COVID-19: Gesundes Oregon (Oregon Saludable): Gemeinsam können wir (Juntos Podemos) (OSJP)

Insgesamt 38 Gemeinden haben einen Teststandort eingerichtet, an dem alle zwei Wochen (zweiwöchentlich) Testveranstaltungen stattfinden. Die Studie randomisierte Landkreise auf Standortebene innerhalb des Landkreises. Die Ermittler verwendeten a priori eine Stratifizierung nach Landkreisen, da die Stichprobengröße klein ist. Die Hälfte aller Standorte in einem Landkreis wurde der Kontrollbedingung (Services as usual) und die andere Hälfte der Interventionsbedingung (Promotores de Salud) zugeordnet. Zufällig zugewiesene Gemeinden erhalten eine von zwei Outreach-Strategien: Dienstleistungen wie gewohnt (kulturell zugeschnittene Flyer, Radioankündigungen, Social-Media-Beiträge, Broschüre zum Gesundheitsverhalten vor Ort) oder Dienstleistungen wie gewohnt plus die Intervention von Promotores de Salud, bei der ein bezahltes, vertrauenswürdiges Community-Mitglied erreicht Community-Mitgliedern, um sie zu motivieren, die kostenlosen Testdienste zu nutzen und das Gesundheitsverhalten im Zusammenhang mit COVID-19 zu verbessern. Die Intervention von Promotores de Salud wurde entwickelt, um Beziehungen zu Mitgliedern der Latinx-Community aufzubauen und Vertrauen zu fördern.

Um den Anteil der an jedem Standort getesteten Mitglieder der Latinx-Community zu bewerten, verwenden die Ermittler anonymisierte Gesundheitsinformationen, die der Studie vom COVID-19-Labor für klinische Genomik der University of Oregon (UO) zur Verfügung gestellt wurden, das die Tests verarbeitet. Um das Gesundheitsverhalten zu bewerten, wird eine Untergruppe erwachsener Teilnehmer an jedem Standort eingeladen, an einer Forschungsumfrage teilzunehmen, die zu Studienbeginn und erneut 30 Tage später durchgeführt wird. Für beide Ansätze geht die Studie davon aus, dass im Verhältnis zur Gesamtbevölkerung des Landkreises ein größerer Anteil der Mitglieder der Latinx-Community eingebunden wird. Die Gesamtpopulation der Studie wird voraussichtlich zu 85 % aus Hispanos und zu 15 % aus Nicht-Hispanern bestehen, wobei sich 84 % der Personen in beiden ethnischen Gruppen als Weiße und die restlichen 16 % als Afroamerikaner, Asiaten, Pazifikinsulaner, Indianer/Eingeborene Alaskas identifizieren , oder mehr als ein Rennen. Es wird 19 Standorte pro Studiengruppe (insgesamt 38) und bis zu etwa 3.600 erwachsene Personen in den Interventions- (n = 1.800) oder Kontrollbedingungen (n = 1.800) geben.

Diese Studie nutzt auch Daten aus einem Patientenregister des klinischen COVID-19-Genomiklabors der University of Oregon.

Qualitätssicherung, Datenprüfungen, Überprüfung der Quelldaten, Datenwörterbuch und Standardarbeitsanweisungen: Daten und Bioproben werden persönlich an den Teststandorten gesammelt, was eine direkte Interaktion mit den Teilnehmern erfordert. Um die SARS-CoV-2-Infektionsergebnisse an jeden Teilnehmer zurückzumelden, werden Name, Geburtsdatum und Kontaktinformationen gesammelt. Um die Meldepflichten gegenüber der Gesundheitsbehörde von Oregon zu erfüllen, werden für jede getestete Person auch der Landkreis und die Postleitzahl erfasst. Daten, die zur Bewertung der Wirksamkeit der Intervention verwendet werden, beinhalten aggregierte Variablen, die aus Daten abgeleitet werden, die im Rahmen des diagnostischen Testverfahrens gesammelt wurden, und werden auf der Ebene des Testzentrums aggregiert (z. B. durchgeführte Tests, Rassen- und ethnische Zugehörigkeitsprozentsätze usw.).

