Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Fenotypiske og genotypiske variasjoner av Enterococcus Sp

16. april 2023 oppdatert av: Mai Gamal Abdel Naser Abbas Khalifa, Sohag University

Fenotypiske og genotypiske variasjoner av Enterococcus Sp. Isolert fra pasienter med sykehuservervede infeksjoner i Sohag universitetssykehus, Egypt

Enterokokker er grampositive fakultative anaerobe kokker arrangert i korte og mellomstore kjeder. Enterokokker bor i mage-tarmkanalen og fungerer vanligvis commensalt med mennesker. De kan imidlertid forårsake flere infeksjoner, for eksempel urinveisinfeksjoner (UTI), intraabdominal infeksjon, bakteriemi eller endokarditt.

Blant mange identifiserte arter er E. faecalis og E. faecium de vanligste artene som kan forårsake infeksjon og utgjøre en trussel om antimikrobiell resistens, med E. faecalis som står for de fleste infeksjonene.

Studieoversikt

Detaljert beskrivelse

Enterokokker er grampositive fakultative anaerobe kokker arrangert i korte og mellomstore kjeder.

Enterokokker bor i mage-tarmkanalen og fungerer vanligvis commensalt med mennesker. De kan imidlertid forårsake flere infeksjoner, for eksempel urinveisinfeksjoner (UTI), intraabdominal infeksjon, bakteriemi eller endokarditt.

Blant mange identifiserte arter er E. faecalis og E. faecium de vanligste artene som kan forårsake infeksjon og utgjøre en trussel om antimikrobiell resistens, med E. faecalis som står for de fleste infeksjonene.

Patogene arter av enterokokker uttrykker mange virulensfaktorer som adhesiner, gelatinase, Enterococcus overflateprotein, aggregeringsstoffer og cytolysiner sammen med biofilmdannelse. Disse faktorene forbedrer patogenets evne til å invadere, feste seg og overleve gjennom tilegnelse av næringsstoffer i vertsvevet. Deres tilstedeværelse i medikamentresistente stammer øker alvorlighetsgraden av infeksjonen

Enterokokker er iboende resistente mot antibiotika som aminoglykosider og β-laktambaserte antibiotika. Moderat resistens mot aminoglykosider skyldes den iboende lave permeabiliteten til enterokokkcelleveggen for de store aminoglykosidmolekylene og er mer utbredt i E. faecium enn E. faecalis. Iboende β-laktamresistens skyldes overekspresjon av penicillinbindende proteiner med lav affinitet for β-laktamer, noe som gjør E. faecalis mer motstandsdyktig mot penicillin enn E. faecium

Dessuten kan enterokokker lett oppnå resistens mot antimikrobielle stoffer, og vankomycin-resistente enterokokker (VRE) er blant de prioriterte patogenene som det trengs nye antibiotika for.

I tillegg er biofilmdannelse en av strategiene for enterokokkene for å unngå vertens immunrespons og de hemmende eller drepende effektene av antibiotika.

Denne egenproduserte ekstracellulære matrisen gir også et passende mikromiljø for enterokokker å vokse og letter overføringen av mobile genetiske elementer (MGE) mellom bakterier. Enterokokkbiofilmer har vært implisert i infeksjoner relatert til inneliggende enheter som proteseklaffendokarditt, protetiske leddinfeksjoner og kateterrelaterte infeksjoner.

Biofilmdannende bakterier viser resistens mot mange antibiotika og immunrespons som resulterer i behandlingssvikt. Gitt vanskeligheten med å behandle og utrydde biofilmassosierte infeksjoner, er det et udekket behov for andre terapeutiske alternativer enn antibiotika for å forhindre biofilmdannelse.

Nanopartikler vekker oppmerksomhet på grunn av deres svært lille størrelse og ulike antibakterielle egenskaper. Nanopartikler kan samhandle med bakterier per arealenhet, noe som kan gjøre den antibakterielle aktiviteten til nanopartikler kraftigere. Nanopartikler kan også sette i gang flere bakteriedrepende veier, som å forstyrre bakteriemembranen og frigjøre intracellulære komponenter, noe som gjør det vanskelig for bakterier å bli resistente.

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Forventet)

100

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studer Kontakt Backup

Studiesteder

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

1 måned til 90 år (Barn, Voksen, Eldre voksen)

Tar imot friske frivillige

N/A

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Alle de utvalgte pasientene vil bli gjenstand for fullstendig anamnese (personlig, klinisk, assosierte komorbiditeter, historie med legemiddelinntak og lengde på sykehusopphold før prøvetaking).

* Innsamlede prøver vil bli fraktet til Forskningslaboratoriet for medisinsk mikrobiologi og immunologi så snart som mulig.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Alle pasienter som lider av infeksjoner som kan være forårsaket av enterokokker.

Ekskluderingskriterier:

  • Alle pasienter som lider av infeksjoner som ikke er forårsaket av enterokokker

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
prøver som inneholder enterokokker

Isolater av enterokokker vil bli identifisert ved Gram-farging, kolonimorfologi, katalasetest og vekst på Bile Esculin-agar. Alle isolater vil bli identifisert til artsnivå ved hjelp av Vitek2 automatisert system Stammer bekreftet som enterokokker vil bli undersøkt for deres antibiotikafølsomhet ved modifisert Kirby Bauers skivediffusjonsmetode på MuellerHinton Agar.

Biofilmdannelsesaktiviteten til Enterokokker-isolater vil bli testet ved hjelp av mikrotiterplateteknikken. Påvisning av effekten av nanopartikler på antibiotikafølsomhetsprofilen til Enterokokker. Påvisning av effekten av nanopartikler på biofilmen som produserer Enterokokker. Molekylær identifikasjon av noen virulensfaktorgener og antibiotikaresistensgener fra enterokokker ved bruk av PCR

  • Prøver vil bli transportert til medisinsk mikrobiologi og immunologisk laboratorium og vil bli inokulert på MacConkey-medium.
  • Rosa kolonier vil bli inokulert på galle esculin agar medium.
  • Enterokokker produserer sverting av agaren
De voksende koloniene på galle esculin agar medium vil bli undersøkt mikroskopisk etter farging med Gram farging.
  • Katalase test.
  • Salttoleransetest
Automatisk identifikasjon av Enterokokker vil bli gjort med VITEK2-systemet.
Stammer bekreftet som Enterokokker vil bli undersøkt for deres antibiotikafølsomhet ved modifisert Kirby Bauers skivediffusjonsmetode på Mueller-Hinton-agar.
Effekten av nanopartikler på Enterokokkers antimikrobielle resistensmønster
Biofilmdannelsesaktiviteten til Enterokokk-isolater vil bli testet ved bruk av mikrotiterplateteknikken
Molekylær identifikasjon av noen virulensfaktorgener og antibiotikaresistensgener fra enterokokker ved bruk av PCR
prøver med andre bakterier enn enterokokker
  • Prøver vil bli transportert til medisinsk mikrobiologi og immunologisk laboratorium og vil bli inokulert på MacConkey-medium.
  • Rosa kolonier vil bli inokulert på galle esculin agar medium.
  • Enterokokker produserer sverting av agaren
De voksende koloniene på galle esculin agar medium vil bli undersøkt mikroskopisk etter farging med Gram farging.
  • Katalase test.
  • Salttoleransetest
Automatisk identifikasjon av Enterokokker vil bli gjort med VITEK2-systemet.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Isolering og identifikasjon av enterokokker fra ulike kliniske prøver
Tidsramme: fra april 2023 til desember 2023
Isolering og identifisering av enterokokker fra ulike kliniske prøver (puss, urin, urinkateterprøver, avføring, sårprøver, sputum, sentrale venekateterprøver) vil bli samlet inn under aseptiske forholdsregler fra pasienter innlagt ved ulike avdelinger ved Sohag universitetssykehus.
fra april 2023 til desember 2023
Demonstrasjon av Enterokokkers antibiotikafølsomhetsprofil
Tidsramme: fra april 2023 til desember 2023
Stammer bekreftet som Enterokokker vil bli undersøkt for deres antibiotikafølsomhet ved modifisert Kirby Bauers skivediffusjonsmetode på Mueller-Hinton-agar.
fra april 2023 til desember 2023
Påvisning av stammer av enterokokker som produserer biofilm
Tidsramme: fra april 2023 til desember 2023
Biofilmdannelsesaktiviteten til Enterokokk-isolater vil bli testet ved bruk av mikrotiterplateteknikken
fra april 2023 til desember 2023
Studerer effekten av nanopartikler på Enterokokkers antimikrobielle resistensmønster
Tidsramme: fra april 2023 til desember 2023
Inhiberingssoner for alle grupper vil bli sammenlignet for å oppdage effekten av nanopartikler på Enterokokkers antimikrobielle resistensmønster.
fra april 2023 til desember 2023
Studerer effekten av nanopartikler på Enterokokkers biofilmproduserende evne
Tidsramme: fra desember 2023 til mars 2024
Effekten av nanopartikler på Enterokokkers biofilmproduserende evne
fra desember 2023 til mars 2024
Genotypisk karakterisering av enterokokker.
Tidsramme: fra desember 2023 til mars 2024
Molekylær identifikasjon av noen virulensfaktorgener og antibiotikaresistensgener fra Enterokokker ved bruk av polymerasekjedereaksjon.
fra desember 2023 til mars 2024

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Etterforskere

  • Studiestol: Mona F Mohamed, professor, Sohag University
  • Studiestol: Wesam A Abu El wafa, Sohag University

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Hjelpsomme linker

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

1. april 2023

Primær fullføring (Forventet)

31. desember 2023

Studiet fullført (Forventet)

30. mars 2024

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

20. februar 2023

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

20. februar 2023

Først lagt ut (Faktiske)

2. mars 2023

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

19. april 2023

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

16. april 2023

Sist bekreftet

1. april 2023

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Andre studie-ID-numre

  • Soh-Med-23-02-10

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

NEI

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere