Enterobacteriaceae의 Qnr 유전자

Enterobacteriaceae의 다약제 내성은 환자 치료에서 반복되는 문제입니다. 확장 스펙트럼 베타-락타마제(ESBL)를 생산하는 박테리아는 전염병 특성을 감안할 때 광범위하고 비용이 많이 드는 예방 조치를 받아야 합니다. 처음 기술된 ESBL의 유전자 위치는 종종 아미노글리코시드에 대한 내성과 관련된 한 종에서 다른 종으로 이동할 수 있는 플라스미드였습니다. 퀴놀론 내성은 양도할 수 없었습니다. 1998년에 퀴놀론에 대항하여 기라제 및 토포이소머라제 IV를 보호하는 단백질을 암호화하는 qnr A 플라스미드 유전자를 운반하는 클렙시엘라 뉴모니아에가 발견되었습니다. 그러나 관련된 다른 퀴놀론 내성 메커니즘 없이 이 유전자를 보유하는 균주에 의해 달성되는 시프로플록사신 MIC의 수준은 낮게 유지됩니다. 그러나 다른 퀴놀론 내성 메커니즘이 결여된 대장균에 대한 시프로플록사신 MIC는 qnr의 유형에 따라 0.003 mg/L에서 0.25 mg/L까지 갈 수 있습니다. 현재, qnrA(n=6), qnrB(n=10) 및 qnrS(n=2)와 같은 여러 변이를 갖는 단백질을 암호화하는 세 가지 유형의 qnr 유전자가 기술되었다. qnrA 및 qnrB 유전자는 54-180kb의 플라스미드에 의해 운반됩니다. 플라스미드 DNA의 유전자 환경은 클래스 1 인테그론 또는 Type sul1의 환경입니다. 그러나 qnrS를 운반하는 시퀀싱된 플라스미드는 인테그론 유사 구조를 갖지 않습니다. 이들 유전자는 다른 것보다 ESBL 균주를 생산하는 장내세균과 균주에서 더 흔하다. 최근까지 관찰된 낮은 유병률은 일부 연구에서 증가하고 있습니다. 우리는 Enterobacter cloacae의 10개 변종 중 4개 변종을 포함하여 2004년 Champagne-Ardenne에서 분리된 138개 중 9개(6.5%) 변종에서 qnr을 관찰했습니다. 또한 시험관 내에서 qnrA 유전자의 존재가 높은 수준의 퀴놀론 내성에 대한 돌연변이 선택을 촉진하는 것으로 나타났습니다. 따라서 일부 저자들에 의해 보고된 이 유전자의 유병률 증가 추세를 고려할 때 이러한 변종의 출현에 유리한 요인을 모니터링하고 식별하는 것이 필요합니다. 본 연구의 목적은 ESBL 생성 균주 내에서 qnr 유전자 유병률의 진화를 관찰하고, 유행성 클론 균주의 출현을 감지하고, 이들 유전자의 위험 인자의 출현을 찾는 것이다. 이러한 유전자의 유병률이 낮기 때문에 2008년 4월 1일부터 2009년 3월 31일까지 9개의 동부 지역 병원에서 조직될 다기관 연구가 포함된 연구입니다. 따라서 임상생물학의 목표는 다음과 같습니다. - 이러한 유전자의 생산자 계통을 충분히 수집하기 위해, - 다양한 변이체를 특성화하기 위해(CHU Reims), - 이러한 유전자와 관련이 있을 수 있는 클론을 식별하기 위해(Besançon 대학 병원) , - 그들의 유전적 환경(CHU Dijon)을 연구하기 위해, - 그들의 존재에 유리한 임상적 요인과 항생제 치료를 찾으십시오. 1년 동안 5 CHU inter region 및 CH 4, Colmar, Vesoul, Troyes 및 Charleville에서 확인된 모든 ESBL 생성 장내세균과 분리균은 랭스 대학 병원의 세균학 연구소에 집중 관리됩니다. 중복되지 않는 분리주가 포함될 것입니다(종별 및 월별 환자 저항성 표현형당 하나의 분리주). 이 기간 동안 600개의 ESBL 생성 균주가 예상되며 그 중 50개의 균주가 qnr 유전자를 가지고 있습니다. 임상 연구는 후향적 기록입니다. qnr을 보유한 분리주가 있는 각 환자에 대해 동일한 병원에서 10세 미만의 나이 차이가 있고 "사례"가 있는 2명의 대조군 환자가 장내세균을 생성하는 ESBL이 있는 환자 목록에 그려집니다. 그리고 150명의 환자 기록이 연구에 포함될 것입니다. qnr 유전자의 병렬 시퀀싱을 통해 정확한 식별 및 변형을 강조할 수 있습니다. 퀴놀론 MIC는 저항 수준의 증가를 감지하도록 결정됩니다. 나머지 연구에는 시퀀싱에 의한 ESBL 식별이 포함됩니다. qnr의 유전적 환경에 대한 연구는 문헌 데이터와 비교하여 전파를 촉진하는 유전적 요인(플라스미드, 인테그론), 가변성을 검출하기 위해 유전자 유형 및 종별로 하나의 분리주에 대해 수행되고 추가 역학적 마커를 얻을 것입니다. 분리물의 유전자형 분석은 가능한 전염병 클론을 강조 표시합니다. Escherichia coli의 경우 계통발생 그룹은 Besancon 대학 병원에서 결정됩니다. 대장균 균주의 분포. 서로 다른 계통발생적 그룹 사이에서 qnr을 갖는 대장균은 qnr이 없는 ESBL 균주(1개의 경우에 대해 2개의 대조군) 중에서 추출된 다수의 대장균 분리주와 비교될 것이다. 파일에서 기록되는 주요 임상 파라미터는 입원 사유, 주요 기저 질환, ESBL 박테리아 분리 전후의 항생제 치료 등이 될 것입니다. qnr 유전자를 가지고 있는 균주가 가지지 않은 줄기가 있는 특정 분자에 대해 통계적으로 더 저항성이 있는지 여부를 결정할 것입니다.