Für die Entnahme von SARS-CoV-2-Proben führen Testmoderatoren die Teilnehmer durch den Selbstentnahmeprozess. Bei vorderen Nasenlöchern werden die Teilnehmer angewiesen, den Nasentupfer etwa 1 cm in ihr Nasenloch einzuführen und ihn zu drehen, wobei sie 10 Sekunden lang Kontakt mit der Nasenschleimhaut herstellen und dann den Vorgang mit demselben Tupfer im anderen Nasenloch wiederholen. Eltern werden angewiesen, die Probe für ihr Kind zu entnehmen, wenn das Kind unter 10 Jahre alt ist oder wenn das minderjährige Kind elterliche Unterstützung anfordert. Das Personal des Testzentrums kann Teilnehmern mit geringer Geschicklichkeit oder körperlichen Beeinträchtigungen bei der Probenentnahme behilflich sein. Im Falle einer Verletzung während der Probenentnahme wird das Personal der Partnerorganisation den Teilnehmer an die entsprechenden medizinischen Einrichtungen verweisen. Die Proben werden in sterile Fläschchen mit Barcode (1 ml Matrix, Röhrchen mit Schraubverschluss) gefüllt, die jeweils 500 Mikroliter (μl) DNA/RNA Shield enthalten. Jedes Matrix-Röhrchen wird dann fest verschlossen und in ein standardmäßiges Mikrozentrifugen-Röhrchengestell aus Kunststoff für das Labor mit acht Reihen und zwölf Spalten (8 x 12 Gestell mit 96 Positionen) gestellt. Dieses Rack wird dann extern durch kurzes Eintauchen in beschleunigtes Wasserstoffperoxid (H2O2) dekontaminiert. Jedes Mikrozentrifugenröhrchengestell mit 96 Positionen wird dann etikettiert und in einen sterilen temporären Behälter mit Nasseis bei 4 °C gestellt. Wenn es an jedem Standort möglich ist, werden die Gestelle zur Lagerung regelmäßig entweder in einen Kühlschrank (4 °C) oder einen Gefrierschrank (-20 °C) überführt. Am Ende des Tages werden alle Gestelle auf nassem Eis zum Labor für klinische COVID-19-Genomik bei UO transportiert, um sicherzustellen, dass sie nicht länger als 48 Stunden nach der Entnahme und vorzugsweise innerhalb von 12 bis 24 Stunden ankommen. Wenn die Teststelle für den Handtransport zu distal liegt, werden die Röhrchengestelle gesichert und per Express-Methode auf Trockeneis versandt.

Jede 96-Well-Sammelplatte wird als nächstes unter Verwendung des standardmäßigen, von der FDA zugelassenen Thermo Fisher TaqPath-Analyseprotokolls der molekularen Verarbeitung unterzogen. Alle Schritte dieses genehmigten Protokolls werden genau befolgt, einschließlich der geeigneten Reagenzien, Volumina und Einbeziehung geeigneter positiver und negativer Kontrollen. Darüber hinaus verwenden die Ermittler das Softwareanalysesystem und die Parameter genau wie angegeben. Zunächst wird RNA aus jeder Vertiefung mit dem MagMax Viral/Pathogen Nucleic Acid Isolation Kit (ThermoFisher, Nr. 100081242) extrahiert, das potenziell hemmende Kontamination entfernt und die Empfindlichkeit und Konsistenz nachfolgender qPCR-Protokolle erhöht. Abhängig von der Anzahl der zu verarbeitenden Proben erfolgt die RNA-Extraktion entweder manuell mit Mehrkanalpipetten oder durch den Einsatz des Hamilton-Roboters. Die gereinigte RNA wird dann zur Analyse mit dem TaqPath RT-PCR COVID-19 Kit auf 96-Well- oder 384-Well-QuantStudio5 (QS5)-Thermocyclern je nach Anzahl der zu verarbeitenden Proben retrotranskribiert. Wenn die Labortechniker 384 Proben verarbeiten müssen, verwenden sie den Hamilton-Liquid-Handling-Roboter (Hamilton, Microlab VANTAGE 2.0), um von jeder der Vier-96-Well-Platten in das 384-Well-Plattenformat für die anschließende qPCR-Amplifikation zu aliquotieren. Bei diesem RT-PCR-Prozess annealisieren Sonden an drei einzigartige Forward- und Reverse-Primer für drei SARS-CoV-2-Gene: ORF1ab, N-Protein und S-Protein.

Das gesamte Labor und die Berichterstellung werden durch die Verwendung von Barcodes, Robotik, 96- und 384-Well-qPCR-Maschinen und die Verwendung eines vollständig HIPAA- und CAP3-konformen Laborinformationsmanagementsystems (LIMS) automatisiert, das von L7 Informatics (https://l7informatics. com/). Diese Systemautomatisierungen und die Verwendung von LIMS ermöglichen einen erhöhten Durchsatz (bis zu mehreren tausend Proben pro Tag) und eine schnelle Analyse und automatisierte Berichterstellung von Ergebnissen durch das LIMS. Die qPCR-Daten werden im LIMS-System zur Analyse mit der Applied Biosystems COVID-19 Interpretive Software gespeichert, um eine qualitative Beurteilung zu ermöglichen, ob das Virus in der Probe vorhanden ist (ein „positiver“ Fall), nicht vorhanden oder unsicher ist. Das LIMS-System im COVID-19-MAP-Labor ermöglicht die Integration dieser Analysesoftware in den entsprechenden Schritt der gesamten Probenverfolgungs-Workflow-Pipeline, und daher kann das unmittelbare Ergebnis mit dem entsprechenden Barcode in der Datenbank verknüpft werden. Darüber hinaus ist das LIMS-System verbunden und kommuniziert über ein lokales Netzwerk (LAN) mit allen Geräten (z. B. Robotern und qPCR-Maschinen), um jeden Schritt des Prozesses für die CLIA-Validierung zu dokumentieren. Die Ergebnisse für jede Probe und die zugehörigen Metadaten zu den Schritten während der Verarbeitung werden dann jedem zugewiesenen Barcode zugeordnet und können dann gegebenenfalls an die Gesundheitsbehörde von Oregon, das zuständige Gesundheitsamt des Landkreises und die Person weitergegeben werden. Die Testergebnisse werden der Person und/oder der Gesundheitsbehörde innerhalb von 48 Stunden und spätestens nach 4 Tagen zur Verfügung gestellt.

Nachdem die Tests durchgeführt wurden, haben die Forscher Zugriff auf aggregierte, anonymisierte Daten auf Gemeindeebene (z. B. Anzahl und Prävalenzraten), die vom klinischen Genomiklabor CLIA der UO erstellt wurden. Die Daten umfassen vier geschützte Gesundheitsidentifikatoren: Standort-Postleitzahl, Teilnehmer-Postleitzahl, Testergebnis und Testdatum. Es wird auch demografische Daten enthalten, die keine geschützten Gesundheitsinformationen sind, wie Altersgruppe, Rasse und ethnische Zugehörigkeit. Diese Daten werden verwendet, um Outreach-Aktivitäten zu bewerten, die darauf abzielen, die Teilnahme von Mitgliedern der Latinx-Community an SARS-COV-2-Tests zu erhöhen. Das primäre Ergebnis für diesen Aspekt der Studie sind die Testraten auf Standortebene von Latinx-Personen.

Bewertung der Stichprobengröße, Plan für fehlende Daten, statistischer Analyseplan: Für die primäre Wirksamkeitsbewertung der Promotores-Intervention verwenden die Ermittler die standardmäßige Normaltheorieanalyse der Kovarianz (ANCOVA) und die autoregressive lineare Modellierung für kontinuierliche Ergebnisse wie COVID-19 Wissen; und sie werden verallgemeinerte lineare Prä-Post-Modellierung für gezählte und geordnete kategoriale Ergebnisse verwenden, wie z. B. den Anteil von Latinx, der an jedem geografischen Standort getestet wurde. Um die Nicht-Unabhängigkeit der Teilnehmer am Interventionsdesign anzugehen, werden die Forscher lineare gemischte Modelle schätzen. Es werden zwei Hauptquellen für fehlende Daten erwartet: Nichtbeantwortung von Artikeln und Fluktuation im Laufe der Zeit. Bei Studienabbrechern führen die Ermittler standardmäßige Attritionsanalysen durch, um die Ausgangsmerkmale zwischen Attritern und Completern zu vergleichen. Sie werden Verfahren zum Abgleich von Neigungswerten und Modelle für durchschnittliche Kausaleffekte in Betracht ziehen, um wesentliche Unterschiede anzugehen. Für die Entwicklung von Item-Non-Response und Skalenwerten müssen die Ermittler 70 % der Skalen-Items für die Bewertung vorhanden sein. Sie werden testen, ob innerhalb von Wellen und dann wellenübergreifend Skalenniveaudaten vollständig zufällig (MCAR) fehlen. Wenn die Daten nicht MCAR sind, werden die Ermittler unter der Annahme, dass sie zufällig fehlen (MAR, d. h. die Daten sind nicht von fehlenden Werten der Interventionsantwortvariablen abhängig), einen von zwei empfohlenen Ansätzen für SEM anwenden, Full Information Maximum Likelihood (FIML) oder Multiple Imputation (MI). Obwohl diese Ansätze problematisch sein können, wenn Daten nicht zu ignorieren sind, werden sie dennoch für den Umgang mit fehlenden Daten empfohlen, insbesondere bei Kovariaten im Zusammenhang mit Attrition. Beide Methoden liefern effizientere Standardfehler als listenweises oder paarweises Löschen oder mittlere Substitution. Sollten fehlende Daten oder Schwund mit Kovariaten in Verbindung gebracht werden, werden die Ermittler geeignete Kovariaten in die Hypothesentests einbeziehen. Für die Ergebnisse des Prä-Post-Kriteriums auf individueller Ebene bieten 38 Standorte mit etwa 50 bis 100 Teilnehmern pro Standort plus Abwanderung (n = 2160), ein Alpha-Niveau von 0,05 und Intra-Klassen-Korrelationen im Bereich von 0,05 bis 0,20 die Möglichkeit, Effekte zu erkennen von 0,19 bis 0,32, (klein bis mittel).

Schließlich werden Daten gemäß Tier 1 „Common Data Elements“ vom nationalen Duke Coordination and Data Collection Centre (CDCC) erhoben. Das CDCC unterstützt direkt jedes einzelne RADx-UP-Projekt, um das Engagement, die Reichweite und die Teststrategien zu optimieren und Möglichkeiten des gemeinsamen Lernens zwischen und zwischen RADx-UP-Projekten zu erleichtern. Wichtige Ergebnisdaten und die Testverfahren zum Erhalt der Probe, der Analyseplattform, der Analyseverfahren und der Testergebnisse werden zur Harmonisierung im gesamten Konsortium gesammelt und einheitlich dargestellt, integriert in die Testberichtsanforderungen im Rahmen von Coronavirus Aid, Relief, and Economic Sicherheitsgesetz (CARES-Gesetz).