- ICH GCP
- Registro de ensayos clínicos de EE. UU.
- Ensayo clínico NCT03831035
Exoma Rápido para Diagnóstico de Condiciones Congénitas en Infantes Menores de 12 Meses Hospitalizados en Unidad de Cuidados Intensivos (REUNIR)
El diagnóstico precoz de malformaciones congénitas y sospechas de patologías genéticas en lactantes críticos es fundamental para realizar cuidados específicos, prevención y asesoramiento genético adecuado. Sin embargo, las etiologías son diversas y cada una de ellas es individualmente muy rara. Gracias a las tecnologías de secuenciación de próxima generación, los plazos de diagnóstico se han reducido drásticamente y los investigadores han observado un aumento en los rendimientos de diagnóstico.
Este estudio tiene como objetivo evaluar la viabilidad de la secuenciación rápida del exoma en trío (menos de 16 días entre la firma del consentimiento informado y la consulta de resultados a los padres) en lactantes menores de 12 meses hospitalizados en Unidad de Cuidados Intensivos (UCI).
Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
Este estudio prospectivo es el primer estudio francés que tiene como objetivo evaluar la viabilidad de la secuenciación rápida del exoma en trío (menos de 16 días entre la firma del consentimiento informado y la consulta para la presentación de los resultados a los padres) en 15 bebés menores de 12 meses hospitalizados en Cuidados Intensivos Unidad. Los pacientes incluidos tendrán un año de examen de seguimiento.
El principal criterio de evaluación es el rendimiento de los resultados del exoma entregados a la familia antes de los 16 días. Los criterios secundarios de evaluación son 1/ duración de cada paso hasta los resultados 2/ rendimiento del diagnóstico: identificación de la etiología 3/ ajuste de la atención médica permitido por el diagnóstico del exoma 4/ cantidad de sangre necesaria para lograr el diagnóstico 5/ duración de la estancia hospitalaria y número de consultas médicas en el año siguiente a la inclusión.
La secuenciación del exoma se realizará además del análisis clásico normalmente prescrito. La atención médica no se modificará hasta la recepción de los resultados del exoma. Después de la firma del consentimiento informado, las muestras de sangre del bebé y de ambos padres se utilizarán para la secuenciación del exoma trio, que incluye 3 pasos: el paso analítico (extracción de ADN de la muestra de sangre y secuenciación de alto rendimiento), el paso bioinformático y el paso de interpretación. .
El estudio incluye cuatro consultas médicas:
1/consulta con genetista para inclusión, 2/consulta con genetista para dar resultado del exoma, 3/consulta a los 3 meses de los resultados para el sanger-confirmación del resultado del exoma, 4/consulta al año de la inclusión para seguimiento médico.
Tipo de estudio
Inscripción (Actual)
Contactos y Ubicaciones
Ubicaciones de estudio
-
-
Hérault
-
Montpellier, Hérault, Francia, 34295
- Medical genetics Arnaud de Villeneuve
-
-
Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Descripción
Criterios de inclusión:
- Lactante menor de 12 meses, hospitalizado en UCI.
- Lactante con múltiples malformaciones congénitas o síntomas neurológicos en los que se sospecha un origen genético pero no se diagnostica genéticamente.
- Lactante para quien ambos padres biológicos han dado su consentimiento para el estudio, análisis genético para ellos y su hijo.
- Bebé y padres registrados en el servicio nacional de salud francés
Criterio de exclusión:
- Ausencia de una o ambas muestras parentales.
- Diagnóstico genético preciso realizado antes o después del nacimiento con estudios de metilación cromosómica (es decir, síndrome de Down), Sanger (es decir, amiotrofia espinal infantil) (es decir, síndrome de Prader-Willi) o amplificación de tripletes (es decir, miotonía neonatal de Steinert).
- Evidencia clínica sólida de estudios de metilación cromosómica (es decir, síndrome de Down), Sanger (es decir, amiotrofia espinal infantil) (es decir, síndrome de Prader-Willi) o amplificación de tripletes (es decir, miotonía neonatal de Steinert).
- Imposibilidad de que uno o ambos padres den su consentimiento
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Modelos observacionales: Grupo
- Perspectivas temporales: Futuro
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
Intervención / Tratamiento |
---|---|
15 pacientes y ambos padres.
Los pacientes tienen 12 meses o menos de edad hospitalizados en la UCI que sufren de múltiples malformaciones congénitas y/o síntomas neurológicos.
|
La secuenciación del exoma requiere pasos analíticos, bioinformáticos y de interpretación.
|
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
---|---|---|
Rendimiento de los resultados del exoma entregados a la familia antes de los 16 días
Periodo de tiempo: 16 días máximo después de la inclusión
|
número de días entre la muestra recolectada y los resultados
|
16 días máximo después de la inclusión
|
Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
---|---|---|
Duración de cada paso hasta los resultados (el paso analítico, el paso bioinformático, el paso de interpretación).
Periodo de tiempo: 16 días máximo después de la inclusión
|
número de días entre la muestra recolectada y los resultados
|
16 días máximo después de la inclusión
|
Rendimiento diagnóstico: identificación de la etiología
Periodo de tiempo: 3 meses
|
número de días entre la muestra recolectada y la confirmación del diagnóstico
|
3 meses
|
Ajuste de la atención médica permitida por el diagnóstico del exoma
Periodo de tiempo: 16 días máximo después de la inclusión
|
Cualquier adición o eliminación de un examen de diagnóstico, atención médica específica para la patología diagnosticada o detección de una complicación conocida
|
16 días máximo después de la inclusión
|
Cantidad de sangre necesaria para lograr el diagnóstico
Periodo de tiempo: 16 días máximo después de la inclusión
|
volumen de sangre necesario para lograr el diagnóstico
|
16 días máximo después de la inclusión
|
Cantidad de sangre necesaria para lograr el diagnóstico
Periodo de tiempo: 16 días máximo después de la inclusión
|
número de muestras necesarias para lograr el diagnóstico
|
16 días máximo después de la inclusión
|
duración de la estancia hospitalaria en el año siguiente a la inclusión
Periodo de tiempo: un año después de la inclusión
|
número de días de estancia hospitalaria en el año
|
un año después de la inclusión
|
número de consultas médicas en el año siguiente a la inclusión
Periodo de tiempo: un año después de la inclusión
|
número de consultas médicas en el año
|
un año después de la inclusión
|
Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Marjolaine WILLEMS, Medical genetics Arnaud de Villeneuve
Publicaciones y enlaces útiles
Publicaciones Generales
- Acikalin A, Bagir EK, Torun G, Ates BT, Erdogan S, Uguz A, Ergin M, Buyukkurt S, Ozgunen FT, Tunali N, Gumurdulu D. Perinatal autopsy evaluation of 2150 autopsies in the Cukurova region of Turkey. Turk Patoloji Derg. 2014;30(3):189-94. doi: 10.5146/tjpath.2014.01266.
- Baird PA, Anderson TW, Newcombe HB, Lowry RB. Genetic disorders in children and young adults: a population study. Am J Hum Genet. 1988 May;42(5):677-93.
- Bonnet D. [Genetics of congenital heart diseases]. Presse Med. 2017 Jun;46(6 Pt 1):612-619. doi: 10.1016/j.lpm.2017.05.014. Epub 2017 Jun 2. French.
- Dhiman V. Molecular Genetics of Epilepsy: A Clinician's Perspective. Ann Indian Acad Neurol. 2017 Apr-Jun;20(2):96-102. doi: 10.4103/aian.AIAN_447_16.
- Grandemange S, Sanchez E, Louis-Plence P, Tran Mau-Them F, Bessis D, Coubes C, Frouin E, Seyger M, Girard M, Puechberty J, Costes V, Rodiere M, Carbasse A, Jeziorski E, Portales P, Sarrabay G, Mondain M, Jorgensen C, Apparailly F, Hoppenreijs E, Touitou I, Genevieve D. A new autoinflammatory and autoimmune syndrome associated with NLRP1 mutations: NAIAD (NLRP1-associated autoinflammation with arthritis and dyskeratosis). Ann Rheum Dis. 2017 Jul;76(7):1191-1198. doi: 10.1136/annrheumdis-2016-210021. Epub 2016 Dec 13.
- Hack M, Taylor HG, Drotar D, Schluchter M, Cartar L, Andreias L, Wilson-Costello D, Klein N. Chronic conditions, functional limitations, and special health care needs of school-aged children born with extremely low-birth-weight in the 1990s. JAMA. 2005 Jul 20;294(3):318-25. doi: 10.1001/jama.294.3.318.
- McCandless SE, Brunger JW, Cassidy SB. The burden of genetic disease on inpatient care in a children's hospital. Am J Hum Genet. 2004 Jan;74(1):121-7. doi: 10.1086/381053. Epub 2003 Dec 12. Erratum In: Am J Hum Genet. 2004 Apr;74(4):788.
- Musante L, Ropers HH. Genetics of recessive cognitive disorders. Trends Genet. 2014 Jan;30(1):32-9. doi: 10.1016/j.tig.2013.09.008. Epub 2013 Oct 28.
- Pabinger S, Dander A, Fischer M, Snajder R, Sperk M, Efremova M, Krabichler B, Speicher MR, Zschocke J, Trajanoski Z. A survey of tools for variant analysis of next-generation genome sequencing data. Brief Bioinform. 2014 Mar;15(2):256-78. doi: 10.1093/bib/bbs086. Epub 2013 Jan 21.
- Packer JS, Maxwell EK, O'Dushlaine C, Lopez AE, Dewey FE, Chernomorsky R, Baras A, Overton JD, Habegger L, Reid JG. CLAMMS: a scalable algorithm for calling common and rare copy number variants from exome sequencing data. Bioinformatics. 2016 Jan 1;32(1):133-5. doi: 10.1093/bioinformatics/btv547. Epub 2015 Sep 17.
- Richards S, Aziz N, Bale S, Bick D, Das S, Gastier-Foster J, Grody WW, Hegde M, Lyon E, Spector E, Voelkerding K, Rehm HL; ACMG Laboratory Quality Assurance Committee. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015 May;17(5):405-24. doi: 10.1038/gim.2015.30. Epub 2015 Mar 5.
- Van der Auwera GA, Carneiro MO, Hartl C, Poplin R, Del Angel G, Levy-Moonshine A, Jordan T, Shakir K, Roazen D, Thibault J, Banks E, Garimella KV, Altshuler D, Gabriel S, DePristo MA. From FastQ data to high confidence variant calls: the Genome Analysis Toolkit best practices pipeline. Curr Protoc Bioinformatics. 2013;43(1110):11.10.1-11.10.33. doi: 10.1002/0471250953.bi1110s43.
- Vissers LE, Gilissen C, Veltman JA. Genetic studies in intellectual disability and related disorders. Nat Rev Genet. 2016 Jan;17(1):9-18. doi: 10.1038/nrg3999. Epub 2015 Oct 27.
- Zlotogora J, Shalev SA. The consequences of consanguinity on the rates of malformations and major medical conditions at birth and in early childhood in inbred populations. Am J Med Genet A. 2010 Aug;152A(8):2023-8. doi: 10.1002/ajmg.a.33537.
- Cunniff C, Carmack JL, Kirby RS, Fiser DH. Contribution of heritable disorders to mortality in the pediatric intensive care unit. Pediatrics. 1995 May;95(5):678-81.
- FitzPatrick DR, Skeoch CH, Tolmie JL. Genetic aspects of admissions to a paediatric intensive care unit. Arch Dis Child. 1991 May;66(5):639-41. doi: 10.1136/adc.66.5.639.
- Gilissen C, Hoischen A, Brunner HG, Veltman JA. Unlocking Mendelian disease using exome sequencing. Genome Biol. 2011 Sep 14;12(9):228. doi: 10.1186/gb-2011-12-9-228.
- Hildreth A, Wigby K, Chowdhury S, Nahas S, Barea J, Ordonez P, Batalov S, Dimmock D, Kingsmore S; RCIGM Investigators. Rapid whole-genome sequencing identifies a novel homozygous NPC1 variant associated with Niemann-Pick type C1 disease in a 7-week-old male with cholestasis. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2017 Sep 1;3(5):a001966. doi: 10.1101/mcs.a001966. Print 2017 Sep.
- Kingsmore SF, Petrikin J, Willig LK, Guest E. Emergency medical genomes: a breakthrough application of precision medicine. Genome Med. 2015 Jul 30;7(1):82. doi: 10.1186/s13073-015-0201-z. eCollection 2015.
- Lalani SR. Current Genetic Testing Tools in Neonatal Medicine. Pediatr Neonatol. 2017 Apr;58(2):111-121. doi: 10.1016/j.pedneo.2016.07.002. Epub 2016 Sep 28.
- Lee H, Deignan JL, Dorrani N, Strom SP, Kantarci S, Quintero-Rivera F, Das K, Toy T, Harry B, Yourshaw M, Fox M, Fogel BL, Martinez-Agosto JA, Wong DA, Chang VY, Shieh PB, Palmer CG, Dipple KM, Grody WW, Vilain E, Nelson SF. Clinical exome sequencing for genetic identification of rare Mendelian disorders. JAMA. 2014 Nov 12;312(18):1880-7. doi: 10.1001/jama.2014.14604.
- Petrikin JE, Willig LK, Smith LD, Kingsmore SF. Rapid whole genome sequencing and precision neonatology. Semin Perinatol. 2015 Dec;39(8):623-31. doi: 10.1053/j.semperi.2015.09.009. Epub 2015 Oct 29.
- Reardon S. Fast genetic sequencing saves newborn lives. Nature. 2014 Oct 2;514(7520):13-4. doi: 10.1038/514013a. No abstract available.
- Saunders CJ, Miller NA, Soden SE, Dinwiddie DL, Noll A, Alnadi NA, Andraws N, Patterson ML, Krivohlavek LA, Fellis J, Humphray S, Saffrey P, Kingsbury Z, Weir JC, Betley J, Grocock RJ, Margulies EH, Farrow EG, Artman M, Safina NP, Petrikin JE, Hall KP, Kingsmore SF. Rapid whole-genome sequencing for genetic disease diagnosis in neonatal intensive care units. Sci Transl Med. 2012 Oct 3;4(154):154ra135. doi: 10.1126/scitranslmed.3004041.
- Smith LD, Willig LK, Kingsmore SF. Whole-Exome Sequencing and Whole-Genome Sequencing in Critically Ill Neonates Suspected to Have Single-Gene Disorders. Cold Spring Harb Perspect Med. 2015 Dec 18;6(2):a023168. doi: 10.1101/cshperspect.a023168.
- Soden SE, Saunders CJ, Willig LK, Farrow EG, Smith LD, Petrikin JE, LePichon JB, Miller NA, Thiffault I, Dinwiddie DL, Twist G, Noll A, Heese BA, Zellmer L, Atherton AM, Abdelmoity AT, Safina N, Nyp SS, Zuccarelli B, Larson IA, Modrcin A, Herd S, Creed M, Ye Z, Yuan X, Brodsky RA, Kingsmore SF. Effectiveness of exome and genome sequencing guided by acuity of illness for diagnosis of neurodevelopmental disorders. Sci Transl Med. 2014 Dec 3;6(265):265ra168. doi: 10.1126/scitranslmed.3010076.
- Thevenon J, Duffourd Y, Masurel-Paulet A, Lefebvre M, Feillet F, El Chehadeh-Djebbar S, St-Onge J, Steinmetz A, Huet F, Chouchane M, Darmency-Stamboul V, Callier P, Thauvin-Robinet C, Faivre L, Riviere JB. Diagnostic odyssey in severe neurodevelopmental disorders: toward clinical whole-exome sequencing as a first-line diagnostic test. Clin Genet. 2016 Jun;89(6):700-7. doi: 10.1111/cge.12732. Epub 2016 Apr 26.
- Willig LK, Petrikin JE, Smith LD, Saunders CJ, Thiffault I, Miller NA, Soden SE, Cakici JA, Herd SM, Twist G, Noll A, Creed M, Alba PM, Carpenter SL, Clements MA, Fischer RT, Hays JA, Kilbride H, McDonough RJ, Rosterman JL, Tsai SL, Zellmer L, Farrow EG, Kingsmore SF. Whole-genome sequencing for identification of Mendelian disorders in critically ill infants: a retrospective analysis of diagnostic and clinical findings. Lancet Respir Med. 2015 May;3(5):377-87. doi: 10.1016/S2213-2600(15)00139-3. Epub 2015 Apr 27.
- Yang Y, Muzny DM, Reid JG, Bainbridge MN, Willis A, Ward PA, Braxton A, Beuten J, Xia F, Niu Z, Hardison M, Person R, Bekheirnia MR, Leduc MS, Kirby A, Pham P, Scull J, Wang M, Ding Y, Plon SE, Lupski JR, Beaudet AL, Gibbs RA, Eng CM. Clinical whole-exome sequencing for the diagnosis of mendelian disorders. N Engl J Med. 2013 Oct 17;369(16):1502-11. doi: 10.1056/NEJMoa1306555. Epub 2013 Oct 2.
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Actual)
Finalización del estudio (Actual)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- RECHMPL17_0387
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .