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- 미국 임상 시험 레지스트리
- 임상시험 NCT03831035
중환자실에 입원한 생후 12개월 미만 영유아의 선천성 질환 진단을 위한 Fast Exome (REUNIR)
중증 영아의 선천성 기형 및 의심되는 유전 상태의 조기 진단은 특정 적응 관리, 예방 및 적절한 유전 상담을 수행하는 데 필수적입니다. 그러나 병인은 다양하며 각각 개별적으로 매우 드뭅니다. 차세대 염기서열 분석 기술 덕분에 진단 시간이 대폭 단축되고 진단 수율이 높아졌다.
이 연구는 중환자실(ICU)에 입원한 12개월 미만의 영아를 대상으로 빠른 트리오 엑솜 시퀀싱(정보에 입각한 동의서 서명과 부모에게 결과 상담까지 16일 미만)의 타당성을 평가하는 것을 목표로 합니다.
연구 개요
상세 설명
이 전향적 연구는 중환자실에 입원한 12개월 미만의 영유아 15명을 대상으로 빠른 트리오 엑솜 시퀀싱(정보에 입각한 동의서 서명과 부모에게 결과 제시를 위한 상담 사이에 16일 미만)의 타당성을 평가하는 것을 목표로 하는 최초의 프랑스 연구입니다. 단위. 포함된 환자는 1년 동안 후속 검사를 받게 됩니다.
주요 평가 기준은 16일 이전에 가족에게 주어진 엑솜 결과의 수율이다. 2차 평가 기준은 1/ 결과가 나올 때까지의 각 단계의 기간 2/ 진단율 : 병인 규명 3/ 엑솜 진단이 허용하는 진료의 조정 4/ 진단을 달성하기 위해 필요한 혈액량 5/ 입원 기간 및 포함 다음 해의 의료 상담 횟수.
엑솜 시퀀싱은 일반적으로 규정된 고전적 분석 위에 수행됩니다. 진료는 엑솜 결과 접수 전까지 수정되지 않습니다. 정보에 입각한 동의서에 서명한 후, 영아와 부모 모두의 혈액 샘플을 트리오 엑솜 시퀀싱에 사용하며, 분석 단계(혈액 샘플 DNA 추출 및 고효율 시퀀싱), 생물정보 단계 및 해석 단계의 3단계를 포함합니다. .
이 연구에는 네 가지 의료 상담이 포함됩니다.
1/ 유전학자에게 포함시키기 위한 상담, 2/ 유전학자에게 엑솜 결과를 위한 상담, 3/ 결과 3개월 후 엑솜 결과 생거-확인을 위한 상담, 4/ 포함 1년 후 상담 의료 추적.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Hérault
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Montpellier, Hérault, 프랑스, 34295
- Medical genetics Arnaud de Villeneuve
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- ICU에 입원한 12개월 미만의 영유아.
- 유전적 기원이 의심되나 유전적으로 진단되지 않은 다발성 선천기형 또는 신경학적 증상이 있는 영아.
- 생물학적 부모 모두가 연구에 동의한 유아, 자신과 자녀에 대한 유전자 분석.
- 프랑스 국립 보건 서비스에 등록된 유아 및 부모
제외 기준:
- 부모 샘플 중 하나 또는 둘 다 없음.
- 염색체(예: 다운 증후군), Sanger(예: 영아 척수 근위축증) 메틸화(예: Prader-Willi 증후군) 또는 삼중체 증폭(예: 신생아 Steinert 근긴장증) 연구를 통해 출생 전후에 정확한 유전 진단을 합니다.
- 염색체(예: 다운 증후군), Sanger(예: 영아 척추 근위축증) 메틸화(예: Prader-Willi 증후군) 또는 삼중항 증폭(예: 신생아 Steinert 근긴장증) 연구에 대한 강력한 임상 증거.
- 한쪽 또는 양쪽 부모가 동의할 수 없음
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 관찰 모델: 보병대
- 시간 관점: 유망한
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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15명의 환자와 부모 모두.
환자는 다발성 선천성 기형 및/또는 신경학적 증상으로 중환자실에 입원한 생후 12개월 이하입니다.
