COVID-19: Oregon Saudável (Oregon Saludable): Juntos Podemos (Juntos Podemos) (OSJP)

Um total de 38 comunidades estabeleceram um local de teste com eventos de teste realizados a cada duas semanas (quinzenalmente). O estudo randomizou condados no nível local dentro do condado. Os investigadores usaram uma estratificação a priori por município, pois o tamanho da amostra é pequeno. Metade de todos os locais de um município foram designados para a condição de controle (serviços como de costume) e a outra metade para a condição de intervenção (Promotores de Saúde). As comunidades designadas aleatoriamente recebem uma das duas estratégias de alcance: Serviços como de costume (folhetos adaptados culturalmente, anúncios de rádio, postagens em mídias sociais, panfleto de comportamento de saúde no local) ou serviços como de costume mais a intervenção Promotores de Saúde, onde um membro pago e confiável da comunidade alcança para os membros da comunidade para motivá-los a utilizar os serviços de teste gratuitos e melhorar os comportamentos de saúde relacionados ao COVID-19. A intervenção Promotores de Salud foi projetada para construir relacionamentos com membros da comunidade Latinx e facilitar a confiança.

Para avaliar a proporção de membros da comunidade Latinx testados em cada local, os investigadores usarão informações de saúde não identificadas fornecidas ao estudo pelo laboratório de genômica clínica COVID-19 da Universidade de Oregon (UO), que está processando os testes. Para avaliar os comportamentos de saúde, um subconjunto de participantes adultos em cada local será convidado a participar de uma pesquisa de pesquisa, administrada no início e novamente 30 dias depois. Para ambas as abordagens, o estudo prevê envolver uma proporção maior de membros da comunidade Latinx, em relação à demografia geral do condado. Espera-se que a população geral do estudo seja 85% hispânica e 15% não hispânica, com 84% dos indivíduos se identificando como brancos em ambos os grupos étnicos e os 16% restantes se identificando como afro-americanos, asiáticos, habitantes das ilhas do Pacífico, índios americanos/nativos do Alasca , ou mais de uma corrida. Haverá 19 locais por grupo de estudo (38 no total) e até aproximadamente 3.600 indivíduos adultos na intervenção (n = 1.800) ou condições de controle (n = 1.800).

Este estudo também utiliza dados de um registro de pacientes do laboratório de genômica clínica COVID-19 da Universidade de Oregon.

Garantia de qualidade, verificações de dados, verificação de dados de origem, dicionário de dados e procedimentos operacionais padrão: dados e amostras biológicas serão coletados pessoalmente nos locais de teste, exigindo interação direta com os participantes. Para relatar os resultados da infecção por SARS-CoV-2 a cada participante, são coletados nome, data de nascimento e informações de contato. Para cumprir os requisitos de notificação à Autoridade de Saúde do Oregon, o condado de residência e o código postal também são coletados para cada pessoa testada. Os dados usados ​​para avaliar a eficácia da intervenção envolverão variáveis ​​agregadas derivadas de dados coletados como parte do procedimento de teste de diagnóstico e serão agregadas no nível do local de teste (por exemplo, testes realizados, porcentagens de raça e etnia, etc.).

Para a coleta de amostras de SARS-CoV-2, os facilitadores de teste orientarão os participantes no processo de autocoleta. Para as narinas anteriores, os participantes são instruídos a colocar o swab nasal cerca de 1 cm na narina e girá-lo, fazendo contato com a membrana nasal por 10 segundos, repetindo o processo com o mesmo swab na outra narina. Os pais são instruídos a coletar a amostra para seu filho se a criança tiver menos de 10 anos de idade ou se o filho menor solicitar assistência parental. A equipe do local de teste pode ajudar os participantes com baixa destreza ou deficiências físicas na coleta de amostras. Em caso de lesão durante a coleta de amostras, a equipe da organização comunitária parceira encaminhará o participante para os recursos médicos apropriados. As amostras serão colocadas em frascos estéreis com código de barras (matriz de 1 ml, tubos com tampa de rosca com código de barras) cada um contendo 500 microlitros (μl) de DNA/RNA Shield. Cada tubo Matrix será então bem fechado e colocado em um rack de tubos de microcentrífuga de laboratório de plástico padrão com oito fileiras e doze colunas (rack de 8 por 12 com 96 posições). Este rack será então descontaminado externamente por breve submersão em peróxido de hidrogênio acelerado (H202). Cada rack de tubos de microcentrífuga de 96 posições será rotulado e colocado em um recipiente temporário estéril com gelo úmido a 4°C. Se possível em cada local, os racks serão transferidos periodicamente para um refrigerador (4C) ou freezer (-20C) para armazenamento. No final do dia, todos os racks serão transportados em gelo úmido para o Laboratório de Genômica Clínica COVID-19 da UO, garantindo que cheguem em até 48 horas após a coleta e preferencialmente dentro de 12 a 24 horas. Se o local de teste estiver localizado muito distalmente para o transporte manual, os suportes de tubos serão protegidos e enviados por métodos expressos em gelo seco.

Cada placa de coleta de 96 poços prosseguirá para o processamento molecular usando o protocolo de análise Thermo Fisher TaqPath padrão aprovado pela FDA. Todas as etapas deste protocolo aprovado serão seguidas exatamente, incluindo os reagentes apropriados, volumes e inclusão de controles positivos e negativos apropriados. Além disso, os investigadores empregarão o sistema de análise de software e os parâmetros exatamente conforme especificado. Primeiro, o RNA será extraído de cada poço usando o kit de isolamento de ácido nucléico MagMax Viral/Pathogen (ThermoFisher, nº 100081242), que remove a contaminação potencialmente inibidora e aumenta a sensibilidade e a consistência dos protocolos qPCR subsequentes. Dependendo do número de amostras a serem processadas, a extração de RNA ocorrerá manualmente usando pipetadores multicanal ou com o uso do robô Hamilton. O RNA purificado será então retrotranscrito para análise usando o kit TaqPath RT-PCR COVID-19 em termocicladores QuantStudio5 (QS5) de 96 ou 384 poços, dependendo do número de amostras a serem processadas. Se os técnicos de laboratório precisarem processar 384 amostras, eles usarão o robô de manuseio de líquidos Hamilton (Hamilton, Microlab VANTAGE 2.0) para alíquotar de cada uma das placas de 96 poços no formato de placa de 384 poços para amplificação qPCR subsequente. Neste processo de RT-PCR, as sondas se ligam a três primers diretos e reversos exclusivos para três genes SARS-CoV-2: ORF1ab, N Protein e S Protein.

Todo o laboratório e os relatórios serão automatizados por meio do uso de códigos de barras, robótica, máquinas qPCR de 96 e 384 poços e o uso de um Sistema de Gerenciamento de Informações de Laboratório (LIMS) totalmente compatível com HIPAA e CAP3, construído pela L7 informática (https://l7informatics. com/). Essas automações de sistema e o uso do LIMS permitem maior rendimento (até vários milhares de amostras por dia) e análise rápida e relatórios automatizados de resultados por meio do LIMS. Os dados qPCR são armazenados no sistema LIMS para análise usando o Applied Biosystems COVID-19 Interpretive Software para permitir uma avaliação qualitativa se o vírus está presente na amostra (um caso 'positivo'), ausente ou incerto. O sistema LIMS no laboratório COVID-19-MAP permite a integração deste software de análise na etapa apropriada do pipeline geral do fluxo de trabalho de rastreamento de amostras e, portanto, o resultado imediato pode ser vinculado ao código de barras apropriado no banco de dados. Além disso, o sistema LIMS está conectado e se comunica através de uma rede local (LAN) com todos os equipamentos (por exemplo, robôs e máquinas qPCR) para documentar cada etapa do processo de validação CLIA. Os resultados de cada amostra e os metadados associados nas etapas durante o processamento são então associados a cada código de barras atribuído e podem ser divulgados, conforme apropriado, para a Oregon Health Authority, o departamento de saúde do condado apropriado e o indivíduo. Os resultados dos testes estarão disponíveis dentro de 48 horas e no máximo 4 dias para o indivíduo e/ou autoridade de saúde.

Após a realização do teste, os pesquisadores terão acesso a dados agregados, em nível de comunidade (por exemplo, contagens e taxas de prevalência), não identificados, preparados pelo laboratório de genômica clínica CLIA da UO. Os dados incluirão quatro identificadores de saúde protegidos: código postal do site, código postal do participante, resultado do teste e data do teste. Ele também incluirá dados demográficos que não são informações de saúde protegidas, como faixa etária, raça e etnia. Esses dados serão usados ​​para avaliar atividades de divulgação destinadas a aumentar a participação de membros da comunidade Latinx nos testes de SARS-COV-2. O resultado primário para este aspecto do estudo são as taxas de teste em nível local de indivíduos Latinx.

Avaliação do tamanho da amostra, plano para dados ausentes, plano de análise estatística: para a avaliação primária da eficácia da intervenção dos Promotores, os investigadores empregarão análise de covariância de teoria normal padrão (ANCOVA) e modelagem linear auto-regressiva para resultados contínuos, como COVID-19 conhecimento; e eles empregarão modelagem linear generalizada pré-pós para contagem e resultados categóricos ordenados, como proporção de Latinx testado em cada local geográfico. Para abordar a não independência dos participantes no projeto de intervenção, os investigadores estimarão modelos mistos lineares. Duas fontes primárias de dados ausentes são esperadas, não resposta do item e desgaste ao longo do tempo. Para o abandono, os investigadores realizarão análises de atrito padrão para comparar as características basais entre os que abandonaram e os que completaram. Eles considerarão procedimentos de correspondência de pontuação de propensão e modelos de efeitos causais médios compiladores para lidar com diferenças substanciais. Para a não resposta do item e o desenvolvimento da pontuação da escala, os investigadores exigirão que 70% dos itens da escala estejam presentes para pontuação. Eles testarão se os dados de nível de escala estão ausentes completamente ao acaso (MCAR) nas ondas e depois nas ondas. Se os dados não forem MCAR, sob suposições de ausência aleatória (MAR, ou seja, os dados não dependem de valores ausentes da variável de resposta à intervenção), os investigadores empregarão uma das duas abordagens recomendadas para SEM, probabilidade máxima de informação completa (FIML) ou imputação múltipla (IM). Embora essas abordagens possam ser problemáticas quando os dados não são ignoráveis, elas ainda são recomendadas para lidar com a falta, particularmente com covariáveis ​​associadas ao atrito. Ambos os métodos fornecem erros padrão mais eficientes do que a exclusão de lista ou de pares ou a substituição de média. Se dados ausentes ou atrito estiverem associados a covariáveis, os investigadores incluirão as covariáveis ​​apropriadas no teste de hipótese. Para os resultados do critério de nível individual pré-pós, 38 locais com cerca de 50 a 100 participantes por local mais atrito (n = 2160), um nível alfa de 0,05 e correlações intraclasse variando de 0,05 a 0,20 fornece poder para detectar efeitos variando de 0,19 a 0,32, respectivamente (pequeno a moderado).

Por fim, os dados serão coletados de acordo com os "elementos de dados comuns" de Nível 1 do Centro Nacional de Coordenação e Coleta de Dados da Duke (CDCC). O CDCC auxilia diretamente cada projeto RADx-UP individual para otimizar o envolvimento, divulgação, estratégias de teste e para facilitar oportunidades de co-aprendizagem entre os projetos RADx-UP. Os principais dados de resultados e os procedimentos de teste para obter a amostra, a plataforma de análise, os procedimentos de análise e o resultado do teste serão coletados e representados de maneira consistente para harmonização em todo o consórcio, integrados aos requisitos de relatório de teste sob o Coronavirus Aid, Relief e Economic Lei de Segurança (Lei CARES).