COVID-19: 건강한 오레곤(Oregon Saludable): 함께 할 수 있습니다(Juntos Podemos) (OSJP)

총 38개 커뮤니티에서 격주로(격주) 테스트 이벤트가 열리는 테스트 사이트를 구축했습니다. 이 연구는 카운티 내의 사이트 수준에서 카운티를 무작위화했습니다. 조사관은 샘플 크기가 작기 때문에 카운티별로 선험적 계층화를 사용했습니다. 카운티에 있는 모든 사이트의 절반은 통제 조건(일반적인 서비스)에 할당되었고 나머지 절반은 개입 조건(Promotores de Salud)에 할당되었습니다. 무작위로 할당된 커뮤니티는 두 가지 아웃리치 전략 중 하나를 받습니다. 평소와 같은 서비스(문화 맞춤형 전단지, 라디오 발표, 소셜 미디어 게시물, 현장의 건강 행동 팜플렛) 또는 평소와 같은 서비스와 유급의 신뢰할 수 있는 커뮤니티 구성원이 도달하는 Promotores de Salud 개입 무료 검사 서비스를 활용하고 COVID-19 관련 건강 행동을 개선하도록 동기를 부여하기 위해 지역 사회 구성원에게 공개합니다. Promotores de Salud 개입은 라틴계 커뮤니티 구성원과의 관계를 구축하고 신뢰를 촉진하도록 설계되었습니다.

각 사이트에서 테스트한 라틴계 커뮤니티 구성원의 비율을 평가하기 위해 조사관은 테스트를 처리하는 오레곤 대학(UO) COVID-19 임상 유전체학 연구소에서 연구에 제공한 비식별 건강 정보를 사용할 것입니다. 건강 행동을 평가하기 위해 각 사이트의 성인 참가자 하위 집합이 기준선에서 관리되고 30일 후에 다시 실시되는 연구 조사에 참여하도록 초대됩니다. 두 가지 접근 방식에 대해 이 연구는 전체 카운티 인구 통계에 비해 라틴계 커뮤니티 구성원의 참여 ​​비율이 더 높을 것으로 예상합니다. 전체 연구 인구의 85%는 히스패닉계이고 15%는 비히스패닉계일 것으로 예상되며, 개인의 84%는 두 인종 그룹 모두에서 백인으로 식별되고 나머지 16%는 아프리카계 미국인, 아시아인, 태평양 섬 주민, 아메리칸 인디언/알래스카 원주민으로 식별됩니다. , 또는 하나 이상의 인종. 연구 그룹당 19개 사이트(총 38개)와 개입(n = 1,800) 또는 통제 조건(n = 1,800)에 최대 약 3,600명의 성인 개인이 있을 것입니다.

이 연구는 또한 오레곤 대학의 COVID-19 임상 유전체학 실험실의 환자 등록부 데이터를 활용합니다.

품질 보증, 데이터 확인, 소스 데이터 검증, 데이터 사전 및 표준 운영 절차: 데이터 및 생체 표본은 테스트 사이트에서 직접 수집되며 참가자와의 직접적인 상호 작용이 필요합니다. SARS-CoV-2 감염 결과를 각 참여자에게 다시 보고하기 위해 이름, 생년월일, 연락처 정보를 수집합니다. 오레곤 보건 당국에 대한 보고 요구 사항을 충족하기 위해 검사를 받은 각 사람에 대해 거주 카운티 및 우편 번호도 수집됩니다. 개입의 효능을 평가하는 데 사용되는 데이터에는 진단 테스트 절차의 일부로 수집된 데이터에서 파생된 집계 변수가 포함되며 테스트 사이트 수준에서 집계됩니다(예: 수행된 테스트, 인종 및 민족 비율 등).

SARS-CoV-2 샘플 수집을 위해 테스트 진행자는 참가자가 직접 수집하는 과정을 안내합니다. 전비공의 경우, 참여자들에게 비강 면봉을 콧구멍에 약 1cm 정도 넣고 회전시켜 10초 동안 비강 막에 접촉시킨 다음 다른 쪽 콧구멍에 동일한 면봉으로 이 과정을 반복하도록 지시합니다. 자녀가 10세 미만이거나 미성년 자녀가 부모의 도움을 요청하는 경우 부모는 자녀를 위해 샘플을 수집하도록 지시받습니다. 테스트 사이트 직원은 샘플 수집에서 손재주가 낮거나 신체 장애가 있는 참가자를 지원할 수 있습니다. 샘플 수집 중에 부상을 입은 경우 파트너 커뮤니티 조직 직원이 참가자를 적절한 의료 리소스로 안내합니다. 샘플은 각각 500마이크로리터(μl)의 DNA/RNA 실드가 들어 있는 멸균 바코드 바이알(1ml 매트릭스, 바코드 스크류 캡 튜브)에 넣습니다. 그런 다음 각 Matrix 튜브를 단단히 닫고 8행 12열(96개 위치의 8x12 랙)이 있는 표준 플라스틱 실험실 미세 원심 분리기 튜브 랙에 배치합니다. 그런 다음 이 랙은 가속 과산화수소(H202)에 잠시 담가서 외부 오염을 제거합니다. 그런 다음 각 96개 위치 마이크로 원심 분리기 튜브 랙에 라벨을 붙이고 4Cdegrees의 젖은 얼음이 담긴 멸균 임시 용기에 넣습니다. 가능하면 각 현장에서 랙을 주기적으로 냉장고(4C) 또는 냉동고(-20C)로 옮겨 보관합니다. 하루가 끝나면 모든 랙은 젖은 얼음에 담겨 UO의 COVID-19 임상 유전체학 연구소로 운송되어 수집 후 48시간 이내, 바람직하게는 12-24시간 이내에 도착할 것입니다. 시험 장소가 손으로 운반하기에 너무 먼 곳에 있는 경우 튜브 랙을 고정하고 드라이아이스에 특급 방법으로 배송합니다.

각 96웰 수집 플레이트는 표준 FDA 승인 Thermo Fisher TaqPath 분석 프로토콜을 사용하여 분자 처리를 진행합니다. 이 승인된 프로토콜의 모든 단계는 적절한 시약, 부피, 적절한 양성 및 음성 대조군 포함을 포함하여 정확하게 따를 것입니다. 또한 조사관은 지정된 대로 정확하게 소프트웨어 분석 시스템과 매개변수를 사용합니다. 첫째, RNA는 MagMax Viral/Pathogen Nucleic Acid Isolation Kit(ThermoFisher, #100081242)를 사용하여 각 웰에서 추출하여 잠재적인 억제 오염을 제거하고 후속 qPCR 프로토콜의 감도와 일관성을 높입니다. 처리할 샘플 수에 따라 RNA 추출은 다중 채널 파이펫터를 사용하여 손으로 수행하거나 Hamilton Robot을 사용하여 수행합니다. 그런 다음 정제된 RNA는 처리할 샘플 수에 따라 96웰 또는 384웰 QuantStudio5(QS5) 열순환기에서 TaqPath RT-PCR COVID-19 키트를 사용하여 분석을 위해 역전사됩니다. 실험실 기술자가 384개의 샘플을 처리해야 하는 경우 Hamilton 액체 처리 로봇(Hamilton, Microlab VANTAGE 2.0)을 사용하여 4개의 96웰 플레이트 각각에서 후속 qPCR 증폭을 위해 384웰 플레이트 형식으로 분주합니다. 이 RT-PCR 프로세스에서 프로브는 3개의 SARS-CoV-2 유전자(ORF1ab, N 단백질 및 S 단백질)에 대한 3개의 고유한 정방향 및 역방향 프라이머에 어닐링합니다.

모든 실험실 및 보고는 바코드, 로보틱스, 96 및 384웰 qPCR 기계, L7 정보학(https://l7informatics. com/). 이러한 시스템 자동화 및 LIMS 사용을 통해 처리량(하루에 최대 수천 개의 샘플)이 증가하고 LIMS를 통해 신속한 분석 및 결과 자동 보고가 가능합니다. qPCR 데이터는 Applied Biosystems COVID-19 해석 소프트웨어를 사용하여 분석하기 위해 LIMS 시스템에 저장되어 샘플에 바이러스가 있는지('양성' 사례), 없거나 불확실한지 여부를 정성적으로 평가할 수 있습니다. COVID-19-MAP 실험실의 LIMS 시스템을 사용하면 이 분석 소프트웨어를 전체 샘플 추적 워크플로 파이프라인의 적절한 단계에 통합할 수 있으므로 즉각적인 결과를 데이터베이스의 적절한 바코드에 연결할 수 있습니다. 또한 LIMS 시스템은 CLIA 검증 프로세스의 각 단계를 문서화하기 위해 모든 장비(예: 로봇 및 qPCR 기계)와 근거리 통신망(LAN)을 통해 연결되고 통신합니다. 각 샘플에 대한 결과 및 처리 중 단계에 대한 관련 메타데이터는 할당된 각 바코드와 연결되고 적절하게 오레곤 보건 당국, 해당 카운티 보건 부서 및 개인에게 배포될 수 있습니다. 검사 결과는 개인 및/또는 보건 당국에 48시간 이내에, 늦어도 4일 이내에 제공됩니다.

