출생 전 발병 희귀 질환에서 게놈 차원의 DNA 메틸화(DNA 메틸화 Episignatures)의 특성 규명 및 기여 (FOETEPISIGN)
2026년 3월 24일 업데이트: Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
태아 DNA로부터 참조 DNA 메틸화 Episignature를 정의하는 것이 필요합니다. 가설은 다음과 같습니다.
- 사후검사 시 채취한 양수 또는 냉동조직에서 추출한 태아 DNA로부터 reference DNA Methylation Episignature를 정의하는 것이 가능합니다.
- 태아 DNA 메틸화 Episignature는 혈액에서 추출한 DNA에 정의된 항문 후 DNA 메틸화 Episignature와 다를 수 있습니다.
연구 개요
상세 설명
선천성 기형(CA)은 임신의 3~5%에 영향을 미치며 유전 질환과 연관될 수 있습니다. 유전 질환의 진단은 특히 임신 중에 중요한 의학적 과제입니다.
지난 20년 동안 차세대 염기서열 분석(NGS)은 CA와 관련된 유전적 상태를 식별하는 능력에 혁명을 일으켰습니다. 임신 중에 표준 염색체 조사(핵형 및 염색체 마이크로어레이 분석, CMA)가 진단을 제공하지 못하는 경우 산전 엑솜 시퀀싱을 통해 CA가 있는 태아의 약 30%에서 추가 진단이 확인되었습니다.
이러한 주요 발전에도 불구하고, 불확실한 의미의 변종(VUS)을 보유하고 있는 환자의 10~15%를 포함하여 약 40%의 희귀질환이 아직 해결되지 않은 상태로 남아 있습니다.
출생 후 VUS를 재분류하기 위해 게놈 차원의 DNA 메틸화 연구를 포함한 추가 기능 분석("다중 OMICS")이 제공될 수 있습니다.
DNA 메틸화 이상은 병리학(발달 장애 및 종양학)에서 중요한 역할을 합니다.
게놈 전체의 여러 CpG 디뉴클레오티드에서 발생하는 누적 DNA 메틸화 패턴으로 정의되는 DNA 메틸화 Episignatures는 연령, 성별 및 질병 상태를 포함한 많은 인간 특성과 복잡하게 연관되어 있는 것으로 인식되었습니다. 최근 몇 가지 잘 알려진 유전 질환에 대한 어린이 또는 성인의 혈액에서 DNA 메틸화 Episignature가 확인되었습니다. 그러나 이러한 출생 후 DNA 메틸화 Episignatures는 임신 중에는 사용할 수 없습니다. 왜냐하면 DNA 메틸화가 한 조직에서 다른 조직으로, 특히 태아 발달 중에 시간이 지남에 따라 변하기 때문입니다. 또한, 임신 중에 이용 가능한 조직은 출생 후 분석된 조직(혈액)과 다릅니다.
연구 유형
관찰
등록 (추정된)
63
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 연락처
- 이름: Nelly BRIAND, PhD
- 전화번호: 0144381862
- 이메일: nelly.briand@aphp.fr
연구 연락처 백업
- 이름: Nicolas BOURGON, MD, PhD
- 전화번호: +33 1 42 19 27 96
- 이메일: nicolas.bourgon@aphp.fr
연구 장소
-
-
-
Paris, 프랑스, 75015
- 모병
- Department of Genomic Medicine for Rare Diseases and the Multidisciplinary Center for Prenatal Diagnosis of the Necker-Enfants malades Hospital
-
연락하다:
- Nicolas BOURGON, MD, PhD
- 전화번호: : +33 1 42 19 27 96
- 이메일: nicolas.bourgon@aphp.fr
-
-
참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 어린이
- 성인
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
예
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
연구 집단은 희귀 질환에 대한 게놈 의학부와 Necker-Enfants Malades 병원(APHP - GHU Paris Cité)의 산전 진단을 위한 종합 센터에서 파생되었습니다.
부모는 생물학적 시료의 보관 및 사용에 대한 동의서에 서명했으며, 치료의 일부로 채취한 시료는 의학 연구에 재사용될 수 있다는 내용을 명시했습니다.
