Genomická analýza peritoneálního mezoteliomu pomocí CGH Arrays
25. července 2016 aktualizováno: Hospices Civils de Lyon
Peritoneální mezoteliom je vzácné onemocnění představující jednu třetinu všech mezoteliomů a o molekulárních charakteristikách tohoto onemocnění není nic známo.
Jako hlavní rakoviny je pravděpodobná genetická heterogenita.
Toto genomové profilování spojuje pole komparativní genomové hybridizace (CGH), sekvenování BAP1 a genovou expresi, aby se objevil biomarker, který by mohl být použit při léčbě tohoto vzácného onemocnění.
Odpovídající histopatologická a imunohistochemická zpráva, protože jsou k dispozici všechna klinická data.
Všechna data budou sloučena, abychom zdůraznili několik zajímavých genů, na které se zaměříme naše další vyšetřování.
V závislosti na našich předběžných výsledcích se očekávají mutace BAP1, jak bylo popsáno také u mezoteliomu pleury.
Mutace v onkogenních ovladačích, které by mohly být cílené specifickou terapií, budou zvláště zajímavé při léčbě tohoto vzácného onemocnění se špatnou prognózou.
Přehled studie
Postavení
Dokončeno
Podmínky
Intervence / Léčba
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Aktuální)
33
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
18 let a starší (Dospělý, Starší dospělý)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ne
Pohlaví způsobilá ke studiu
Všechno
Metoda odběru vzorků
Ukázka pravděpodobnosti
Studijní populace
Pacienti s diagnózou peritoneálního mezoteliomu
Popis
Kritéria pro zařazení:
- chirurgická biopsie peritoneálního nádoru se zmrazenými vzorky
- věk > 18 let
Kritéria vyloučení:
- nepřítomnost peritoneálního mezoteliomu
- nepřítomnost zmrazených vzorků
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Retrospektivní
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Vzorky peritoneálního mezoteliomu
Ve skupině jsou pouze pacienti, u kterých byla po operaci diagnostikována peritoneální mezoteliom. Do této skupiny jsou zahrnuti všichni pacienti. CGH čipy budou realizovány na zmrazených vzorcích (pro komparativní genomickou analýzu). |
Extrakce DNA a RNA bude provedena v univerzitní nemocnici v Lyonu (genomická platforma) pomocí komerčně dostupného kitu.
Procento nádorových buněk bude kontrolováno obarveným řezem před extrakcí.
Čipy CGH budou realizovány na zmrazených vzorcích v Lille (genomická platforma).
Bude použito pole Pangenomic Agilent.
Micro-array obsahuje 180 000 sond.
Analýza bude provedena v Lille (genomická platforma / oddělení bioinformatiky) s Marie Brevet.
Data budou zpracována z log2 transformovaných dat do normalizace metodou WACA.
Variace počtu kopií pak bude identifikována pomocí kruhové binární segmentace.
Variace počtu kopií budou nazývány jako zisk nebo delece podle distribuce poměru log2 a procenta nádorových buněk.
Použití shodné nádorové a normální DNA odstraní polymorfismy počtu kopií.
Budeme konstruovat nekontrolované hierarchické analýzy ke studiu klasifikace peritoneálního mezoteliomu na základě variace počtu kopií
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Mutace BAP1
Časové okno: Den 0
|
Pole CGH
|
Den 0
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Sponzor
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia
1. května 2013
Primární dokončení (Aktuální)
1. ledna 2016
Dokončení studie (Aktuální)
1. ledna 2016
Termíny zápisu do studia
První předloženo
27. dubna 2016
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
12. července 2016
První zveřejněno (Odhad)
15. července 2016
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Odhad)
26. července 2016
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
25. července 2016
Naposledy ověřeno
1. července 2016
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- D50828
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .