- ICH GCP
- Registro de ensaios clínicos dos EUA
- Ensaio Clínico NCT03831035
Exoma rápido para diagnóstico de doenças congênitas em lactentes menores de 12 meses internados em unidade de terapia intensiva (REUNIR)
Um diagnóstico precoce de malformações congênitas e suspeitas de condições genéticas em bebês gravemente doentes é essencial para realizar cuidados específicos adaptados, prevenção e aconselhamento genético adequado. No entanto, as etiologias são várias e cada uma delas é individualmente muito rara. Graças às tecnologias de sequenciamento de última geração, os prazos de diagnóstico diminuíram drasticamente e os investigadores observaram um aumento nos rendimentos do diagnóstico.
Este estudo tem como objetivo avaliar a viabilidade do sequenciamento rápido do exoma trio (menos de 16 dias entre a assinatura do consentimento informado e a consulta para resultados aos pais) em lactentes menores de 12 meses internados em Unidade de Terapia Intensiva (UTI).
Visão geral do estudo
Status
Condições
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
Este estudo prospectivo é o primeiro estudo francês com o objetivo de avaliar a viabilidade do sequenciamento rápido do exoma trio (menos de 16 dias entre a assinatura do consentimento informado e a consulta para apresentação dos resultados aos pais) em 15 lactentes menores de 12 meses internados na Unidade de Terapia Intensiva Unidade. Os pacientes incluídos terão um ano de exame de acompanhamento.
O principal critério de avaliação é a entrega dos resultados do exoma à família antes de 16 dias. Os critérios secundários de avaliação são 1/ duração de cada etapa até o resultado 2/ obtenção do diagnóstico: identificação da etiologia 3/ ajuste do cuidado médico permitido pelo diagnóstico do exoma 4/ quantidade de sangue necessária para o diagnóstico 5/ duração da internação e número de consultas médicas no ano seguinte à inclusão.
O sequenciamento do exoma será realizado além da análise clássica normalmente prescrita. Os cuidados médicos não serão modificados até a recepção dos resultados do exoma. Após a assinatura do consentimento informado, amostras de sangue do bebê e de ambos os pais serão usadas para o sequenciamento do trio exoma, que inclui 3 etapas: a etapa analítica (extração de DNA da amostra de sangue e sequenciamento de alto rendimento), a etapa bioinformática e a etapa de interpretação .
O estudo inclui quatro consultas médicas:
1/consulta com um geneticista para inclusão, 2/consulta com um geneticista para dar os resultados do exoma, 3/ consulta 3 meses após os resultados para a confirmação sangrenta do resultado do exoma, 4/ consulta um ano após a inclusão para acompanhamento médico.
Tipo de estudo
Inscrição (Real)
Contactos e Locais
Locais de estudo
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Hérault
-
Montpellier, Hérault, França, 34295
- Medical genetics Arnaud de Villeneuve
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-
Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- Lactente menor de 12 meses, internado na UTI.
- Lactente com múltiplas malformações congênitas ou sintomas neurológicos para os quais se suspeita de origem genética, mas não diagnosticada geneticamente.
- Bebê para quem ambos os pais biológicos deram consentimento para o estudo, análise genética para eles e seus filhos.
- Bebê e pais registrados no serviço nacional de saúde francês
Critério de exclusão:
- Ausência de uma ou ambas amostras parentais.
- Diagnóstico genético preciso feito pré ou pós-natalmente com estudos de metilação cromossômica (isto é: síndrome de Down), Sanger (isto é: amiotrofia espinhal infantil) (isto é: síndrome de Prader-Willi) ou amplificação trigêmea (isto é: miotonia neonatal de Steinert).
- Evidência clínica forte para estudos de metilação cromossômica (isto é: síndrome de Down), Sanger (isto é: amiotrofia espinhal infantil) (isto é: síndrome de Prader-Willi) ou amplificação trigêmea (isto é: miotonia neonatal de Steinert).
- Impossibilidade de um ou ambos os progenitores derem o seu consentimento
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Modelos de observação: Coorte
- Perspectivas de Tempo: Prospectivo
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
|---|---|
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15 pacientes e ambos os pais.
Os pacientes com idade igual ou inferior a 12 meses internados na UTI sofrem de múltiplas malformações congênitas e/ou sintomas neurológicos.
