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Variazioni fenotipiche e genotipiche di Enterococcus Spp

16 aprile 2023 aggiornato da: Mai Gamal Abdel Naser Abbas Khalifa, Sohag University

Variazioni fenotipiche e genotipiche di Enterococcus Spp. Isolato da pazienti con infezioni acquisite in ospedale negli ospedali universitari di Sohag, in Egitto

Gli enterococchi sono cocchi anaerobi facoltativi Gram-positivi disposti in catene corte e medie. Gli enterococchi risiedono nel tratto gastrointestinale e di solito funzionano in modo commensale con gli esseri umani. Possono, tuttavia, causare diverse infezioni, come infezioni del tratto urinario (UTI), infezioni intra-addominali, batteriemia o endocardite.

Tra le molte specie identificate, E. faecalis ed E. faecium sono le specie più comuni in grado di causare infezioni e rappresentano una minaccia di resistenza antimicrobica, con E. faecalis che rappresenta la maggior parte delle infezioni.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

Gli enterococchi sono cocchi anaerobi facoltativi Gram-positivi disposti in catene corte e medie.

Gli enterococchi risiedono nel tratto gastrointestinale e di solito funzionano in modo commensale con gli esseri umani. Possono, tuttavia, causare diverse infezioni, come infezioni del tratto urinario (UTI), infezioni intra-addominali, batteriemia o endocardite.

Tra le molte specie identificate, E. faecalis ed E. faecium sono le specie più comuni in grado di causare infezioni e rappresentano una minaccia di resistenza antimicrobica, con E. faecalis che rappresenta la maggior parte delle infezioni.

Le specie patogene di enterococchi esprimono molti fattori di virulenza come adesine, gelatinasi, proteine ​​di superficie di Enterococcus, sostanze di aggregazione e citolisine insieme alla formazione di biofilm. Questi fattori migliorano la capacità dell'agente patogeno di invadere, attaccare e sopravvivere attraverso l'acquisizione di nutrienti nel tessuto ospite. La loro presenza in ceppi resistenti ai farmaci aumenta la gravità dell'infezione

Gli enterococchi sono intrinsecamente resistenti agli antibiotici come gli aminoglicosidi e gli antibiotici a base di β-lattamici. La moderata resistenza agli aminoglicosidi è dovuta alla bassa permeabilità intrinseca della parete cellulare degli enterococchi alle grandi molecole di aminoglicosidi ed è più prevalente in E. faecium che in E. faecalis. La resistenza intrinseca ai β-lattamici è dovuta alla sovraespressione delle proteine ​​leganti la penicillina con bassa affinità per i β-lattamici, che rende E. faecalis più resistente alla penicillina rispetto a E. faecium

Inoltre, gli enterococchi possono facilmente acquisire resistenza agli antimicrobici e gli enterococchi resistenti alla vancomicina (VRE) sono tra i patogeni prioritari per i quali sono necessari nuovi antibiotici.

Inoltre, la formazione di biofilm è una delle strategie con cui gli enterococchi eludono la risposta immunitaria dell'ospite e gli effetti inibitori o letali degli antibiotici.

Questa matrice extracellulare autoprodotta fornisce anche un microambiente adatto alla crescita degli enterococchi e facilita la trasmissione di elementi genetici mobili (MGE) tra i batteri. I biofilm enterococcici sono stati implicati nelle infezioni permanenti correlate al dispositivo come l'endocardite della valvola protesica, le infezioni articolari protesiche e le infezioni correlate al catetere.

I batteri che formano il biofilm mostrano resistenza a molti antibiotici e risposta immunitaria che si traduce in un fallimento del trattamento. Data la difficoltà di trattare ed eradicare le infezioni associate al biofilm, vi è un bisogno insoddisfatto di opzioni terapeutiche diverse dagli antibiotici per prevenire la formazione di biofilm.

Le nanoparticelle stanno attirando l'attenzione date le loro dimensioni molto ridotte e le varie proprietà antibatteriche. Le nanoparticelle possono interagire con i batteri per unità di area, il che può rendere più potente l'attività antibatterica delle nanoparticelle. Le nanoparticelle possono anche avviare diversi percorsi battericidi, come l'interruzione della membrana batterica e il rilascio di componenti intracellulari, rendendo difficile la resistenza dei batteri.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Anticipato)

100

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

Luoghi di studio

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 1 mese a 90 anni (Bambino, Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

N/A

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

Tutti i pazienti selezionati saranno sottoposti all'anamnesi completa (personale, clinica, comorbidità associate, anamnesi di assunzione di farmaci e durata della degenza ospedaliera prima del campionamento).

* I campioni raccolti saranno trasportati al laboratorio di ricerca di microbiologia medica e immunologia il prima possibile.

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Tutti i pazienti affetti da infezioni che possono essere causate da Enterococchi.

Criteri di esclusione:

  • Tutti i pazienti affetti da infezioni non causate da Enterococchi

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
campioni contenenti Enterococchi

Gli isolati di Enterococchi saranno identificati mediante colorazione di Gram, morfologia delle colonie, test della catalasi e crescita su Bile Esculin agar. Tutti gli isolati saranno identificati a livello di specie utilizzando il sistema automatizzato Vitek2. I ceppi confermati come Enterococchi saranno esaminati per la loro suscettibilità agli antibiotici mediante il metodo di diffusione del disco di Kirby Bauer modificato su MuellerHinton Agar.

