Biomarkers in DNA Samples From Patients With High-Risk Acute Lymphoblastic Leukemia
Identifying Rare Genetic Variants Involved in High Risk Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) Via Pooled DNA Sequencing
RATIONALE: Studying samples of blood or tumor tissue from patients with cancer in the laboratory may help doctors learn more about changes that occur in DNA and identify biomarkers related to cancer.
PURPOSE: This research study is studying biomarkers in DNA samples from patients with newly diagnosed high-risk acute lymphoblastic leukemia.
연구 개요
상태
정황
상세 설명
OBJECTIVES:
- To perform pooled DNA sequencing in 56 genes from the genomic DNA of unaffected children and matched non-tumor and blast DNA from patients with high-risk (HR) acute lymphoblastic leukemia (ALL) enrolled on COG HR ALL protocols.
- To identify loci enriched for genetic variation between DNA of unaffected children and DNA of these patients.
- To individually validate novel, putatively functional single nucleotide polymorphisms (SNPs) identified via pooled sequencing with another genotyping platform.
- To correlate HR ALL with clinical phenotypes, co-morbidities, toxicities, outcomes to the genes or pathways found to harbor a significant increase in genetic variation.
OUTLINE: DNA specimens from unaffected children (pool 1) and from patients with non-tumor (pool 2) and leukemia blasts (pool 3) are analyzed for genetic pathophysiology of pre-B acute lymphoblastic leukemia by microarray and PCR assays. Sequencing is performed on each of the 3 PCR pools of DNA.
연구 유형
등록 (예상)
참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
연구 대상 성별
샘플링 방법
연구 인구
설명
DISEASE CHARACTERISTICS:
Newly diagnosed with high-risk B-precursor acute lymphoblastic leukemia
- Matched patients non-tumor and blast DNA samples
- Enrolled on COG-P9906 or COG-AALL0232 protocols
- Cohort of random pediatric DNA samples extracted from newborn infants' blood spots from the State of Missouri
PATIENT CHARACTERISTICS:
- Newborn infants from the state of Missouri
PRIOR CONCURRENT THERAPY:
- Not specified
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
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Identification of loci enriched for genetic variation suggestive of pre-B leukemogenesis
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Correlation between high-risk acute lymphoblastic leukemia with clinical phenotypes, co-morbidities, toxicities, outcomes to the genes or pathways found to harbor a significant increase in genetic variation
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Todd E. Druley, MD, St. Louis Children's Hospital
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작
기본 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (추정)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (추정)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- AALL10B2
- COG-AALL10B2 (기타 식별자: Children's Oncology Group)
- CDR0000672526 (기타 식별자: Clinicaltrials.gov)
- NCI-2011-02232 (레지스트리 식별자: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
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