COVID-19: Sund Oregon (Oregon Saludable): Together We Can (Juntos Podemos) (OSJP)

I alt 38 fællesskaber har etableret et teststed med testbegivenheder afholdt hver anden uge (hver anden uge). Undersøgelsen randomiserede amter på lokalitetsniveau inden for amt. Efterforskerne brugte a priori stratificering efter amt, da stikprøvestørrelsen er lille. Halvdelen af ​​alle lokaliteter i et amt blev tildelt kontrolbetingelsen (services as usual), og den anden halvdel til interventionstilstanden (Promotores de Salud). Tilfældigt tildelte fællesskaber modtager en af ​​to opsøgende strategier: Tjenester som sædvanlig (kulturelt skræddersyede flyers, radiomeddelelser, indlæg på sociale medier, pjece om sundhedsadfærd på stedet) eller tjenester som sædvanlig plus Promotores de Salud-interventionen, hvor et betalt, betroet fællesskabsmedlem når frem ud til fællesskabsmedlemmer for at motivere dem til at bruge de gratis testtjenester og forbedre COVID-19-relateret sundhedsadfærd. Promotores de Salud-interventionen var designet til at opbygge relationer med medlemmer af Latinx-samfundet og lette tillid.

For at vurdere andelen af ​​medlemmer af Latinx-samfundet, der er testet på hvert sted, vil efterforskerne bruge de-identificerede sundhedsoplysninger, der er leveret til undersøgelsen af ​​University of Oregons (UO) COVID-19 kliniske genomics-laboratorium, som behandler testene. For at vurdere sundhedsadfærd vil en undergruppe af voksne deltagere på hvert sted blive inviteret til at deltage i en forskningsundersøgelse, administreret ved baseline og igen 30 dage senere. For begge tilgange forventer undersøgelsen at engagere en større andel Latinx-samfundsmedlemmer i forhold til den samlede amtsdemografi. Den samlede undersøgelsespopulation forventes at være 85 % latinamerikanske og 15 % ikke-spanske, med 84 % af individerne, der identificerer sig som hvide i begge etniske grupper, og de resterende 16 % identificerer sig som afroamerikanere, asiatiske, stillehavsøboer, indianere/indianer i Alaska. , eller mere end én race. Der vil være 19 steder pr. undersøgelsesgruppe (38 i alt) og op til ca. 3.600 voksne individer i interventionen (n = 1.800) eller kontrolforholdene (n = 1.800).

Denne undersøgelse udnytter også data fra et patientregister fra University of Oregons COVID-19 kliniske genomiklaboratorium.

Kvalitetssikring, datatjek, kildedataverifikation, dataordbog og standarddriftsprocedurer: Data og bioprøver vil blive indsamlet personligt på teststeder, hvilket kræver direkte interaktion med deltagerne. For at rapportere SARS-CoV-2-infektionsresultater tilbage til hver deltager, indsamles navn, fødselsdato og kontaktoplysninger. For at opfylde rapporteringskravene til Oregon Health Authority, indsamles også bopælsland og postnummer for hver testede person. Data, der bruges til at evaluere effektiviteten af ​​intervention, vil involvere aggregerede variabler afledt af data indsamlet som en del af den diagnostiske testprocedure og vil blive aggregeret på teststedets niveau (f.eks. udførte tests, race- og etnicitetsprocenter osv.).

Til indsamling af SARS-CoV-2-prøver vil testfacilitatorer vejlede deltagere i selvindsamlingsprocessen. For næsebor instrueres deltagerne i at placere næsepodningen ca. 1 cm ind i deres næsebor og rotere den, skabe kontakt med næsemembranen i 10 sekunder, og derefter gentage processen med den samme podning i det andet næsebor. Forældre instrueres i at indsamle prøven til deres barn, hvis barnet er under 10 år, eller hvis det mindreårige barn anmoder om forældrehjælp. Personale på teststedet kan hjælpe deltagere, der har lav fingerfærdighed eller fysiske funktionsnedsættelser, i prøveindsamlingen. I tilfælde af en skade under prøveindsamlingen, vil det partnerskabende samfunds organisations personale henvise deltageren til de relevante medicinske ressourcer. Prøver placeres i sterile stregkodede hætteglas (1 ml Matrix, stregkodede skruelåg), der hver indeholder 500 mikroliter (μl) DNA/RNA Shield. Hvert Matrix-rør vil derefter blive lukket tæt og vil blive placeret i et standard-laboratorie-mikrocentrifugerørsstativ i plast med otte rækker og tolv søjler (8 x 12 stativ med 96 positioner). Dette stativ vil derefter blive udvendigt dekontamineret ved kortvarig nedsænkning i accelereret hydrogenperoxid (H202). Hvert 96-positions mikrocentrifugerørsstativ vil derefter blive mærket og anbragt i en steril midlertidig beholder med våd is ved 4Cgrader. Hvis det er muligt på hvert sted, vil stativer periodisk blive flyttet enten til et køleskab (4C) eller en fryser (-20C) til opbevaring. Sidst på dagen vil alle stativer blive transporteret på våd is til COVID-19 klinisk genomics Laboratory på UO, hvilket sikrer, at de ikke ankommer længere end 48 timer efter afhentning og helst inden for 12-24 timer. Hvis teststedet er placeret for distalt til håndtransport, vil rørstativer blive sikret og afsendt med ekspresmetoder på tøris.

Hver opsamlingsplade med 96 brønde vil derefter fortsætte til molekylær behandling ved hjælp af standard, FDA-godkendte Thermo Fisher TaqPath-analyseprotokol. Alle trin i denne godkendte protokol vil blive fulgt nøjagtigt, inklusive de relevante reagenser, volumener og inkludering af passende positive og negative kontroller. Derudover vil efterforskerne anvende softwareanalysesystemet og parametrene nøjagtigt som specificeret. Først vil RNA blive ekstraheret fra hver brønd ved hjælp af MagMax Viral/Pathogen Nucleic Acid Isolation Kit (ThermoFisher, #100081242), som fjerner potentielt hæmmende kontaminering og øger følsomheden og konsistensen af ​​efterfølgende qPCR-protokoller. Afhængigt af antallet af prøver, der skal behandles, vil RNA-ekstraktion enten ske manuelt ved hjælp af multikanalpipetter eller ved brug af Hamilton Robot. Det oprensede RNA vil derefter blive retrotranskriberet til analyse ved hjælp af TaqPath RT-PCR COVID-19-kittet på enten 96-brønds eller 384-brønds QuantStudio5 (QS5) termocyclere afhængigt af antallet af prøver, der skal behandles. Hvis laboratorieteknikerne skal behandle 384 prøver, vil de bruge Hamilton-væskehåndteringsrobotten (Hamilton, Microlab VANTAGE 2.0) til at alikvotere fra hver af fire-96-brøndsplader til 384-brønds pladeformat til efterfølgende qPCR-amplifikation. I denne RT-PCR-proces annealer prober til tre unikke frem- og omvendte primere for tre SARS-CoV-2-gener: ORF1ab, N-protein og S-protein.

Al laboratorie og rapportering vil blive automatiseret ved brug af stregkoder, robotteknologi, 96 og 384 brønds qPCR-maskiner og brug af et fuldt HIPAA- og CAP3-kompatibelt Laboratory Information Management System (LIMS) bygget af L7 informatics (https://l7informatics. dk/). Disse systemautomatiseringer og brug af LIMS tillader øget gennemløb (op til flere tusinde prøver pr. dag) og hurtig analyse og automatiseret rapportering af resultater gennem LIMS. qPCR-dataene lagres i LIMS-systemet til analyse ved hjælp af Applied Biosystems COVID-19 Interpretive Software for at muliggøre en kvalitativ vurdering af, om virussen er til stede i prøven (et "positivt" tilfælde), fraværende eller usikkert. LIMS-systemet i COVID-19-MAP-laboratoriet tillader integration af denne analysesoftware i det passende trin i den overordnede prøvesporingsworkflowpipeline, og derfor kan det umiddelbare resultat linkes til den relevante stregkode i databasen. Ydermere er LIMS-systemet forbundet og kommunikerer via et lokalt netværk (LAN) med alt udstyr (f.eks. robotter og qPCR-maskiner) for at dokumentere hvert trin i processen til CLIA-validering. Resultaterne for hver prøve og tilknyttede metadata om trinene under behandlingen er derefter knyttet til hver tildelt stregkode og kan derefter formidles, efter behov, til Oregon Health Authority, den relevante amtssundhedsafdeling og individet. Testresultater vil være tilgængelige inden for 48 timer og senest 4 dage for den enkelte og/eller sundhedsmyndigheden.

Efter afprøvning har fundet sted, vil forskerne have adgang til aggregerede, fællesskabsniveau (f.eks. tællinger og prævalensrater), afidentificerede data udarbejdet af UO's CLIA kliniske genomiklaboratorium. Dataene vil omfatte fire beskyttede sundhedsidentifikatorer: webstedets postnummer, deltagerens postnummer, testresultatet og testdatoen. Det vil også omfatte demografiske data, dette er ikke beskyttede sundhedsoplysninger såsom aldersgruppe, race og etnicitet. Disse data vil blive brugt til at vurdere opsøgende aktiviteter, der sigter mod at øge deltagelsen af ​​Latinx-samfundsmedlemmer i SARS-COV-2-test. Det primære resultat for dette aspekt af undersøgelsen er testrater på site-niveau for Latinx-individer.

Prøvestørrelsesvurdering, plan for manglende data, statistisk analyseplan: Til den primære effektivitetsevaluering af Promotores-interventionen vil efterforskerne anvende standard normal teorianalyse af kovarians (ANCOVA) og autoregressiv lineær modellering for kontinuerlige resultater såsom COVID-19 viden; og de vil anvende pre-post generaliseret lineær modellering for optælling og ordnede kategoriske resultater, såsom andelen af ​​Latinx testet på hvert geografisk sted. For at adressere deltagernes uafhængighed i interventionsdesignet vil efterforskerne estimere lineære blandede modeller. Der forventes to primære kilder til manglende data, varefrafald og nedslidning over tid. For frafald vil efterforskere udføre standard nedslidningsanalyser for at sammenligne baseline karakteristika mellem attritere og fuldendere. De vil overveje tilbøjelighedsscore-matching procedurer og komplimenter gennemsnitlige kausale virkninger modeller for at imødegå væsentlige forskelle. For emnefrafald og udvikling af skala-score vil efterforskere kræve, at 70 % af skalaelementerne er til stede for at få point. De vil teste, om skalaniveaudata mangler fuldstændigt tilfældigt (MCAR) inden for bølger og derefter på tværs af bølger. Hvis data ikke er MCAR, under antagelser om manglende tilfældigt (MAR, dvs. data er ikke afhængige af manglende værdier af interventionsresponsvariablen), vil efterforskerne anvende en af ​​to anbefalede tilgange til SEM, fuld information maximum likelihood (FIML) eller multiple imputation (MI). Selvom disse tilgange kan være problematiske, når der mangler data, der ikke kan ignoreres, anbefales de stadig til håndtering af mangler, især med kovariater forbundet med nedslidning. Begge metoder giver mere effektive standardfejl end liste- eller parvis sletning eller middelsubstitution. Skulle manglende data eller nedslidning være forbundet med kovariater, vil efterforskerne inkludere passende kovariater i hypotesetestning. For præ-post individuelt niveau kriterieresultater giver 38 steder med ca. 50 til 100 deltagere pr. sted plus nedslidning (n = 2160), et alfaniveau på 0,05 og intra-klasse korrelationer, der spænder fra 0,05 til 0,20, der giver mulighed for at detektere effekter fra 0,19 til 0,32, henholdsvis (lille til moderat).

Endelig vil data blive indsamlet i overensstemmelse med Tier 1 "fælles dataelementer" fra det nationale Duke Coordination and Data Collection Center (CDCC). CDCC assisterer direkte hvert enkelt RADx-UP-projekt med at optimere engagement, opsøgende, teststrategier og for at facilitere samlæringsmuligheder mellem og blandt RADx-UP-projekter. Nøgleresultatdata og testprocedurerne for at opnå prøven, analyseplatformen, analyseprocedurerne og testresultaterne vil blive indsamlet og repræsenteret på en ensartet måde for harmonisering på tværs af konsortiet, integreret med testrapporteringskrav under Coronavirus Aid, Relief, and Economic Sikkerhedsloven (CARES-loven).