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엑솜 시퀀싱에는 분석, 생물 정보 및 해석 단계가 필요합니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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16일 이전에 가족에게 주어진 엑솜 결과의 수율
기간: 포함 후 최대 16일
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샘플 수집과 결과 사이의 일수
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포함 후 최대 16일
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
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결과가 나올 때까지 각 단계의 기간(분석 단계, 생물 정보학 단계, 해석 단계).
기간: 포함 후 최대 16일
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샘플 수집과 결과 사이의 일수
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포함 후 최대 16일
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진단율 : 병인 규명
기간: 3 개월
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샘플 수집과 진단 확인 사이의 일수
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3 개월
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엑솜 진단이 허용하는 진료 조정
기간: 포함 후 최대 16일
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진단 검사, 진단된 병리에 특정한 의료 서비스 또는 알려진 합병증의 스크리닝의 추가 또는 삭제
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포함 후 최대 16일
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진단을 달성하기 위해 필요한 혈액의 양
기간: 포함 후 최대 16일
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진단에 필요한 혈액량
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포함 후 최대 16일
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진단을 달성하기 위해 필요한 혈액의 양
기간: 포함 후 최대 16일
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진단을 달성하는 데 필요한 샘플 수
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포함 후 최대 16일
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포함 다음 해의 입원 기간
기간: 편입 후 1년
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1년 중 입원 일수
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편입 후 1년
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포함 다음 해의 의료 상담 횟수
기간: 편입 후 1년
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해당 연도의 진료 건수
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편입 후 1년
|
공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Marjolaine WILLEMS, Medical genetics Arnaud de Villeneuve
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Acikalin A, Bagir EK, Torun G, Ates BT, Erdogan S, Uguz A, Ergin M, Buyukkurt S, Ozgunen FT, Tunali N, Gumurdulu D. Perinatal autopsy evaluation of 2150 autopsies in the Cukurova region of Turkey. Turk Patoloji Derg. 2014;30(3):189-94. doi: 10.5146/tjpath.2014.01266.
- Baird PA, Anderson TW, Newcombe HB, Lowry RB. Genetic disorders in children and young adults: a population study. Am J Hum Genet. 1988 May;42(5):677-93.
- Bonnet D. [Genetics of congenital heart diseases]. Presse Med. 2017 Jun;46(6 Pt 1):612-619. doi: 10.1016/j.lpm.2017.05.014. Epub 2017 Jun 2. French.
- Dhiman V. Molecular Genetics of Epilepsy: A Clinician's Perspective. Ann Indian Acad Neurol. 2017 Apr-Jun;20(2):96-102. doi: 10.4103/aian.AIAN_447_16.
- Grandemange S, Sanchez E, Louis-Plence P, Tran Mau-Them F, Bessis D, Coubes C, Frouin E, Seyger M, Girard M, Puechberty J, Costes V, Rodiere M, Carbasse A, Jeziorski E, Portales P, Sarrabay G, Mondain M, Jorgensen C, Apparailly F, Hoppenreijs E, Touitou I, Genevieve D. A new autoinflammatory and autoimmune syndrome associated with NLRP1 mutations: NAIAD (NLRP1-associated autoinflammation with arthritis and dyskeratosis). Ann Rheum Dis. 2017 Jul;76(7):1191-1198. doi: 10.1136/annrheumdis-2016-210021. Epub 2016 Dec 13.
- Hack M, Taylor HG, Drotar D, Schluchter M, Cartar L, Andreias L, Wilson-Costello D, Klein N. Chronic conditions, functional limitations, and special health care needs of school-aged children born with extremely low-birth-weight in the 1990s. JAMA. 2005 Jul 20;294(3):318-25. doi: 10.1001/jama.294.3.318.
- McCandless SE, Brunger JW, Cassidy SB. The burden of genetic disease on inpatient care in a children's hospital. Am J Hum Genet. 2004 Jan;74(1):121-7. doi: 10.1086/381053. Epub 2003 Dec 12. Erratum In: Am J Hum Genet. 2004 Apr;74(4):788.
- Musante L, Ropers HH. Genetics of recessive cognitive disorders. Trends Genet. 2014 Jan;30(1):32-9. doi: 10.1016/j.tig.2013.09.008. Epub 2013 Oct 28.
- Pabinger S, Dander A, Fischer M, Snajder R, Sperk M, Efremova M, Krabichler B, Speicher MR, Zschocke J, Trajanoski Z. A survey of tools for variant analysis of next-generation genome sequencing data. Brief Bioinform. 2014 Mar;15(2):256-78. doi: 10.1093/bib/bbs086. Epub 2013 Jan 21.
- Packer JS, Maxwell EK, O'Dushlaine C, Lopez AE, Dewey FE, Chernomorsky R, Baras A, Overton JD, Habegger L, Reid JG. CLAMMS: a scalable algorithm for calling common and rare copy number variants from exome sequencing data. Bioinformatics. 2016 Jan 1;32(1):133-5. doi: 10.1093/bioinformatics/btv547. Epub 2015 Sep 17.
- Richards S, Aziz N, Bale S, Bick D, Das S, Gastier-Foster J, Grody WW, Hegde M, Lyon E, Spector E, Voelkerding K, Rehm HL; ACMG Laboratory Quality Assurance Committee. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015 May;17(5):405-24. doi: 10.1038/gim.2015.30. Epub 2015 Mar 5.
- Van der Auwera GA, Carneiro MO, Hartl C, Poplin R, Del Angel G, Levy-Moonshine A, Jordan T, Shakir K, Roazen D, Thibault J, Banks E, Garimella KV, Altshuler D, Gabriel S, DePristo MA. From FastQ data to high confidence variant calls: the Genome Analysis Toolkit best practices pipeline. Curr Protoc Bioinformatics. 2013;43(1110):11.10.1-11.10.33. doi: 10.1002/0471250953.bi1110s43.
- Vissers LE, Gilissen C, Veltman JA. Genetic studies in intellectual disability and related disorders. Nat Rev Genet. 2016 Jan;17(1):9-18. doi: 10.1038/nrg3999. Epub 2015 Oct 27.
- Zlotogora J, Shalev SA. The consequences of consanguinity on the rates of malformations and major medical conditions at birth and in early childhood in inbred populations. Am J Med Genet A. 2010 Aug;152A(8):2023-8. doi: 10.1002/ajmg.a.33537.
- Cunniff C, Carmack JL, Kirby RS, Fiser DH. Contribution of heritable disorders to mortality in the pediatric intensive care unit. Pediatrics. 1995 May;95(5):678-81.
- FitzPatrick DR, Skeoch CH, Tolmie JL. Genetic aspects of admissions to a paediatric intensive care unit. Arch Dis Child. 1991 May;66(5):639-41. doi: 10.1136/adc.66.5.639.
- Gilissen C, Hoischen A, Brunner HG, Veltman JA. Unlocking Mendelian disease using exome sequencing. Genome Biol. 2011 Sep 14;12(9):228. doi: 10.1186/gb-2011-12-9-228.
- Hildreth A, Wigby K, Chowdhury S, Nahas S, Barea J, Ordonez P, Batalov S, Dimmock D, Kingsmore S; RCIGM Investigators. Rapid whole-genome sequencing identifies a novel homozygous NPC1 variant associated with Niemann-Pick type C1 disease in a 7-week-old male with cholestasis. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2017 Sep 1;3(5):a001966. doi: 10.1101/mcs.a001966. Print 2017 Sep.
- Kingsmore SF, Petrikin J, Willig LK, Guest E. Emergency medical genomes: a breakthrough application of precision medicine. Genome Med. 2015 Jul 30;7(1):82. doi: 10.1186/s13073-015-0201-z. eCollection 2015.
- Lalani SR. Current Genetic Testing Tools in Neonatal Medicine. Pediatr Neonatol. 2017 Apr;58(2):111-121. doi: 10.1016/j.pedneo.2016.07.002. Epub 2016 Sep 28.
- Lee H, Deignan JL, Dorrani N, Strom SP, Kantarci S, Quintero-Rivera F, Das K, Toy T, Harry B, Yourshaw M, Fox M, Fogel BL, Martinez-Agosto JA, Wong DA, Chang VY, Shieh PB, Palmer CG, Dipple KM, Grody WW, Vilain E, Nelson SF. Clinical exome sequencing for genetic identification of rare Mendelian disorders. JAMA. 2014 Nov 12;312(18):1880-7. doi: 10.1001/jama.2014.14604.
- Petrikin JE, Willig LK, Smith LD, Kingsmore SF. Rapid whole genome sequencing and precision neonatology. Semin Perinatol. 2015 Dec;39(8):623-31. doi: 10.1053/j.semperi.2015.09.009. Epub 2015 Oct 29.
- Reardon S. Fast genetic sequencing saves newborn lives. Nature. 2014 Oct 2;514(7520):13-4. doi: 10.1038/514013a. No abstract available.
- Saunders CJ, Miller NA, Soden SE, Dinwiddie DL, Noll A, Alnadi NA, Andraws N, Patterson ML, Krivohlavek LA, Fellis J, Humphray S, Saffrey P, Kingsbury Z, Weir JC, Betley J, Grocock RJ, Margulies EH, Farrow EG, Artman M, Safina NP, Petrikin JE, Hall KP, Kingsmore SF. Rapid whole-genome sequencing for genetic disease diagnosis in neonatal intensive care units. Sci Transl Med. 2012 Oct 3;4(154):154ra135. doi: 10.1126/scitranslmed.3004041.
- Smith LD, Willig LK, Kingsmore SF. Whole-Exome Sequencing and Whole-Genome Sequencing in Critically Ill Neonates Suspected to Have Single-Gene Disorders. Cold Spring Harb Perspect Med. 2015 Dec 18;6(2):a023168. doi: 10.1101/cshperspect.a023168.
- Soden SE, Saunders CJ, Willig LK, Farrow EG, Smith LD, Petrikin JE, LePichon JB, Miller NA, Thiffault I, Dinwiddie DL, Twist G, Noll A, Heese BA, Zellmer L, Atherton AM, Abdelmoity AT, Safina N, Nyp SS, Zuccarelli B, Larson IA, Modrcin A, Herd S, Creed M, Ye Z, Yuan X, Brodsky RA, Kingsmore SF. Effectiveness of exome and genome sequencing guided by acuity of illness for diagnosis of neurodevelopmental disorders. Sci Transl Med. 2014 Dec 3;6(265):265ra168. doi: 10.1126/scitranslmed.3010076.
- Thevenon J, Duffourd Y, Masurel-Paulet A, Lefebvre M, Feillet F, El Chehadeh-Djebbar S, St-Onge J, Steinmetz A, Huet F, Chouchane M, Darmency-Stamboul V, Callier P, Thauvin-Robinet C, Faivre L, Riviere JB. Diagnostic odyssey in severe neurodevelopmental disorders: toward clinical whole-exome sequencing as a first-line diagnostic test. Clin Genet. 2016 Jun;89(6):700-7. doi: 10.1111/cge.12732. Epub 2016 Apr 26.
- Willig LK, Petrikin JE, Smith LD, Saunders CJ, Thiffault I, Miller NA, Soden SE, Cakici JA, Herd SM, Twist G, Noll A, Creed M, Alba PM, Carpenter SL, Clements MA, Fischer RT, Hays JA, Kilbride H, McDonough RJ, Rosterman JL, Tsai SL, Zellmer L, Farrow EG, Kingsmore SF. Whole-genome sequencing for identification of Mendelian disorders in critically ill infants: a retrospective analysis of diagnostic and clinical findings. Lancet Respir Med. 2015 May;3(5):377-87. doi: 10.1016/S2213-2600(15)00139-3. Epub 2015 Apr 27.
- Yang Y, Muzny DM, Reid JG, Bainbridge MN, Willis A, Ward PA, Braxton A, Beuten J, Xia F, Niu Z, Hardison M, Person R, Bekheirnia MR, Leduc MS, Kirby A, Pham P, Scull J, Wang M, Ding Y, Plon SE, Lupski JR, Beaudet AL, Gibbs RA, Eng CM. Clinical whole-exome sequencing for the diagnosis of mendelian disorders. N Engl J Med. 2013 Oct 17;369(16):1502-11. doi: 10.1056/NEJMoa1306555. Epub 2013 Oct 2.
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