Analyse génomique du mésothéliome péritonéal par CGH Arrays
25 juillet 2016 mis à jour par: Hospices Civils de Lyon
Le mésothéliome péritonéal est une maladie rare représentant un tiers de tous les mésothéliomes et on ne sait rien sur les caractéristiques moléculaires de cette maladie.
Comme cancers principaux, l'hétérogénéité génétique est probable.
Ce profilage génomique associe la puce Comparative Genomic Hybridization (CGH), le séquençage de BAP1 et l'expression génique afin de découvrir un biomarqueur qui pourrait être utilisé dans le traitement de cette maladie rare.
Rapport histopathologique et immunohistochimique correspondant car toutes les données cliniques sont disponibles.
Toutes les données seront fusionnées pour souligner quelques gènes d'intérêt sur lesquels nous concentrerons nos prochaines investigations.
Selon nos résultats préliminaires, des mutations de BAP1 sont attendues, comme cela a également été décrit dans le mésothéliome pleural.
Les mutations des drivers oncogènes qui pourraient être ciblées par une thérapie spécifique seront d'un intérêt particulier dans la prise en charge de cette maladie rare et de mauvais pronostic.
Aperçu de l'étude
Statut
Complété
Les conditions
Intervention / Traitement
Type d'étude
Observationnel
Inscription (Réel)
33
Critères de participation
Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
18 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)
Accepte les volontaires sains
Non
Sexes éligibles pour l'étude
Tout
Méthode d'échantillonnage
Échantillon de probabilité
Population étudiée
Patients avec un diagnostic de mésothéliome péritonéal
La description
Critère d'intégration:
- biopsie chirurgicale de la tumeur péritonéale avec des échantillons congelés
- âge > 18 ans
Critère d'exclusion:
- absence de mésothéliome péritonéal
- absence d'échantillons congelés
Plan d'étude
Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
- Modèles d'observation: Cohorte
- Perspectives temporelles: Rétrospective
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
Intervention / Traitement |
|---|---|
|
Spécimens de mésothéliome péritonéal
Le groupe héberge uniquement des patients qui ont reçu le diagnostic de mésothéliome péritonéal après la chirurgie. Tous les patients sont inclus dans ce groupe. Les puces CGH seront réalisées sur des échantillons congelés (pour l'analyse génomique comparative). |
L'extraction d'ADN et d'ARN sera réalisée au CHU de Lyon (plateforme génomique) à l'aide d'un kit disponible dans le commerce.
Le pourcentage de cellules tumorales sera contrôlé par coupe colorée avant extraction.
Les puces CGH seront réalisées sur échantillons congelés à Lille (plateforme génomique).
Le réseau Pangenomic Agilent sera utilisé.
Le microréseau comprend 180 000 sondes.
Les analyses seront réalisées à Lille (plateforme de génomique / département de BioInformatique) avec Marie Brevet.
Les données seront traitées à partir des données transformées log2 en normalisation avec la méthode WACA.
Ensuite, la variation du nombre de copies sera alors identifiée avec la segmentation binaire circulaire.
Les variations du nombre de copies seront appelées gain ou suppression selon la distribution du rapport log2 et le pourcentage de cellules tumorales.
L'utilisation d'ADN tumoral et normal correspondant éliminera les polymorphismes du nombre de copies.
Nous construirons des analyses hiérarchiques non supervisées pour étudier la classification du mésothéliome péritonéal basée sur la variation du nombre de copies
|
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
|
Mutations BAP1
Délai: Jour 0
|
Tableau CGH
|
Jour 0
|
Collaborateurs et enquêteurs
C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.
Parrainer
Dates d'enregistrement des études
Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.
Dates principales de l'étude
Début de l'étude
1 mai 2013
Achèvement primaire (Réel)
1 janvier 2016
Achèvement de l'étude (Réel)
1 janvier 2016
Dates d'inscription aux études
Première soumission
27 avril 2016
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
12 juillet 2016
Première publication (Estimation)
15 juillet 2016
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Estimation)
26 juillet 2016
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
25 juillet 2016
Dernière vérification
1 juillet 2016
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- D50828
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .