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Analisi genomica del mesotelioma peritoneale mediante array CGH

25 luglio 2016 aggiornato da: Hospices Civils de Lyon
Il mesotelioma peritoneale è una malattia rara che rappresenta un terzo di tutti i mesoteliomi e non si sa nulla delle caratteristiche molecolari di questa malattia. Come tumori principali, è probabile l'eterogeneità genetica. Questa profilazione genomica associa l'array di ibridazione genomica comparativa (CGH), il sequenziamento di BAP1 e l'espressione genica per scoprire un biomarcatore che potrebbe essere utilizzato nel trattamento di questa malattia rara. Rapporto istopatologico e immunoistochimico corrispondente in quanto sono disponibili tutti i dati clinici. Tutti i dati verranno uniti per evidenziare alcuni geni di interesse sui quali concentreremo le nostre prossime indagini. In base ai nostri risultati preliminari, sono attese mutazioni in BAP1, come descritto anche nel mesotelioma pleurico. Le mutazioni nei driver oncogeni che potrebbero essere presi di mira da una terapia specifica saranno di particolare interesse nella gestione di questa malattia rara con prognosi infausta.

Panoramica dello studio

Stato

Completato

Condizioni

Intervento / Trattamento

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Effettivo)

33

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

18 anni e precedenti (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

No

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione di probabilità

Popolazione di studio

Pazienti con diagnosi di mesotelioma peritoneale

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • biopsia chirurgica del tumore peritoneale con campioni congelati
  • età > 18 anni

Criteri di esclusione:

  • assenza di mesotelioma peritoneale
  • assenza di campioni congelati

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Modelli osservazionali: Coorte
  • Prospettive temporali: Retrospettiva

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Campioni di mesotelioma peritoneale

Il gruppo ospita solo pazienti che hanno ricevuto la diagnosi di mesotelioma peritoneale dopo l'intervento chirurgico. Tutti i pazienti sono inclusi in questo gruppo.

Gli array di CGH saranno realizzati su campioni congelati (per l'analisi genomica comparativa).
Genetico: analisi genomica comparativa
L'estrazione del DNA e dell'RNA verrà eseguita nell'ospedale universitario di Lione (piattaforma genomica) utilizzando kit disponibili in commercio. La percentuale di cellule tumorali sarà controllata mediante sezioni colorate prima dell'estrazione. Gli array CGH saranno realizzati su campioni congelati a Lille (piattaforma genomica). Verrà utilizzato l'array pangenomico Agilent. Il microarray include 180000 sonde. L'analisi sarà eseguita a Lille (piattaforma genomica/dipartimento di BioInformatica) con Marie Brevet. I dati saranno elaborati dai dati log2 trasformati in normalizzazione con il metodo WACA. Quindi la variazione del numero di copie verrà quindi identificata con la segmentazione binaria circolare. Le variazioni del numero di copie saranno denominate guadagno o delezione in base alla distribuzione del rapporto log2 e alla percentuale di cellule tumorali. L'uso di DNA tumorale e normale abbinato eliminerà i polimorfismi del numero di copie. Costruiremo analisi gerarchiche non supervisionate per studiare la classificazione del mesotelioma peritoneale basata sulla variazione del numero di copie

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Mutazioni BAP1
Lasso di tempo: Giorno 0
Matrice CGH
Giorno 0

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Hospices Civils de Lyon

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio

1 maggio 2013

Completamento primario (Effettivo)

1 gennaio 2016

Completamento dello studio (Effettivo)

1 gennaio 2016

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

27 aprile 2016

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

12 luglio 2016

Primo Inserito (Stima)

15 luglio 2016

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Stima)

26 luglio 2016

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

25 luglio 2016

Ultimo verificato

1 luglio 2016

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • D50828

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