Análisis genómico del mesotelioma peritoneal por CGH Arrays
25 de julio de 2016 actualizado por: Hospices Civils de Lyon
El mesotelioma peritoneal es una enfermedad rara que representa un tercio de todos los mesoteliomas y no se sabe nada sobre las características moleculares de esta enfermedad.
Como cánceres principales, la heterogeneidad genética es probable.
Este perfil genómico asocia la matriz de hibridación genómica comparativa (CGH), la secuenciación de BAP1 y la expresión génica para descubrir un biomarcador que podría usarse en el tratamiento de esta rara enfermedad.
Informe histopatológico e inmunohistoquímico correspondiente ya que se dispone de todos los datos clínicos.
Todos los datos se fusionarán para subrayar algunos genes de interés en los que centraremos nuestras próximas investigaciones.
Dependiendo de nuestros resultados preliminares, se esperan mutaciones en BAP1, ya que también se describió en el mesotelioma pleural.
Las mutaciones en los conductores oncogénicos que podrían ser el objetivo de una terapia específica serán de particular interés en el manejo de esta rara enfermedad con mal pronóstico.
Descripción general del estudio
Estado
Terminado
Condiciones
Intervención / Tratamiento
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Actual)
33
Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
18 años y mayores (Adulto, Adulto Mayor)
Acepta Voluntarios Saludables
No
Géneros elegibles para el estudio
Todos
Método de muestreo
Muestra de probabilidad
Población de estudio
Pacientes con diagnóstico de mesotelioma peritoneal
Descripción
Criterios de inclusión:
- biopsia quirúrgica del tumor peritoneal con muestras congeladas
- edad > 18 años
Criterio de exclusión:
- ausencia de mesotelioma peritoneal
- ausencia de muestras congeladas
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Grupo
- Perspectivas temporales: Retrospectivo
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
|---|---|
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Muestras de mesotelioma peritoneal
El grupo alberga solo pacientes que recibieron el diagnóstico de mesotelioma peritoneal después de la cirugía. Todos los pacientes están incluidos en este grupo. Los arrays de CGH se realizarán sobre muestras congeladas (para el análisis genómico comparativo). |
La extracción de ADN y ARN se realizará en el hospital universitario de Lyon (plataforma genómica) utilizando un kit comercialmente disponible.
El porcentaje de células tumorales se controlará mediante la sección teñida antes de la extracción.
Los arreglos CGH se realizarán en muestras congeladas en Lille (plataforma genómica).
Se utilizará la matriz Pangenomic Agilent.
La micromatriz incluye 180000 sondas.
El análisis se realizará en Lille (plataforma genómica / departamento de Bioinformática) con Marie Brevet.
Los datos se procesarán a partir de los datos transformados log2 en la normalización con el método WACA.
Luego, la variación del número de copias se identificará con la segmentación binaria circular.
Las variaciones del número de copias se denominarán ganancia o eliminación según la distribución de la relación log2 y el porcentaje de células tumorales.
El uso de ADN tumoral y normal emparejado eliminará los polimorfismos del número de copias.
Construiremos análisis jerárquicos no supervisados para estudiar la clasificación del mesotelioma peritoneal en función de la variación del número de copias.
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
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Mutaciones BAP1
Periodo de tiempo: Día 0
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Matriz CGH
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Día 0
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Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
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Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio
1 de mayo de 2013
Finalización primaria (Actual)
1 de enero de 2016
Finalización del estudio (Actual)
1 de enero de 2016
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
27 de abril de 2016
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
12 de julio de 2016
Publicado por primera vez (Estimar)
15 de julio de 2016
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Estimar)
26 de julio de 2016
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
25 de julio de 2016
Última verificación
1 de julio de 2016
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
- Enfermedades de las vías respiratorias
- Neoplasias por tipo histológico
- Neoplasias
- Enfermedades pulmonares
- Neoplasias por sitio
- Neoplasias Glandulares y Epiteliales
- Neoplasias de las vías respiratorias
- Neoplasias torácicas
- Neoplasias Pulmonares
- Adenoma
- Neoplasias Mesoteliales
- Neoplasias Pleurales
- Mesotelioma
- Mesotelioma Maligno
Otros números de identificación del estudio
- D50828
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