L'attività di formazione del biofilm degli isolati di Enterococchi sarà testata utilizzando la tecnica della micropiastra Rilevazione dell'effetto delle nanoparticelle sul profilo di suscettibilità agli antibiotici degli Enterococchi. Rilevazione dell'effetto delle nanoparticelle sul biofilm che produce Enterococchi. Identificazione molecolare di alcuni geni di fattori di virulenza e geni di resistenza agli antibiotici di Enterococchi mediante PCR

  • I campioni saranno trasportati al Laboratorio di Microbiologia Medica e Immunologia e saranno inoculati su terreno MacConkey.
  • Le colonie rosa saranno inoculate su terreno bile esculin agar.
  • Gli enterococchi producono l'annerimento dell'agar
Le colonie in crescita su terreno bile esculina agar saranno esaminate al microscopio dopo colorazione con colorazione di Gram.
  • Prova della catalasi.
  • Test di tolleranza al sale
L'identificazione automatica degli Enterococchi sarà effettuata con il sistema VITEK2.
I ceppi confermati come Enterococchi saranno esaminati per la loro suscettibilità agli antibiotici mediante il metodo di diffusione del disco di Kirby Bauer modificato su Mueller-Hinton Agar.
L'effetto delle nanoparticelle sul modello di resistenza antimicrobica degli Enterococchi
L'attività di formazione del biofilm degli isolati di Enterococchi sarà testata utilizzando la tecnica della micropiastra
Identificazione molecolare di alcuni geni di fattori di virulenza e geni di resistenza agli antibiotici di Enterococchi mediante PCR
campioni con batteri diversi dagli enterococchi
  • I campioni saranno trasportati al Laboratorio di Microbiologia Medica e Immunologia e saranno inoculati su terreno MacConkey.
  • Le colonie rosa saranno inoculate su terreno bile esculin agar.
  • Gli enterococchi producono l'annerimento dell'agar
Le colonie in crescita su terreno bile esculina agar saranno esaminate al microscopio dopo colorazione con colorazione di Gram.
  • Prova della catalasi.
  • Test di tolleranza al sale
L'identificazione automatica degli Enterococchi sarà effettuata con il sistema VITEK2.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Isolamento e identificazione di Enterococchi da diversi campioni clinici
Lasso di tempo: da aprile 2023 a dicembre 2023
L'isolamento e l'identificazione di Enterococchi da diversi campioni clinici (pus, urina, campioni di catetere urinario, feci, tamponi di ferite, espettorato, campioni di catetere venoso centrale) saranno raccolti con precauzioni asettiche da pazienti ricoverati in diversi dipartimenti degli ospedali universitari di Sohag.
da aprile 2023 a dicembre 2023
Dimostrazione del profilo di suscettibilità agli antibiotici di Enterococchi
Lasso di tempo: da aprile 2023 a dicembre 2023
I ceppi confermati come Enterococchi saranno esaminati per la loro suscettibilità agli antibiotici mediante il metodo di diffusione del disco di Kirby Bauer modificato su Mueller-Hinton Agar.
da aprile 2023 a dicembre 2023
Rilevazione di ceppi di Enterococchi che producono biofilm
Lasso di tempo: da aprile 2023 a dicembre 2023
L'attività di formazione del biofilm degli isolati di Enterococchi sarà testata utilizzando la tecnica della micropiastra
da aprile 2023 a dicembre 2023
Studio dell'effetto delle nanoparticelle sul modello di resistenza antimicrobica degli Enterococchi
Lasso di tempo: da aprile 2023 a dicembre 2023
Le zone di inibizione di tutti i gruppi saranno confrontate per rilevare l'effetto delle nanoparticelle sul pattern di resistenza antimicrobica degli Enterococchi.
da aprile 2023 a dicembre 2023
Studio dell'effetto delle nanoparticelle sulla capacità di produrre biofilm di Enterococchi
Lasso di tempo: da dicembre 2023 a marzo 2024
L'effetto delle nanoparticelle sulla capacità di produrre biofilm di Enterococchi
da dicembre 2023 a marzo 2024
Caratterizzazione genotipica degli Enterococchi.
Lasso di tempo: da dicembre 2023 a marzo 2024
Identificazione molecolare di alcuni geni di fattori di virulenza e geni di resistenza agli antibiotici di Enterococchi mediante reazione a catena della polimerasi.
da dicembre 2023 a marzo 2024

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Cattedra di studio: Mona F Mohamed, professor, Sohag University
  • Cattedra di studio: Wesam A Abu El wafa, Sohag University

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Collegamenti utili

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

1 aprile 2023

Completamento primario (Anticipato)

31 dicembre 2023

Completamento dello studio (Anticipato)

30 marzo 2024

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

20 febbraio 2023

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

20 febbraio 2023

Primo Inserito (Effettivo)

2 marzo 2023

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

19 aprile 2023

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

16 aprile 2023

Ultimo verificato

1 aprile 2023

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Altri numeri di identificazione dello studio

  • Soh-Med-23-02-10

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

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