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O sequenciamento do exoma requer etapas analíticas, bioinformáticas e de interpretação.
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Rendimento dos resultados do exoma dados à família antes de 16 dias
Prazo: 16 dias no máximo após a inclusão
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número de dias entre a coleta da amostra e os resultados
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16 dias no máximo após a inclusão
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Duração de cada etapa até os resultados (etapa analítica, etapa bioinformática, etapa de interpretação).
Prazo: 16 dias no máximo após a inclusão
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número de dias entre a coleta da amostra e os resultados
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16 dias no máximo após a inclusão
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Rendimento diagnóstico: identificação da etiologia
Prazo: 3 meses
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número de dias entre a coleta da amostra e a confirmação diagnóstica
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3 meses
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Ajuste de cuidados médicos permitido pelo diagnóstico do exoma
Prazo: 16 dias no máximo após a inclusão
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Quaisquer acréscimos ou exclusões de um exame diagnóstico, atendimento médico específico para a patologia diagnosticada ou triagem de uma complicação conhecida
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16 dias no máximo após a inclusão
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Quantidade de sangue necessária para obter o diagnóstico
Prazo: 16 dias no máximo após a inclusão
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volume de sangue necessário para obter o diagnóstico
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16 dias no máximo após a inclusão
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Quantidade de sangue necessária para obter o diagnóstico
Prazo: 16 dias no máximo após a inclusão
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número de amostras necessárias para obter o diagnóstico
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16 dias no máximo após a inclusão
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duração da internação no ano seguinte à inclusão
Prazo: um ano após a inclusão
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número de dias de internação no ano
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um ano após a inclusão
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número de consultas médicas no ano seguinte à inclusão
Prazo: um ano após a inclusão
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número de consultas médicas no ano
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um ano após a inclusão
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Marjolaine WILLEMS, Medical genetics Arnaud de Villeneuve
Publicações e links úteis
Publicações Gerais
- Acikalin A, Bagir EK, Torun G, Ates BT, Erdogan S, Uguz A, Ergin M, Buyukkurt S, Ozgunen FT, Tunali N, Gumurdulu D. Perinatal autopsy evaluation of 2150 autopsies in the Cukurova region of Turkey. Turk Patoloji Derg. 2014;30(3):189-94. doi: 10.5146/tjpath.2014.01266.
- Baird PA, Anderson TW, Newcombe HB, Lowry RB. Genetic disorders in children and young adults: a population study. Am J Hum Genet. 1988 May;42(5):677-93.
- Bonnet D. [Genetics of congenital heart diseases]. Presse Med. 2017 Jun;46(6 Pt 1):612-619. doi: 10.1016/j.lpm.2017.05.014. Epub 2017 Jun 2. French.
- Dhiman V. Molecular Genetics of Epilepsy: A Clinician's Perspective. Ann Indian Acad Neurol. 2017 Apr-Jun;20(2):96-102. doi: 10.4103/aian.AIAN_447_16.
- Grandemange S, Sanchez E, Louis-Plence P, Tran Mau-Them F, Bessis D, Coubes C, Frouin E, Seyger M, Girard M, Puechberty J, Costes V, Rodiere M, Carbasse A, Jeziorski E, Portales P, Sarrabay G, Mondain M, Jorgensen C, Apparailly F, Hoppenreijs E, Touitou I, Genevieve D. A new autoinflammatory and autoimmune syndrome associated with NLRP1 mutations: NAIAD (NLRP1-associated autoinflammation with arthritis and dyskeratosis). Ann Rheum Dis. 2017 Jul;76(7):1191-1198. doi: 10.1136/annrheumdis-2016-210021. Epub 2016 Dec 13.
- Hack M, Taylor HG, Drotar D, Schluchter M, Cartar L, Andreias L, Wilson-Costello D, Klein N. Chronic conditions, functional limitations, and special health care needs of school-aged children born with extremely low-birth-weight in the 1990s. JAMA. 2005 Jul 20;294(3):318-25. doi: 10.1001/jama.294.3.318.
- McCandless SE, Brunger JW, Cassidy SB. The burden of genetic disease on inpatient care in a children's hospital. Am J Hum Genet. 2004 Jan;74(1):121-7. doi: 10.1086/381053. Epub 2003 Dec 12. Erratum In: Am J Hum Genet. 2004 Apr;74(4):788.
- Musante L, Ropers HH. Genetics of recessive cognitive disorders. Trends Genet. 2014 Jan;30(1):32-9. doi: 10.1016/j.tig.2013.09.008. Epub 2013 Oct 28.
- Pabinger S, Dander A, Fischer M, Snajder R, Sperk M, Efremova M, Krabichler B, Speicher MR, Zschocke J, Trajanoski Z. A survey of tools for variant analysis of next-generation genome sequencing data. Brief Bioinform. 2014 Mar;15(2):256-78. doi: 10.1093/bib/bbs086. Epub 2013 Jan 21.
- Packer JS, Maxwell EK, O'Dushlaine C, Lopez AE, Dewey FE, Chernomorsky R, Baras A, Overton JD, Habegger L, Reid JG. CLAMMS: a scalable algorithm for calling common and rare copy number variants from exome sequencing data. Bioinformatics. 2016 Jan 1;32(1):133-5. doi: 10.1093/bioinformatics/btv547. Epub 2015 Sep 17.
- Richards S, Aziz N, Bale S, Bick D, Das S, Gastier-Foster J, Grody WW, Hegde M, Lyon E, Spector E, Voelkerding K, Rehm HL; ACMG Laboratory Quality Assurance Committee. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015 May;17(5):405-24. doi: 10.1038/gim.2015.30. Epub 2015 Mar 5.
- Van der Auwera GA, Carneiro MO, Hartl C, Poplin R, Del Angel G, Levy-Moonshine A, Jordan T, Shakir K, Roazen D, Thibault J, Banks E, Garimella KV, Altshuler D, Gabriel S, DePristo MA. From FastQ data to high confidence variant calls: the Genome Analysis Toolkit best practices pipeline. Curr Protoc Bioinformatics. 2013;43(1110):11.10.1-11.10.33. doi: 10.1002/0471250953.bi1110s43.
- Vissers LE, Gilissen C, Veltman JA. Genetic studies in intellectual disability and related disorders. Nat Rev Genet. 2016 Jan;17(1):9-18. doi: 10.1038/nrg3999. Epub 2015 Oct 27.
- Zlotogora J, Shalev SA. The consequences of consanguinity on the rates of malformations and major medical conditions at birth and in early childhood in inbred populations. Am J Med Genet A. 2010 Aug;152A(8):2023-8. doi: 10.1002/ajmg.a.33537.
- Cunniff C, Carmack JL, Kirby RS, Fiser DH. Contribution of heritable disorders to mortality in the pediatric intensive care unit. Pediatrics. 1995 May;95(5):678-81.
- FitzPatrick DR, Skeoch CH, Tolmie JL. Genetic aspects of admissions to a paediatric intensive care unit. Arch Dis Child. 1991 May;66(5):639-41. doi: 10.1136/adc.66.5.639.
- Gilissen C, Hoischen A, Brunner HG, Veltman JA. Unlocking Mendelian disease using exome sequencing. Genome Biol. 2011 Sep 14;12(9):228. doi: 10.1186/gb-2011-12-9-228.
- Hildreth A, Wigby K, Chowdhury S, Nahas S, Barea J, Ordonez P, Batalov S, Dimmock D, Kingsmore S; RCIGM Investigators. Rapid whole-genome sequencing identifies a novel homozygous NPC1 variant associated with Niemann-Pick type C1 disease in a 7-week-old male with cholestasis. Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2017 Sep 1;3(5):a001966. doi: 10.1101/mcs.a001966. Print 2017 Sep.
- Kingsmore SF, Petrikin J, Willig LK, Guest E. Emergency medical genomes: a breakthrough application of precision medicine. Genome Med. 2015 Jul 30;7(1):82. doi: 10.1186/s13073-015-0201-z. eCollection 2015.
- Lalani SR. Current Genetic Testing Tools in Neonatal Medicine. Pediatr Neonatol. 2017 Apr;58(2):111-121. doi: 10.1016/j.pedneo.2016.07.002. Epub 2016 Sep 28.
- Lee H, Deignan JL, Dorrani N, Strom SP, Kantarci S, Quintero-Rivera F, Das K, Toy T, Harry B, Yourshaw M, Fox M, Fogel BL, Martinez-Agosto JA, Wong DA, Chang VY, Shieh PB, Palmer CG, Dipple KM, Grody WW, Vilain E, Nelson SF. Clinical exome sequencing for genetic identification of rare Mendelian disorders. JAMA. 2014 Nov 12;312(18):1880-7. doi: 10.1001/jama.2014.14604.