테스트가 수행된 후 연구원은 UO의 CLIA 임상 유전체학 실험실에서 준비한 집계, 커뮤니티 수준(예: 개수 및 유병률) 비식별 데이터에 액세스할 수 있습니다. 데이터에는 사이트 우편 번호, 참가자 우편 번호, 테스트 결과 및 테스트 날짜의 네 가지 보호된 건강 식별자가 포함됩니다. 또한 연령 범위, 인종 및 민족과 같은 보호되지 않는 건강 정보인 인구 통계 데이터도 포함됩니다. 이 데이터는 SARS-COV-2 검사에서 라틴계 커뮤니티 구성원의 참여를 늘리기 위한 아웃리치 활동을 평가하는 데 사용됩니다. 연구의 이러한 측면에 대한 주요 결과는 라틴계 개인의 사이트 수준 테스트 비율입니다.

샘플 크기 평가, 누락 데이터 계획, 통계 분석 계획: Promotores 개입의 1차 효능 평가를 위해 조사관은 COVID-19와 같은 연속 결과에 대한 표준 공분산 정규 이론 분석(ANCOVA) 및 자동 회귀 선형 모델링을 사용합니다. 지식; 그리고 그들은 각 지리적 사이트에서 테스트된 라틴계의 비율과 같은 카운트 및 정렬된 범주 결과에 대해 사전 사후 일반화 선형 모델링을 사용할 것입니다. 개입 설계에서 참가자의 비독립성을 해결하기 위해 연구자는 선형 혼합 모델을 추정합니다. 누락된 데이터의 두 가지 주요 원인, 항목 무응답 및 시간 경과에 따른 감소가 예상됩니다. 드롭아웃의 경우 조사관은 표준 소모 분석을 수행하여 소모자와 완료자 간의 기본 특성을 비교합니다. 그들은 상당한 차이를 다루기 위해 성향 점수 매칭 절차와 컴파일러 평균 인과 효과 모델을 고려할 것입니다. 항목 무응답 및 척도 점수 개발의 경우 조사관은 채점을 위해 척도 항목의 70%가 있어야 합니다. 그들은 규모 수준 데이터가 웨이브 내에서 그리고 웨이브 전체에서 완전히 무작위(MCAR)로 누락되었는지 여부를 테스트합니다. 데이터가 MCAR이 아닌 경우 무작위 누락 가정(MAR, 즉 데이터가 개입 응답 변수의 누락 값에 의존하지 않음)에 따라 조사자는 SEM에 대해 권장되는 두 가지 접근 방식인 전체 정보 최대 가능성(FIML) 또는 다중 전가(MI). 이러한 접근 방식은 데이터가 무시할 수 없는 누락일 때 문제가 될 수 있지만 특히 손실과 관련된 공변량의 경우 누락을 처리하는 데 여전히 권장됩니다. 두 방법 모두 목록별 또는 쌍별 삭제 또는 평균 대체보다 더 효율적인 표준 오류를 제공합니다. 누락된 데이터 또는 감소가 공변량과 관련이 있는 경우 조사자는 가설 테스트에 적절한 공변량을 포함합니다. 사전 사후 개별 수준 기준 결과의 경우, 사이트당 약 50~100명의 참가자와 감소(n = 2160), 알파 수준 .05 및 .05~.20 범위의 클래스 내 상관 관계가 있는 38개 사이트는 효과를 감지할 수 있는 힘을 제공합니다. .19에서 .32까지, 각각 (작거나 보통).

마지막으로 데이터는 국립 Duke Coordination and Data Collection Center(CDCC)의 계층 1 "공통 데이터 요소"에 따라 수집됩니다. CDCC는 각 개별 RADx-UP 프로젝트를 직접 지원하여 참여, 홍보, 테스트 전략을 최적화하고 RADx-UP 프로젝트 간에 공동 학습 기회를 촉진합니다. 샘플, 분석 플랫폼, 분석 절차 및 테스트 결과를 얻기 위한 주요 결과 데이터 및 테스트 절차는 컨소시엄 전체에서 조화를 위해 일관된 방식으로 수집되고 표시되며 코로나 바이러스 지원, 구호 및 경제에 따른 테스트 보고 요구 사항과 통합됩니다. 보안법(CARES 법).