Genomanalyse des Peritonealmesothelioms durch CGH-Arrays
25. Juli 2016 aktualisiert von: Hospices Civils de Lyon
Das Peritonealmesotheliom ist eine seltene Erkrankung, die ein Drittel aller Mesotheliome ausmacht, und über die molekularen Eigenschaften dieser Erkrankung ist nichts bekannt.
Als Hauptkrebsarten ist eine genetische Heterogenität wahrscheinlich.
Dieses genomische Profiling verbindet Comparative Genomic Hybridization (CGH)-Array, BAP1-Sequenzierung und Genexpression, um einen Biomarker zu entdecken, der bei der Behandlung dieser seltenen Krankheit eingesetzt werden könnte.
Entsprechender histopathologischer und immunhistochemischer Befund, da alle klinischen Daten vorliegen.
Alle Daten werden zusammengeführt, um einige Gene von Interesse hervorzuheben, auf die wir uns bei unseren nächsten Untersuchungen konzentrieren werden.
Abhängig von unseren vorläufigen Ergebnissen sind BAP1-Mutationen zu erwarten, wie sie auch beim Pleuramesotheliom beschrieben wurden.
Mutationen in onkogenen Treibern, die durch eine spezifische Therapie angegriffen werden könnten, werden bei der Behandlung dieser seltenen Krankheit mit schlechter Prognose von besonderem Interesse sein.
Studienübersicht
Status
Abgeschlossen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Studientyp
Beobachtungs
Einschreibung (Tatsächlich)
33
Teilnahmekriterien
Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
18 Jahre und älter (Erwachsene, Älterer Erwachsener)
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Nein
Studienberechtigte Geschlechter
Alle
Probenahmeverfahren
Wahrscheinlichkeitsstichprobe
Studienpopulation
Patienten mit der Diagnose Peritonealmesotheliom
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- chirurgische Biopsie des Peritonealtumors mit gefrorenen Proben
- Alter > 18 Jahre alt
Ausschlusskriterien:
- Fehlen eines Peritonealmesothelioms
- Fehlen von gefrorenen Proben
Studienplan
Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Kohorte
- Zeitperspektiven: Retrospektive
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
|---|---|
|
Peritoneal-Mesotheliom-Proben
Die Gruppe beherbergt nur Patienten, bei denen nach der Operation die Diagnose eines Peritonealmesothelioms gestellt wurde. Alle Patienten sind in dieser Gruppe enthalten. Die CGH-Arrays werden an gefrorenen Proben (für die vergleichende Genomanalyse) realisiert. |
Die DNA- und RNA-Extraktion wird im Universitätskrankenhaus Lyon (genomische Plattform) unter Verwendung eines im Handel erhältlichen Kits durchgeführt.
Der Prozentsatz der Tumorzellen wird vor der Extraktion durch gefärbte Schnitte kontrolliert.
Die CGH-Arrays werden an gefrorenen Proben in Lille (genomische Plattform) realisiert.
Es wird ein pangenomisches Agilent-Array verwendet.
Micro-Array umfasst 180000 Sonden.
Die Analyse wird in Lille (genomische Plattform / Abteilung für Bioinformatik) mit Marie Brevet durchgeführt.
Daten werden von den log2-transformierten Daten in Normalisierung mit der WACA-Methode verarbeitet.
Dann wird die Kopienzahlvariation mit Circular Binary Segmentation identifiziert.
Variationen der Kopienzahl werden entsprechend der Verteilung des log2-Verhältnisses und dem Prozentsatz an Tumorzellen als Gewinn oder Deletion bezeichnet.
Durch die Verwendung von übereinstimmender tumoraler und normaler DNA werden Kopienzahl-Polymorphismen eliminiert.
Wir werden nicht überwachte hierarchische Analysen erstellen, um die Klassifikation des Peritonealmesothelioms basierend auf der Variation der Kopienzahl zu untersuchen
|
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
BAP1-Mutationen
Zeitfenster: Tag 0
|
CGH-Array
|
Tag 0
|
Mitarbeiter und Ermittler
Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.
Sponsor
Studienaufzeichnungsdaten
Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.
Haupttermine studieren
Studienbeginn
1. Mai 2013
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
1. Januar 2016
Studienabschluss (Tatsächlich)
1. Januar 2016
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
27. April 2016
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
12. Juli 2016
Zuerst gepostet (Schätzen)
15. Juli 2016
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Schätzen)
26. Juli 2016
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
25. Juli 2016
Zuletzt verifiziert
1. Juli 2016
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- D50828
Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .