Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Karakterisering og bidrag av genomomfattende DNA-metylering (DNA-metyleringsepisignaturer) ved sjeldne sykdommer med prenatal debut (FOETEPISIGN)

24. mars 2026 oppdatert av: Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Det er nødvendig å definere referanse-DNA-metyleringsepisignaturer fra fosterets DNA. Hypotesene er:

  • Det er mulig å definere referanse DNA-metylering Episignaturer fra foster-DNA ekstrahert fra fostervann eller frosset vev samlet under obduksjonsundersøkelsen
  • Fosterets DNA-metyleringsepisignaturer kan være forskjellige fra postanale DNA-metyleringsepisignaturer definert på DNA ekstrahert fra blod

Studieoversikt

Detaljert beskrivelse

Medfødte anomalier (CA) kompliserer 3 til 5 % av svangerskapene og kan være assosiert med genetiske lidelser. Diagnostisering av genetiske sykdommer er en stor medisinsk utfordring, spesielt under graviditet.

I løpet av de siste to tiårene har neste generasjons sekvensering (NGS) revolusjonert vår evne til å identifisere den genetiske tilstanden assosiert med CA. Under graviditet identifiserte prenatal eksomsekvensering en tilleggsdiagnose hos rundt 30 % av fostre med CA når standard kromosomundersøkelser (karyotype og kromosomal mikroarray-analyse, CMA) ikke gir en diagnose.

Til tross for disse store fremskritt forblir rundt 40 % av sjeldne sykdommer uløste, inkludert 10–15 % av pasientene som har varianter av usikker betydning (VUS).

Etter fødselen kan ytterligere funksjonelle analyser ("multi-OMICS"), inkludert genomomfattende DNA-metyleringsstudier, tilbys for å omklassifisere VUS.

DNA-metyleringsanomalier spiller en viktig rolle i patologier (utviklingsforstyrrelser og onkologi).

DNA-metylering Episignaturer, definert som de kumulative DNA-metyleringsmønstrene som forekommer ved flere CpG-dinukleotider på tvers av genomet, har blitt anerkjent for å være intrikat assosiert med mange menneskelige egenskaper, inkludert alder, kjønn og sykdomsstatus. Nylig har DNA Methylation Episignatures blitt identifisert i blodet til barn eller voksne for flere godt karakteriserte genetiske sykdommer. Imidlertid kan disse postnatale DNA-metyleringsepisignaturene ikke brukes under graviditet, fordi DNA-metylering endres fra ett vev til et annet og over tid, spesielt under fosterutvikling. I tillegg er vevene som er tilgjengelige under graviditet forskjellig fra de som er analysert postnatalt (blod).

Studietype

Observasjonsmessig

Registrering (Antatt)

63

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studer Kontakt Backup

Studiesteder

      • Paris, Frankrike, 75015
        • Rekruttering
        • Department of Genomic Medicine for Rare Diseases and the Multidisciplinary Center for Prenatal Diagnosis of the Necker-Enfants malades Hospital
        • Ta kontakt med:

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Alder som er kvalifisert for studier

  • Barn
  • Voksen

Tar imot friske frivillige

Ja

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Studiepopulasjonen er hentet fra Institutt for genomisk medisin for sjeldne sykdommer og Multidisciplinary Center for Prenatal Diagnosis of the Necker-Enfants malades Hospital - APHP - GHU Paris Cité.

Foreldrene skrev under på et samtykke til oppbevaring og bruk av biologiske prøver, der de sa at disse prøvene tatt som en del av behandlingen kunne gjenbrukes til medisinsk forskning.

Beskrivelse

Inklusjonskriterier:

  • Pasientinkluderingskriterier:

    • Fostre med obduksjonsundersøkelse som en del av den etiologiske diagnosen utviklingsavvik ved avdelingen Genomic Medicine of Rare Diseases ved Necker Children's Hospital, og hvis DNA ekstrahert fra lunge og fostervann er tilgjengelig
    • ELLER et barn som blir tatt hånd om i avdelingen Genomic Medicine for Rare Diseases ved Necker Children's Hospital, og hvis DNA ekstrahert fra fullblod er tilgjengelig
    • med patogen eller sannsynligvis patogen variasjon i et gen etter CHD7, KMT2D, HYLS1, TCTN3 eller FLVCR2
    • hvis foreldre har samtykket til molekylær genetisk testing som en del av diagnose og forskning
  • Negative kontroller:

    • Fostre med obduksjonsundersøkelse som en del av den etiologiske diagnosen utviklingsavvik ved avdelingen Genomic Medicine of Rare Diseases ved Necker Children's Hospital, og hvis DNA ekstrahert fra lunge og fostervann er tilgjengelig
    • ELLER et barn som blir tatt hånd om i avdelingen Genomic Medicine for Rare Diseases ved Necker Children's Hospital, og hvis DNA ekstrahert fra fullblod er tilgjengelig
    • har ikke patogen eller sannsynligvis patogen variasjon i et gen etter CHD7, KMT2D, HYLS1, TCTN3 eller FLVCR2
    • hvis foreldre har samtykket til molekylær genetisk testing som en del av diagnose og forskning
  • For alle:

    • For levende deltakere: Ikke-motsigelse fra innehavere av foreldremyndighet mot gjenbruk av kliniske data og biologiske prøver samlet inn og lagret i forbindelse med omsorg (samtykke til omsorg).

    • For avdøde deltakere:

  • Samtykke fra innehaverne av foreldremyndighet til bruk av prøvene som oppbevares til forskningsformål, signert som en del av behandlingen
  • Ingen omtale av motstand mot gjenbruk av kliniske data fra behandlingen i pasientens journal

Ekskluderingskriterier:

  • Avslag på obduksjon ved fostertap
  • Foreldres avslag på molekylære undersøkelser

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort
Intervensjon / Behandling
Arbeidspakke 1, gruppe 1
Pasienter (barn) med CHARGE-syndrom
Genomisk DNA vil bli behandlet med bisulfitt. 500 ng bearbeidet DNA blir deretter hybridisert på en EPICv2-array Infinium-metylering (Illumina, San Diego, CA, USA). Denne mikromatrisen muliggjør analyse av omtrent 865 000 metyleringssteder ved promotere, enhancere, CpG-øyer, intergene og intragene regioner. Det er den mest brukte brikken i litteraturen, inkludert nesten alle de EPIGENETISKE SIGNATURENE rapportert i human patologi.
Arbeidspakke 1, gruppe 2
Sunne negative kontroller (barn) matchet for alder og kjønn
Genomisk DNA vil bli behandlet med bisulfitt. 500 ng bearbeidet DNA blir deretter hybridisert på en EPICv2-array Infinium-metylering (Illumina, San Diego, CA, USA). Denne mikromatrisen muliggjør analyse av omtrent 865 000 metyleringssteder ved promotere, enhancere, CpG-øyer, intergene og intragene regioner. Det er den mest brukte brikken i litteraturen, inkludert nesten alle de EPIGENETISKE SIGNATURENE rapportert i human patologi.
Arbeidspakke 1, gruppe 3
Fostre med CHARGE-syndrom
Genomisk DNA vil bli behandlet med bisulfitt. 500 ng bearbeidet DNA blir deretter hybridisert på en EPICv2-array Infinium-metylering (Illumina, San Diego, CA, USA). Denne mikromatrisen muliggjør analyse av omtrent 865 000 metyleringssteder ved promotere, enhancere, CpG-øyer, intergene og intragene regioner. Det er den mest brukte brikken i litteraturen, inkludert nesten alle de EPIGENETISKE SIGNATURENE rapportert i human patologi.
Arbeidspakke 1, gruppe 4
Fostre uten genetisk patologi
Genomisk DNA vil bli behandlet med bisulfitt. 500 ng bearbeidet DNA blir deretter hybridisert på en EPICv2-array Infinium-metylering (Illumina, San Diego, CA, USA). Denne mikromatrisen muliggjør analyse av omtrent 865 000 metyleringssteder ved promotere, enhancere, CpG-øyer, intergene og intragene regioner. Det er den mest brukte brikken i litteraturen, inkludert nesten alle de EPIGENETISKE SIGNATURENE rapportert i human patologi.
Arbeidspakke 2, gruppe 5
Pasienter (barn) med KABUKI syndrom
Genomisk DNA vil bli behandlet med bisulfitt. 500 ng bearbeidet DNA blir deretter hybridisert på en EPICv2-array Infinium-metylering (Illumina, San Diego, CA, USA). Denne mikromatrisen muliggjør analyse av omtrent 865 000 metyleringssteder ved promotere, enhancere, CpG-øyer, intergene og intragene regioner. Det er den mest brukte brikken i litteraturen, inkludert nesten alle de EPIGENETISKE SIGNATURENE rapportert i human patologi.
Arbeidspakke 2, gruppe 6
Fostre med KABUKI syndrom
Genomisk DNA vil bli behandlet med bisulfitt. 500 ng bearbeidet DNA blir deretter hybridisert på en EPICv2-array Infinium-metylering (Illumina, San Diego, CA, USA). Denne mikromatrisen muliggjør analyse av omtrent 865 000 metyleringssteder ved promotere, enhancere, CpG-øyer, intergene og intragene regioner. Det er den mest brukte brikken i litteraturen, inkludert nesten alle de EPIGENETISKE SIGNATURENE rapportert i human patologi.
Arbeidspakke 3, gruppe 7
Fostre med hydrolethalus syndrom
Genomisk DNA vil bli behandlet med bisulfitt. 500 ng bearbeidet DNA blir deretter hybridisert på en EPICv2-array Infinium-metylering (Illumina, San Diego, CA, USA). Denne mikromatrisen muliggjør analyse av omtrent 865 000 metyleringssteder ved promotere, enhancere, CpG-øyer, intergene og intragene regioner. Det er den mest brukte brikken i litteraturen, inkludert nesten alle de EPIGENETISKE SIGNATURENE rapportert i human patologi.
Arbeidspakke 3, gruppe 8
Fostre med Meckel/OFD IV syndrom
Genomisk DNA vil bli behandlet med bisulfitt. 500 ng bearbeidet DNA blir deretter hybridisert på en EPICv2-array Infinium-metylering (Illumina, San Diego, CA, USA). Denne mikromatrisen muliggjør analyse av omtrent 865 000 metyleringssteder ved promotere, enhancere, CpG-øyer, intergene og intragene regioner. Det er den mest brukte brikken i litteraturen, inkludert nesten alle de EPIGENETISKE SIGNATURENE rapportert i human patologi.
Arbeidspakke 3, gruppe 9
Fostre med Fowler syndrom
Genomisk DNA vil bli behandlet med bisulfitt. 500 ng bearbeidet DNA blir deretter hybridisert på en EPICv2-array Infinium-metylering (Illumina, San Diego, CA, USA). Denne mikromatrisen muliggjør analyse av omtrent 865 000 metyleringssteder ved promotere, enhancere, CpG-øyer, intergene og intragene regioner. Det er den mest brukte brikken i litteraturen, inkludert nesten alle de EPIGENETISKE SIGNATURENE rapportert i human patologi.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Epigenetisk signatur assosiert med patogene variasjoner i CHD7-genet (CHARGE-syndrom)
Tidsramme: 12 måneder
Bevis på epigenetisk signatur fra fostervevs-DNA hos fostre med patogen eller sannsynligvis patogen variasjon
12 måneder
Epigenetisk signatur assosiert med patogene variasjoner i KMT2D-genet (KABUKI syndrom)
Tidsramme: 12 måneder
Bevis på epigenetisk signatur fra fostervevs-DNA hos fostre med patogen eller sannsynligvis patogen variasjon
12 måneder

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Differensiell metylering mellom føtal og postnatal epigenetisk signatur
Tidsramme: 12 måneder
Bevis på differensiell metylering mellom foster og postnatal epigenetisk signatur
12 måneder
Differensiell metylering mellom epigenetiske signaturer av vev og fostervann
Tidsramme: 12 måneder
Bevis på differensiell metylering mellom epigenetiske signaturer av vev og fostervann
12 måneder
Statistisk prediksjonsparameter for hver epigenetisk signatur
Tidsramme: 12 måneder
Måling av den statistiske prediksjonsparameteren for hver epigenetisk signatur
12 måneder
Identifikasjon av en ny epigenetisk signatur i føtale patologier
Tidsramme: 12 måneder
Identifikasjon av epigenetiske nyhetssignaturer av utelukkende patologier assosiert med HYLS1-, TCTN3- og FLVCR2-genene
12 måneder

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Etterforskere

  • Studieleder: Manon TESSIER, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Publikasjoner og nyttige lenker

Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.

Generelle publikasjoner

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

26. februar 2026

Primær fullføring (Antatt)

26. august 2026

Studiet fullført (Antatt)

26. august 2026

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

20. juni 2024

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

20. juni 2024

Først lagt ut (Faktiske)

26. juni 2024

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

27. mars 2026

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

24. mars 2026

Sist bekreftet

1. mars 2026

Mer informasjon

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Abonnere