- Petrikin JE, Willig LK, Smith LD, Kingsmore SF. Rapid whole genome sequencing and precision neonatology. Semin Perinatol. 2015 Dec;39(8):623-31. doi: 10.1053/j.semperi.2015.09.009. Epub 2015 Oct 29.
- Reardon S. Fast genetic sequencing saves newborn lives. Nature. 2014 Oct 2;514(7520):13-4. doi: 10.1038/514013a. No abstract available.
- Saunders CJ, Miller NA, Soden SE, Dinwiddie DL, Noll A, Alnadi NA, Andraws N, Patterson ML, Krivohlavek LA, Fellis J, Humphray S, Saffrey P, Kingsbury Z, Weir JC, Betley J, Grocock RJ, Margulies EH, Farrow EG, Artman M, Safina NP, Petrikin JE, Hall KP, Kingsmore SF. Rapid whole-genome sequencing for genetic disease diagnosis in neonatal intensive care units. Sci Transl Med. 2012 Oct 3;4(154):154ra135. doi: 10.1126/scitranslmed.3004041.
- Smith LD, Willig LK, Kingsmore SF. Whole-Exome Sequencing and Whole-Genome Sequencing in Critically Ill Neonates Suspected to Have Single-Gene Disorders. Cold Spring Harb Perspect Med. 2015 Dec 18;6(2):a023168. doi: 10.1101/cshperspect.a023168.
- Soden SE, Saunders CJ, Willig LK, Farrow EG, Smith LD, Petrikin JE, LePichon JB, Miller NA, Thiffault I, Dinwiddie DL, Twist G, Noll A, Heese BA, Zellmer L, Atherton AM, Abdelmoity AT, Safina N, Nyp SS, Zuccarelli B, Larson IA, Modrcin A, Herd S, Creed M, Ye Z, Yuan X, Brodsky RA, Kingsmore SF. Effectiveness of exome and genome sequencing guided by acuity of illness for diagnosis of neurodevelopmental disorders. Sci Transl Med. 2014 Dec 3;6(265):265ra168. doi: 10.1126/scitranslmed.3010076.
- Thevenon J, Duffourd Y, Masurel-Paulet A, Lefebvre M, Feillet F, El Chehadeh-Djebbar S, St-Onge J, Steinmetz A, Huet F, Chouchane M, Darmency-Stamboul V, Callier P, Thauvin-Robinet C, Faivre L, Riviere JB. Diagnostic odyssey in severe neurodevelopmental disorders: toward clinical whole-exome sequencing as a first-line diagnostic test. Clin Genet. 2016 Jun;89(6):700-7. doi: 10.1111/cge.12732. Epub 2016 Apr 26.
- Willig LK, Petrikin JE, Smith LD, Saunders CJ, Thiffault I, Miller NA, Soden SE, Cakici JA, Herd SM, Twist G, Noll A, Creed M, Alba PM, Carpenter SL, Clements MA, Fischer RT, Hays JA, Kilbride H, McDonough RJ, Rosterman JL, Tsai SL, Zellmer L, Farrow EG, Kingsmore SF. Whole-genome sequencing for identification of Mendelian disorders in critically ill infants: a retrospective analysis of diagnostic and clinical findings. Lancet Respir Med. 2015 May;3(5):377-87. doi: 10.1016/S2213-2600(15)00139-3. Epub 2015 Apr 27.
- Yang Y, Muzny DM, Reid JG, Bainbridge MN, Willis A, Ward PA, Braxton A, Beuten J, Xia F, Niu Z, Hardison M, Person R, Bekheirnia MR, Leduc MS, Kirby A, Pham P, Scull J, Wang M, Ding Y, Plon SE, Lupski JR, Beaudet AL, Gibbs RA, Eng CM. Clinical whole-exome sequencing for the diagnosis of mendelian disorders. N Engl J Med. 2013 Oct 17;369(16):1502-11. doi: 10.1056/NEJMoa1306555. Epub 2013 Oct 2.
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Real)
Conclusão do estudo (Real)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
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Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- RECHMPL17_0387
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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