Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

Peritoneaalisen mesoteliooman genominen analyysi CGH Arraysin avulla

maanantai 25. heinäkuuta 2016 päivittänyt: Hospices Civils de Lyon
Peritoneaalinen mesoteliooma on harvinainen sairaus, joka edustaa kolmannesta kaikesta mesotelioomasta, eikä tämän taudin molekyyliominaisuuksista tiedetä mitään. Pääsyöpinä geneettinen heterogeenisyys on todennäköistä. Tämä genominen profilointi yhdistää Comparative Genomic Hybridization (CGH) -järjestelmän, BAP1-sekvensoinnin ja geeniekspression biomarkkerin löytämiseksi, jota voitaisiin käyttää tämän harvinaisen sairauden hoidossa. Vastaava histopatologinen ja immunohistokemiallinen raportti, koska kaikki kliiniset tiedot ovat saatavilla. Kaikki tiedot yhdistetään alleviivatakseen muutamia kiinnostavia geenejä, joihin keskitymme seuraavissa tutkimuksissamme. Alustavista tuloksistamme riippuen BAP1-mutaatioita odotetaan, kuten myös keuhkopussin mesotelioomassa kuvattiin. Onkogeenisten tekijöiden mutaatiot, joihin spesifinen hoito voi kohdistua, ovat erityisen kiinnostuneita tämän harvinaisen sairauden, jonka ennuste on huono, hoidossa.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Valmis

Ehdot

Interventio / Hoito

Opintotyyppi

Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Todellinen)

33

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Opintokelpoiset iät

18 vuotta ja vanhemmat (Aikuinen, Vanhempi Aikuinen)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Potilaat, joilla on diagnosoitu peritoneaalinen mesoteliooma

Kuvaus

Sisällyttämiskriteerit:

  • vatsakalvon kasvaimen kirurginen biopsia jäädytetyillä näytteillä
  • ikä > 18 vuotta vanha

Poissulkemiskriteerit:

  • peritoneaalisen mesoteliooman puuttuminen
  • jäädytettyjen näytteiden puuttuminen

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

  • Havaintomallit: Kohortti
  • Aikanäkymät: Takautuva

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti
Interventio / Hoito
Peritoneaaliset mesotelioomanäytteet

Ryhmään kuuluu vain potilaita, joille diagnosoitiin peritoneaalinen mesoteliooma leikkauksen jälkeen. Kaikki potilaat kuuluvat tähän ryhmään.

CGH-sarjat toteutetaan jäädytetyillä näytteillä (vertailevaa genomianalyysiä varten).
Geneettinen: vertaileva genomianalyysi
DNA- ja RNA-uutto suoritetaan Lyonin yliopistollisessa sairaalassa (genominen alusta) kaupallisesti saatavalla pakkauksella. Kasvainsolujen prosenttiosuutta kontrolloidaan värjätyllä leikkeellä ennen uuttamista. CGH-ryhmät toteutetaan jäädytetyillä näytteillä Lillessä (genominen alusta). Pangenomic Agilent -taulukkoa käytetään. Mikroryhmä sisältää 180 000 koetinta. Analyysi suoritetaan Lillessä (genominen alusta / BioInformatiikan osasto) Marie Brevetin kanssa. Tiedot käsitellään log2-muunnetusta tiedosta normalisointiin WACA-menetelmällä. Sitten kopioluvun vaihtelu tunnistetaan Circular Binary Segmentation -toiminnolla. Kopioiden lukumäärän muunnelmia kutsutaan vahvistuksiksi tai deleetioiksi log2-suhdejakauman ja kasvainsolujen prosenttiosuuden mukaan. Vastaavan kasvaimen ja normaalin DNA:n käyttö eliminoi kopionumeropolymorfismit. Rakennamme valvomattomia hierarkkisia analyyseja tutkiaksemme vatsakalvon mesoteliooman luokittelua kopiomäärän vaihtelun perusteella

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Tulosmittaus
Toimenpiteen kuvaus
Aikaikkuna
BAP1-mutaatiot
Aikaikkuna: Päivä 0
CGH-taulukko
Päivä 0

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

Hospices Civils de Lyon

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus

Keskiviikko 1. toukokuuta 2013

Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)

Perjantai 1. tammikuuta 2016

Opintojen valmistuminen (Todellinen)

Perjantai 1. tammikuuta 2016

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Keskiviikko 27. huhtikuuta 2016

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Tiistai 12. heinäkuuta 2016

Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)

Perjantai 15. heinäkuuta 2016

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (Arvio)

Tiistai 26. heinäkuuta 2016

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Maanantai 25. heinäkuuta 2016

Viimeksi vahvistettu

Perjantai 1. heinäkuuta 2016

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Avainsanat

Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja

Muut tutkimustunnusnumerot

  • D50828

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Tilaa