Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Analiza genomowa międzybłoniaka otrzewnej za pomocą macierzy CGH

25 lipca 2016 zaktualizowane przez: Hospices Civils de Lyon
Międzybłoniak otrzewnej jest rzadką chorobą, stanowiącą jedną trzecią wszystkich międzybłoniaków i nic nie wiadomo na temat molekularnej charakterystyki tej choroby. Jako główne nowotwory prawdopodobna jest heterogeniczność genetyczna. To profilowanie genomowe łączy macierz porównawczej hybrydyzacji genomowej (CGH), sekwencjonowanie BAP1 i ekspresję genów w celu odkrycia biomarkera, który można by wykorzystać w leczeniu tej rzadkiej choroby. Odpowiedni raport histopatologiczny i immunohistochemiczny, ponieważ dostępne są wszystkie dane kliniczne. Wszystkie dane zostaną połączone, aby podkreślić kilka interesujących genów, na których skupimy się w naszych następnych badaniach. W zależności od naszych wstępnych wyników oczekuje się mutacji BAP1, jak opisano również w międzybłoniaku opłucnej. Mutacje w czynnikach onkogennych, które mogłyby być celem specyficznej terapii, będą przedmiotem szczególnego zainteresowania w leczeniu tej rzadkiej choroby o złym rokowaniu.

Przegląd badań

Status

Zakończony

Warunki

Interwencja / Leczenie

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Rzeczywisty)

33

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

18 lat i starsze (Dorosły, Starszy dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Płeć kwalifikująca się do nauki

Wszystko

Metoda próbkowania

Próbka prawdopodobieństwa

Badana populacja

Pacjenci z rozpoznaniem międzybłoniaka otrzewnej

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • biopsja chirurgiczna guza otrzewnej z próbkami zamrożonymi
  • wiek > 18 lat

Kryteria wyłączenia:

  • brak międzybłoniaka otrzewnej
  • brak zamrożonych próbek

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

  • Modele obserwacyjne: Kohorta
  • Perspektywy czasowe: Z mocą wsteczną

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
Próbki międzybłoniaka otrzewnej

Grupa zawiera tylko pacjentów, u których po operacji zdiagnozowano międzybłoniaka otrzewnej. Do tej grupy zalicza się wszystkich pacjentów.

Macierze CGH zostaną wykonane na zamrożonych próbkach (do porównawczej analizy genomicznej).
Genetyczny: porównawcza analiza genomowa
Ekstrakcja DNA i RNA zostanie przeprowadzona w szpitalu uniwersyteckim w Lyonie (platforma genomowa) przy użyciu dostępnego na rynku zestawu. Procent komórek nowotworowych będzie kontrolowany przez barwione wycinki przed ekstrakcją. Macierze CGH zostaną wykonane na zamrożonych próbkach w Lille (platforma genomowa). Wykorzystana zostanie macierz Pangenomic Agilent. Mikromacierz zawiera 180000 sond. Analiza zostanie przeprowadzona w Lille (platforma genomowa / dział bioinformatyki) z Marie Brevet. Dane zostaną przetworzone z danych przekształconych w log2 do normalizacji metodą WACA. Następnie zmienność liczby kopii zostanie zidentyfikowana za pomocą Circular Binary Segmentation. Wahania liczby kopii będą nazywane wzmocnieniem lub delecją zgodnie z rozkładem stosunku log2 i procentem komórek nowotworowych. Użycie dopasowanego nowotworowego i normalnego DNA wyeliminuje polimorfizm liczby kopii. Skonstruujemy nienadzorowane analizy hierarchiczne w celu zbadania klasyfikacji międzybłoniaka otrzewnej na podstawie zmienności liczby kopii

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Mutacje BAP1
Ramy czasowe: Dzień 0
Tablica CGH
Dzień 0

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Sponsor

Hospices Civils de Lyon

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów

1 maja 2013

Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)

1 stycznia 2016

Ukończenie studiów (Rzeczywisty)

1 stycznia 2016

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

27 kwietnia 2016

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

12 lipca 2016

Pierwszy wysłany (Oszacować)

15 lipca 2016

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Oszacować)

26 lipca 2016

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

25 lipca 2016

Ostatnia weryfikacja

1 lipca 2016

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Słowa kluczowe

Dodatkowe istotne warunki MeSH

Inne numery identyfikacyjne badania

  • D50828

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Subskrybuj