설명
포함 기준:
환자 포함 기준:
- 네커아동병원 희귀질환 유전체의학부에서 발달이상 병인진단의 일환으로 사후검사를 받은 태아로서, 폐 및 양수에서 추출한 DNA가 있는 태아
- 또는 네커 아동병원 희귀질환 유전체의학 부서에서 치료를 받고 있으며 전혈에서 추출된 DNA가 이용 가능한 아동
- CHD7, KMT2D, HYLS1, TCTN3 또는 FLVCR2에 뒤따르는 유전자에 병원성 또는 아마도 병원성 변이가 있는 경우
- 부모가 진단 및 연구의 일환으로 분자 유전자 검사에 동의한 경우
음성 대조군:
- 네커아동병원 희귀질환 유전체의학부에서 발달이상 병인진단의 일환으로 사후검사를 받은 태아로서, 폐 및 양수에서 추출한 DNA가 있는 태아
- 또는 네커 아동병원 희귀질환 유전체의학 부서에서 치료를 받고 있으며 전혈에서 추출된 DNA가 이용 가능한 아동
- CHD7, KMT2D, HYLS1, TCTN3 또는 FLVCR2 다음 유전자에 병원성 또는 병원성 가능성이 있는 변이가 없습니다.
- 부모가 진단 및 연구의 일환으로 분자 유전자 검사에 동의한 경우
모두를위한:
• 살아 있는 참가자의 경우: 치료 과정에서 수집 및 저장된 임상 데이터 및 생물학적 시료의 재사용에 대해 친권 보유자가 이의를 제기하지 않습니다(치료 동의).
• 사망한 참가자의 경우:
- 치료의 일부로 서명된 연구 목적으로 보관된 샘플의 사용에 대한 친권 보유자의 동의
- 환자의 의무기록에 해당 치료의 임상 데이터 재사용에 대한 반대 언급 없음
제외 기준:
- 태아 상실 시 부검 거부
- 부모의 분자 조사 거부
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
|---|---|
|
작업 패키지 1, 그룹 1
CHARGE 증후군 환자(소아)
|
게놈 DNA는 중아황산염으로 처리됩니다.
처리된 DNA 500ng는 EPICv2 어레이 Infinium 메틸화(Illumina, San Diego, CA, USA)에서 혼성화됩니다.
이 마이크로어레이를 사용하면 프로모터, 인핸서, CpG 섬, 유전자간 및 유전자내 영역에서 약 865,000개의 메틸화 부위를 분석할 수 있습니다.
이는 인간 병리학에서 보고된 거의 모든 후성 유전적 특징을 포함하여 문헌에서 가장 널리 사용되는 칩입니다.
|
|
작업 패키지 1, 그룹 2
연령과 성별에 맞는 건강한 음성 대조군(어린이)
|
게놈 DNA는 중아황산염으로 처리됩니다.
처리된 DNA 500ng는 EPICv2 어레이 Infinium 메틸화(Illumina, San Diego, CA, USA)에서 혼성화됩니다.
이 마이크로어레이를 사용하면 프로모터, 인핸서, CpG 섬, 유전자간 및 유전자내 영역에서 약 865,000개의 메틸화 부위를 분석할 수 있습니다.
이는 인간 병리학에서 보고된 거의 모든 후성 유전적 특징을 포함하여 문헌에서 가장 널리 사용되는 칩입니다.
|
|
작업 패키지 1, 그룹 3
CHARGE 증후군이 있는 태아
|
게놈 DNA는 중아황산염으로 처리됩니다.
처리된 DNA 500ng는 EPICv2 어레이 Infinium 메틸화(Illumina, San Diego, CA, USA)에서 혼성화됩니다.
이 마이크로어레이를 사용하면 프로모터, 인핸서, CpG 섬, 유전자간 및 유전자내 영역에서 약 865,000개의 메틸화 부위를 분석할 수 있습니다.
이는 인간 병리학에서 보고된 거의 모든 후성 유전적 특징을 포함하여 문헌에서 가장 널리 사용되는 칩입니다.
|
|
작업 패키지 1, 그룹 4
유전병이 없는 태아
|
게놈 DNA는 중아황산염으로 처리됩니다.
처리된 DNA 500ng는 EPICv2 어레이 Infinium 메틸화(Illumina, San Diego, CA, USA)에서 혼성화됩니다.
이 마이크로어레이를 사용하면 프로모터, 인핸서, CpG 섬, 유전자간 및 유전자내 영역에서 약 865,000개의 메틸화 부위를 분석할 수 있습니다.
이는 인간 병리학에서 보고된 거의 모든 후성 유전적 특징을 포함하여 문헌에서 가장 널리 사용되는 칩입니다.
|
|
작업 패키지 2, 그룹 5
가부키증후군 환자(소아)
|
게놈 DNA는 중아황산염으로 처리됩니다.
처리된 DNA 500ng는 EPICv2 어레이 Infinium 메틸화(Illumina, San Diego, CA, USA)에서 혼성화됩니다.
이 마이크로어레이를 사용하면 프로모터, 인핸서, CpG 섬, 유전자간 및 유전자내 영역에서 약 865,000개의 메틸화 부위를 분석할 수 있습니다.
이는 인간 병리학에서 보고된 거의 모든 후성 유전적 특징을 포함하여 문헌에서 가장 널리 사용되는 칩입니다.
|
|
작업 패키지 2, 그룹 6
가부키 증후군이 있는 태아
|
게놈 DNA는 중아황산염으로 처리됩니다.
처리된 DNA 500ng는 EPICv2 어레이 Infinium 메틸화(Illumina, San Diego, CA, USA)에서 혼성화됩니다.
이 마이크로어레이를 사용하면 프로모터, 인핸서, CpG 섬, 유전자간 및 유전자내 영역에서 약 865,000개의 메틸화 부위를 분석할 수 있습니다.
이는 인간 병리학에서 보고된 거의 모든 후성 유전적 특징을 포함하여 문헌에서 가장 널리 사용되는 칩입니다.
|
|
작업 패키지 3, 그룹 7
수중수종 증후군이 있는 태아
|
게놈 DNA는 중아황산염으로 처리됩니다.
처리된 DNA 500ng는 EPICv2 어레이 Infinium 메틸화(Illumina, San Diego, CA, USA)에서 혼성화됩니다.
이 마이크로어레이를 사용하면 프로모터, 인핸서, CpG 섬, 유전자간 및 유전자내 영역에서 약 865,000개의 메틸화 부위를 분석할 수 있습니다.
이는 인간 병리학에서 보고된 거의 모든 후성 유전적 특징을 포함하여 문헌에서 가장 널리 사용되는 칩입니다.
|
|
작업 패키지 3, 그룹 8
메켈/OFD IV 증후군이 있는 태아
|
게놈 DNA는 중아황산염으로 처리됩니다.
처리된 DNA 500ng는 EPICv2 어레이 Infinium 메틸화(Illumina, San Diego, CA, USA)에서 혼성화됩니다.
이 마이크로어레이를 사용하면 프로모터, 인핸서, CpG 섬, 유전자간 및 유전자내 영역에서 약 865,000개의 메틸화 부위를 분석할 수 있습니다.
이는 인간 병리학에서 보고된 거의 모든 후성 유전적 특징을 포함하여 문헌에서 가장 널리 사용되는 칩입니다.
|
|
작업 패키지 3, 그룹 9
파울러 증후군이 있는 태아
|
게놈 DNA는 중아황산염으로 처리됩니다.
처리된 DNA 500ng는 EPICv2 어레이 Infinium 메틸화(Illumina, San Diego, CA, USA)에서 혼성화됩니다.
이 마이크로어레이를 사용하면 프로모터, 인핸서, CpG 섬, 유전자간 및 유전자내 영역에서 약 865,000개의 메틸화 부위를 분석할 수 있습니다.
이는 인간 병리학에서 보고된 거의 모든 후성 유전적 특징을 포함하여 문헌에서 가장 널리 사용되는 칩입니다.
|
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
|
CHD7 유전자의 병원성 변이와 관련된 후성유전적 특징(CHARGE 증후군)
기간: 12 개월
|
병원성 또는 아마도 병원성 변이가 있는 태아의 태아 조직 DNA에서 후생유전학적 특징이 있다는 증거
|
12 개월
|
|
KMT2D 유전자의 병원성 변이와 관련된 후성유전적 특징(KABUKI 증후군)
기간: 12 개월
|
병원성 또는 아마도 병원성 변이가 있는 태아의 태아 조직 DNA에서 후생유전학적 특징이 있다는 증거
|
12 개월
|
2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
|
태아와 출생 후 후성유전학적 특징 사이의 차등적 메틸화
기간: 12 개월
|
태아와 출생 후 후성유전학적 특징 사이의 차별적인 메틸화의 증거
|
12 개월
|
|
조직과 양수 후성유전학적 특징 사이의 차별적인 메틸화
기간: 12 개월
|
조직과 양수 후성유전적 특징 사이의 차등적 메틸화에 대한 증거
|
12 개월
|
|
각 후성유전적 시그니처에 대한 통계적 예측 매개변수
기간: 12 개월
|
각 후성유전적 시그니처에 대한 통계적 예측 매개변수 측정
|
12 개월
|
|
태아 병리학에서 새로운 후생유전학적 특징의 확인
기간: 12 개월
|
HYLS1, TCTN3 및 FLVCR2 유전자와 관련된 독점적 병리의 뉴스 후성유전적 특징 식별
|
12 개월
|
공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
수사관
- 연구 책임자: Manon TESSIER, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
간행물 및 유용한 링크
연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.
일반 간행물
- Butcher DT, Cytrynbaum C, Turinsky AL, Siu MT, Inbar-Feigenberg M, Mendoza-Londono R, Chitayat D, Walker S, Machado J, Caluseriu O, Dupuis L, Grafodatskaya D, Reardon W, Gilbert-Dussardier B, Verloes A, Bilan F, Milunsky JM, Basran R, Papsin B, Stockley TL, Scherer SW, Choufani S, Brudno M, Weksberg R. CHARGE and Kabuki Syndromes: Gene-Specific DNA Methylation Signatures Identify Epigenetic Mechanisms Linking These Clinically Overlapping Conditions. Am J Hum Genet. 2017 May 4;100(5):773-788. doi: 10.1016/j.ajhg.2017.04.004.
- Aref-Eshghi E, Kerkhof J, Pedro VP; Groupe DI France; Barat-Houari M, Ruiz-Pallares N, Andrau JC, Lacombe D, Van-Gils J, Fergelot P, Dubourg C, Cormier-Daire V, Rondeau S, Lecoquierre F, Saugier-Veber P, Nicolas G, Lesca G, Chatron N, Sanlaville D, Vitobello A, Faivre L, Thauvin-Robinet C, Laumonnier F, Raynaud M, Alders M, Mannens M, Henneman P, Hennekam RC, Velasco G, Francastel C, Ulveling D, Ciolfi A, Pizzi S, Tartaglia M, Heide S, Heron D, Mignot C, Keren B, Whalen S, Afenjar A, Bienvenu T, Campeau PM, Rousseau J, Levy MA, Brick L, Kozenko M, Balci TB, Siu VM, Stuart A, Kadour M, Masters J, Takano K, Kleefstra T, de Leeuw N, Field M, Shaw M, Gecz J, Ainsworth PJ, Lin H, Rodenhiser DI, Friez MJ, Tedder M, Lee JA, DuPont BR, Stevenson RE, Skinner SA, Schwartz CE, Genevieve D, Sadikovic B. Evaluation of DNA Methylation Episignatures for Diagnosis and Phenotype Correlations in 42 Mendelian Neurodevelopmental Disorders. Am J Hum Genet. 2020 Mar 5;106(3):356-370. doi: 10.1016/j.ajhg.2020.01.019. Epub 2020 Feb 27.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
2026년 2월 26일
기본 완료 (추정된)
2026년 8월 26일
연구 완료 (추정된)
2026년 8월 26일
연구 등록 날짜
최초 제출
2024년 6월 20일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2024년 6월 20일
처음 게시됨 (실제)
2024년 6월 26일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2026년 3월 27일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2026년 3월 24일
마지막으로 확인됨
2026년 3월 1일
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- APHP231311
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?
아니요
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
아니
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
아니
이 정보는 변경 없이 clinicaltrials.gov 웹사이트에서 직접 가져온 것입니다. 귀하의 연구 세부 정보를 변경, 제거 또는 업데이트하도록 요청하는 경우 register@clinicaltrials.gov. 문의하십시오. 변경 사항이 clinicaltrials.gov에 구현되는 즉시 저희 웹사이트에도 자동으로 업데이트됩니다. .