒天上での増殖によって同定されます。 すべての分離株は、Vitek2 自動システムを使用して種レベルで識別されます。腸球菌として確認された菌株は、ミューラーヒントン寒天培地で修正されたカービー バウアーのディスク拡散法により、抗生物質感受性について検査されます。

腸球菌分離株のバイオフィルム形成活性は、腸球菌の抗生物質感受性プロファイルに対するナノ粒子の影響のマイクロタイター プレート技術の検出を使用してテストされます。 腸球菌を産生するバイオフィルムに対するナノ粒子の影響の検出。 PCRを用いた腸球菌の病原性因子遺伝子と抗生物質耐性遺伝子の分子同定

  • サンプルは、Medical Microbiology and Immunology Laboratory に輸送され、MacConkey 培地に接種されます。
  • ピンク色のコロニーは、胆汁エスクリン寒天培地に接種されます。
  • 腸球菌は寒天を黒くする
グラム染色による染色後、胆汁エスクリン寒天培地上で増殖するコロニーを顕微鏡で調べる。
  • カタラーゼ試験。
  • 耐塩試験
腸球菌の自動同定は、VITEK2 システムで行われます。
腸球菌として確認された菌株は、ミュラー・ヒントン寒天培地で修正カービー・バウアーのディスク拡散法により、抗生物質感受性について検査されます。
腸球菌の抗菌薬耐性パターンに対するナノ粒子の効果
腸球菌分離株のバイオフィルム形成活性は、マイクロタイタープレート技術を使用してテストされます
PCRを用いた腸球菌の病原性因子遺伝子と抗生物質耐性遺伝子の分子同定
腸球菌以外の細菌を含むサンプル
  • サンプルは、Medical Microbiology and Immunology Laboratory に輸送され、MacConkey 培地に接種されます。
  • ピンク色のコロニーは、胆汁エスクリン寒天培地に接種されます。
  • 腸球菌は寒天を黒くする
グラム染色による染色後、胆汁エスクリン寒天培地上で増殖するコロニーを顕微鏡で調べる。
  • カタラーゼ試験。
  • 耐塩試験
腸球菌の自動同定は、VITEK2 システムで行われます。

この研究は何を測定していますか?

主要な結果の測定

結果測定
メジャーの説明
時間枠
さまざまな臨床サンプルからの腸球菌の分離と同定
時間枠:2023年4月から2023年12月まで
さまざまな臨床サンプル (膿、尿、尿カテーテル サンプル、便、傷のスワブ、喀痰、中心静脈カテーテル サンプル) からの腸球菌の分離と同定は、Sohag 大学病院のさまざまな部門に入院した患者から無菌予防措置の下で収集されます。
2023年4月から2023年12月まで
腸球菌抗生物質感受性プロファイルの実証
時間枠:2023年4月から2023年12月まで
腸球菌として確認された菌株は、ミュラー・ヒントン寒天培地で修正カービー・バウアーのディスク拡散法により、抗生物質感受性について検査されます。
2023年4月から2023年12月まで
バイオフィルムを産生する腸球菌株の検出
時間枠:2023年4月から2023年12月まで
腸球菌分離株のバイオフィルム形成活性は、マイクロタイタープレート技術を使用してテストされます
2023年4月から2023年12月まで
腸球菌の抗菌薬耐性パターンに対するナノ粒子の効果の研究
時間枠:2023年4月から2023年12月まで
すべてのグループの阻害ゾーンを比較して、腸球菌の抗菌剤耐性パターンに対するナノ粒子の効果を検出します。
2023年4月から2023年12月まで
ナノ粒子が腸球菌のバイオフィルム産生能に及ぼす影響の研究
時間枠:2023年12月から2024年3月まで
腸球菌バイオフィルム産生能に対するナノ粒子の影響
2023年12月から2024年3月まで
腸球菌の遺伝子型の特徴付け。
時間枠:2023年12月から2024年3月まで
ポリメラーゼ連鎖反応を用いた腸球菌のいくつかの病原性因子遺伝子と抗生物質耐性遺伝子の分子同定。
2023年12月から2024年3月まで

協力者と研究者

ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。

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捜査官

  • スタディチェア:Mona F Mohamed, professor、Sohag University
  • スタディチェア:Wesam A Abu El wafa、Sohag University

出版物と役立つリンク

研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。

便利なリンク

研究記録日

これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。

主要日程の研究

研究開始 (実際)

2023年4月1日

一次修了 (予想される)

2023年12月31日

研究の完了 (予想される)

2024年3月30日

試験登録日

最初に提出

2023年2月20日

QC基準を満たした最初の提出物

2023年2月20日

最初の投稿 (実際)

2023年3月2日

学習記録の更新

投稿された最後の更新 (実際)

2023年4月19日

QC基準を満たした最後の更新が送信されました

2023年4月16日

最終確認日

2023年4月1日

詳しくは

本研究に関する用語

その他の研究ID番号

  • Soh-Med-23-02-10

個々の参加者データ (IPD) の計画

個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?

いいえ

医薬品およびデバイス情報、研究文書

米国FDA規制医薬品の研究

いいえ

米国FDA規制機器製品の研究

いいえ

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