CGH 어레이에 의한 복막 중피종의 게놈 분석
2016년 7월 25일 업데이트: Hospices Civils de Lyon
복막 중피종은 전체 중피종의 1/3을 차지하는 희귀 질환으로 이 질환의 분자적 특성에 대해서는 알려진 바가 없습니다.
주요 암으로서 유전적 이질성이 있을 가능성이 있다.
이 게놈 프로파일링은 이 희귀 질환의 치료에 사용할 수 있는 바이오마커를 발견하기 위해 비교 게놈 하이브리드화(CGH) 어레이, BAP1 시퀀싱 및 유전자 발현을 연관시킵니다.
모든 임상 데이터를 사용할 수 있는 해당 조직병리학적 및 면역조직화학적 보고서.
다음 조사에 집중할 몇 가지 관심 유전자에 밑줄을 긋기 위해 모든 데이터가 병합됩니다.
우리의 예비 결과에 따라 흉막 중피종에서도 기술된 바와 같이 BAP1 돌연변이가 예상됩니다.
특정 치료법의 표적이 될 수 있는 발암 인자의 돌연변이는 예후가 나쁜 이 희귀 질환의 관리에 특히 관심을 가질 것입니다.
연구 개요
연구 유형
관찰
등록 (실제)
33
참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
18년 이상 (성인, 고령자)
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
아니
연구 대상 성별
모두
샘플링 방법
확률 샘플
연구 인구
복막 중피종 진단을 받은 환자
설명
포함 기준:
- 냉동 샘플을 사용한 복막 종양의 외과적 생검
- 나이 > 18세
제외 기준:
- 복막 중피종의 부재
- 냉동 샘플의 부재
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 보병대
- 시간 관점: 회고전
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
|---|---|
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복막 중피종 표본
이 그룹은 수술 후 복막 중피종 진단을 받은 환자만 보유하고 있습니다. 모든 환자가 이 그룹에 포함됩니다. CGH 어레이는 냉동 샘플에서 실현됩니다(비교 게놈 분석용). |
DNA 및 RNA 추출은 Lyon University 병원(genomic platform)에서 상용 키트를 사용하여 수행됩니다.
종양 세포의 백분율은 추출하기 전에 염색된 섹션에 의해 제어됩니다.
CGH 어레이는 Lille(게놈 플랫폼)의 냉동 샘플에서 실현될 것입니다.
Pangenomic Agilent 어레이가 사용됩니다.
마이크로 어레이에는 180000개의 프로브가 포함됩니다.
분석은 Marie Brevet과 함께 Lille(게놈 플랫폼/생물 정보학 부서)에서 수행됩니다.
데이터는 log2 변환된 데이터에서 WACA 방법으로 정규화로 처리됩니다.
그런 다음 Circular Binary Segmentation으로 복제 수 변이를 식별합니다.
복제 수 변이는 log2 비율 분포 및 종양 세포의 백분율에 따라 획득 또는 결실로 불릴 것입니다.
일치하는 종양 및 정상 DNA를 사용하면 복제 수 다형성이 제거됩니다.
우리는 복사 수 변이에 기초한 복막 중피종의 분류를 연구하기 위해 감독되지 않은 계층적 분석을 구성할 것입니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
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BAP1 돌연변이
기간: 0일
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CGH 어레이
|
0일
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작
2013년 5월 1일
기본 완료 (실제)
2016년 1월 1일
연구 완료 (실제)
2016년 1월 1일
연구 등록 날짜
최초 제출
2016년 4월 27일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2016년 7월 12일
처음 게시됨 (추정)
2016년 7월 15일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (추정)
2016년 7월 26일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2016년 7월 25일
마지막으로 확인됨
2016년 7월 1일
추가 정보
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