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Análise Genômica do Mesotelioma Peritoneal por CGH Arrays

25 de julho de 2016 atualizado por: Hospices Civils de Lyon
O mesotelioma peritoneal é uma doença rara que representa um terço de todos os mesoteliomas e nada se sabe sobre as características moleculares desta doença. Como principais cânceres, a heterogeneidade genética é provável. Este perfil genômico associa matriz de hibridização genômica comparativa (CGH), sequenciamento BAP1 e expressão gênica para descobrir um biomarcador que possa ser usado no tratamento desta doença rara. Relatório histopatológico e imuno-histoquímico correspondente, pois todos os dados clínicos estão disponíveis. Todos os dados serão mesclados para sublinhar alguns genes de interesse nos quais focaremos nossas próximas investigações. Dependendo de nossos resultados preliminares, são esperadas mutações em BAP1, como também foi descrito no mesotelioma pleural. Mutações em drivers oncogênicos que podem ser alvo de terapia específica serão de particular interesse no manejo dessa doença rara com mau prognóstico.

Visão geral do estudo

Status

Concluído

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Real)

33

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

18 anos e mais velhos (Adulto, Adulto mais velho)

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Gêneros Elegíveis para o Estudo

Tudo

Método de amostragem

Amostra de Probabilidade

População do estudo

Pacientes com diagnóstico de mesotelioma peritoneal

Descrição

Critério de inclusão:

  • biópsia cirúrgica do tumor peritoneal com amostras congeladas
  • idade > 18 anos

Critério de exclusão:

  • ausência de mesotelioma peritoneal
  • ausência de amostras congeladas

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

  • Modelos de observação: Coorte
  • Perspectivas de Tempo: Retrospectivo

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
Espécimes de mesotelioma peritoneal

O grupo abriga apenas pacientes que receberam o diagnóstico de mesotelioma peritoneal após a cirurgia. Todos os pacientes estão incluídos neste grupo.

Os arrays CGH serão realizados em amostras congeladas (para análise genômica comparativa).

A extração de DNA e RNA será realizada no hospital da Universidade de Lyon (plataforma genômica) usando kit disponível comercialmente. A porcentagem de células tumorais será controlada por seção corada antes da extração. As matrizes CGH serão realizadas em amostras congeladas em Lille (plataforma genômica). Pangenomic array Agilent será usado. A micromatriz inclui 180.000 sondas. A análise será realizada em Lille (plataforma genômica / departamento de BioInformática) com Marie Brevet. Os dados serão processados ​​a partir dos dados log2 transformados em normalização com o método WACA. Em seguida, a variação do número de cópias será identificada com a Segmentação Binária Circular. As variações do número de cópias serão chamadas de ganho ou deleção de acordo com a distribuição da razão log2 e o percentual de células tumorais. O uso de DNA tumoral e normal compatível eliminará os polimorfismos de número de cópia. Construiremos análises hierárquicas não supervisionadas para estudar a classificação do mesotelioma peritoneal com base na variação do número de cópias

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Mutações BAP1
Prazo: Dia 0
Matriz CGH
Dia 0

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo

1 de maio de 2013

Conclusão Primária (Real)

1 de janeiro de 2016

Conclusão do estudo (Real)

1 de janeiro de 2016

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

27 de abril de 2016

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

12 de julho de 2016

Primeira postagem (Estimativa)

15 de julho de 2016

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Estimativa)

26 de julho de 2016

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

25 de julho de 2016

Última verificação

1 de julho de 2016

Mais Informações

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

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