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Variations phénotypiques et génotypiques d'Enterococcus Spp

16 avril 2023 mis à jour par: Mai Gamal Abdel Naser Abbas Khalifa, Sohag University

Variations phénotypiques et génotypiques d'Enterococcus Spp. Isolé des patients atteints d'infections nosocomiales dans les hôpitaux universitaires de Sohag, en Égypte

Les entérocoques sont des coques anaérobies facultatifs à Gram positif disposés en chaînes courtes et moyennes. Les entérocoques résident dans le tractus gastro-intestinal et fonctionnent généralement de manière commensale avec les humains. Ils peuvent cependant provoquer plusieurs infections, telles que des infections des voies urinaires (IVU), une infection intra-abdominale, une bactériémie ou une endocardite.

Parmi les nombreuses espèces identifiées, E. faecalis et E. faecium sont les espèces les plus courantes capables de provoquer une infection et de constituer une menace de résistance aux antimicrobiens, E. faecalis représentant la majorité des infections.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

Les entérocoques sont des coques anaérobies facultatifs à Gram positif disposés en chaînes courtes et moyennes.

Les entérocoques résident dans le tractus gastro-intestinal et fonctionnent généralement de manière commensale avec les humains. Ils peuvent cependant provoquer plusieurs infections, telles que des infections des voies urinaires (IVU), une infection intra-abdominale, une bactériémie ou une endocardite.

Parmi les nombreuses espèces identifiées, E. faecalis et E. faecium sont les espèces les plus courantes capables de provoquer une infection et de constituer une menace de résistance aux antimicrobiens, E. faecalis représentant la majorité des infections.

Les espèces pathogènes d'entérocoques expriment de nombreux facteurs de virulence tels que les adhésines, la gélatinase, la protéine de surface d'Enterococcus, les substances d'agrégation et les cytolysines ainsi que la formation de biofilm. Ces facteurs améliorent la capacité de l'agent pathogène à envahir, à s'attacher et à survivre grâce à l'acquisition de nutriments dans les tissus de l'hôte. Leur présence dans des souches résistantes aux médicaments augmente la sévérité de l'infection

Les entérocoques sont intrinsèquement résistants aux antibiotiques tels que les aminoglycosides et les antibiotiques à base de β-lactamines. Une résistance modérée aux aminoglycosides est due à la faible perméabilité intrinsèque de la paroi cellulaire des entérocoques aux grandes molécules d'aminoglycosides et est plus répandue chez E. faecium que E. faecalis. La résistance intrinsèque aux β-lactamines est due à la surexpression de protéines de liaison à la pénicilline ayant une faible affinité pour les β-lactamines, ce qui rend E. faecalis plus résistant à la pénicilline qu'E. faecium

De plus, les entérocoques peuvent facilement acquérir une résistance aux antimicrobiens, et les entérocoques résistants à la vancomycine (ERV) font partie des pathogènes prioritaires pour lesquels de nouveaux antibiotiques sont nécessaires.

De plus, la formation de biofilms est l'une des stratégies permettant aux entérocoques d'échapper à la réponse immunitaire de l'hôte et aux effets inhibiteurs ou destructeurs des antibiotiques.

Cette matrice extracellulaire auto-produite fournit également un microenvironnement propice à la croissance des entérocoques et facilite la transmission des éléments génétiques mobiles (MGE) entre les bactéries. Les biofilms d'entérocoques ont été impliqués dans des infections liées aux dispositifs à demeure telles que l'endocardite de la valve prothétique, les infections des prothèses articulaires et les infections liées aux cathéters.

Les bactéries formant un biofilm présentent une résistance à de nombreux antibiotiques et une réponse immunitaire qui entraîne l'échec du traitement. Compte tenu de la difficulté de traiter et d'éradiquer les infections associées au biofilm, il existe un besoin non satisfait d'options thérapeutiques autres que les antibiotiques pour prévenir la formation de biofilm.

Les nanoparticules retiennent l'attention compte tenu de leur très petite taille et de leurs diverses propriétés antibactériennes. Les nanoparticules peuvent interagir avec les bactéries par unité de surface, ce qui peut rendre l'activité antibactérienne des nanoparticules plus puissante. Les nanoparticules peuvent également initier plusieurs voies bactéricides, telles que la perturbation de la membrane bactérienne et la libération de composants intracellulaires, ce qui rend difficile la résistance des bactéries.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Anticipé)

100

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Coordonnées de l'étude

Sauvegarde des contacts de l'étude

Lieux d'étude

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

1 mois à 90 ans (Enfant, Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

N/A

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Tous les patients sélectionnés feront l'objet d'une anamnèse complète (individuelle, clinique, comorbidités associées, antécédent de prise médicamenteuse et durée d'hospitalisation avant prélèvement).

* Les échantillons prélevés seront acheminés au laboratoire de recherche en microbiologie médicale et immunologie dans les plus brefs délais.

La description

Critère d'intégration:

  • Tous les patients souffrant d'infections pouvant être causées par des entérocoques.

Critère d'exclusion:

  • Tous les patients souffrant d'infections non causées par des entérocoques

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Intervention / Traitement
échantillons contenant des entérocoques

Les isolats d'entérocoques seront identifiés par coloration de Gram, morphologie des colonies, test de catalase et croissance sur gélose Bile Esculin. Tous les isolats seront identifiés au niveau de l'espèce à l'aide du système automatisé Vitek2. Les souches confirmées comme entérocoques seront examinées pour leur sensibilité aux antibiotiques par la méthode de diffusion sur disque de Kirby Bauer modifiée sur MuellerHinton Agar.

L'activité de formation de biofilm des isolats d'entérocoques sera testée à l'aide de la technique de la plaque de microtitration. Détection de l'effet des nanoparticules sur le profil de sensibilité aux antibiotiques des entérocoques. Détection de l'effet des nanoparticules sur le biofilm producteur d'entérocoques. Identification moléculaire de certains gènes facteurs de virulence et gènes de résistance aux antibiotiques des entérocoques par PCR

  • Les échantillons seront transportés au laboratoire de microbiologie médicale et d'immunologie et seront ensemencés sur milieu MacConkey.
  • Les colonies roses seront inoculées sur un milieu gélosé à la bile et à l'esculine.
  • Les entérocoques produisent un noircissement de la gélose
Les colonies en croissance sur milieu bile esculine agar seront examinées au microscope après coloration par coloration de Gram.
  • Essai de catalase.
  • Test de tolérance au sel
L'identification automatisée des entérocoques sera effectuée avec le système VITEK2.
Les souches confirmées comme entérocoques seront examinées pour leur sensibilité aux antibiotiques par la méthode de diffusion de disque de Kirby Bauer modifiée sur Mueller-Hinton Agar.
L'effet des nanoparticules sur le schéma de résistance aux antimicrobiens des entérocoques
L'activité de formation de biofilm des isolats d'entérocoques sera testée à l'aide de la technique de la plaque de microtitration
Identification moléculaire de certains gènes facteurs de virulence et gènes de résistance aux antibiotiques des entérocoques par PCR
échantillons contenant des bactéries autres que les entérocoques
  • Les échantillons seront transportés au laboratoire de microbiologie médicale et d'immunologie et seront ensemencés sur milieu MacConkey.
  • Les colonies roses seront inoculées sur un milieu gélosé à la bile et à l'esculine.
  • Les entérocoques produisent un noircissement de la gélose
Les colonies en croissance sur milieu bile esculine agar seront examinées au microscope après coloration par coloration de Gram.
  • Essai de catalase.
  • Test de tolérance au sel
L'identification automatisée des entérocoques sera effectuée avec le système VITEK2.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Isolement et identification des entérocoques à partir de différents échantillons cliniques
Délai: d'avril 2023 à décembre 2023
L'isolement et l'identification des entérocoques à partir de différents échantillons cliniques (pus, urine, échantillons de cathéter urinaire, selles, écouvillons de plaies, crachats, échantillons de cathéter veineux central) seront collectés sous des précautions aseptiques auprès de patients admis dans différents services des hôpitaux universitaires Sohag.
d'avril 2023 à décembre 2023
Démonstration du profil de sensibilité aux antibiotiques des entérocoques
Délai: d'avril 2023 à décembre 2023
Les souches confirmées comme entérocoques seront examinées pour leur sensibilité aux antibiotiques par la méthode de diffusion de disque de Kirby Bauer modifiée sur Mueller-Hinton Agar.
d'avril 2023 à décembre 2023
Détection de souches d'entérocoques produisant un biofilm
Délai: d'avril 2023 à décembre 2023
L'activité de formation de biofilm des isolats d'entérocoques sera testée à l'aide de la technique de la plaque de microtitration
d'avril 2023 à décembre 2023
Étudier l'effet des nanoparticules sur le schéma de résistance antimicrobienne des entérocoques
Délai: d'avril 2023 à décembre 2023
Les zones d'inhibition de tous les groupes seront comparées pour détecter l'effet des nanoparticules sur le schéma de résistance antimicrobienne des entérocoques.
d'avril 2023 à décembre 2023
Étudier l'effet des nanoparticules sur la capacité de production de biofilm d'entérocoques
Délai: de décembre 2023 à mars 2024
L'effet des nanoparticules sur la capacité de production de biofilm d'entérocoques
de décembre 2023 à mars 2024
Caractérisation génotypique des entérocoques.
Délai: de décembre 2023 à mars 2024
Identification moléculaire de certains gènes de facteurs de virulence et de gènes de résistance aux antibiotiques des entérocoques par réaction en chaîne par polymérase.
de décembre 2023 à mars 2024

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Les enquêteurs

  • Chaise d'étude: Mona F Mohamed, professor, Sohag University
  • Chaise d'étude: Wesam A Abu El wafa, Sohag University

Publications et liens utiles

La personne responsable de la saisie des informations sur l'étude fournit volontairement ces publications. Il peut s'agir de tout ce qui concerne l'étude.

Liens utiles

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

1 avril 2023

Achèvement primaire (Anticipé)

31 décembre 2023

Achèvement de l'étude (Anticipé)

30 mars 2024

Dates d'inscription aux études

Première soumission

20 février 2023

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

20 février 2023

Première publication (Réel)

2 mars 2023

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

19 avril 2023

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

16 avril 2023

Dernière vérification

1 avril 2023

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Autres numéros d'identification d'étude

  • Soh-Med-23-02-10

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

NON

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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