Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Karakterisering en bijdrage van genoombrede DNA-methylatie (DNA-methylatie-episignaturen) bij zeldzame ziekten met prenataal begin (FOETEPISIGN)

24 maart 2026 bijgewerkt door: Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Het is noodzakelijk om referentie-DNA-methylatie-episignaturen te definiëren op basis van foetaal DNA. De hypothesen zijn:

  • Het is mogelijk om referentie-DNA-methylatie-episignaturen te definiëren op basis van foetaal DNA dat is geëxtraheerd uit vruchtwater of bevroren weefsel dat is verzameld tijdens het postmortemonderzoek
  • Foetale DNA-methylatie-episignaturen kunnen verschillen van postanale DNA-methylatie-episignaturen gedefinieerd op DNA geëxtraheerd uit bloed

Studie Overzicht

Gedetailleerde beschrijving

Congenitale afwijkingen (CA) compliceren 3 tot 5% van de zwangerschappen en kunnen in verband worden gebracht met genetische aandoeningen. De diagnose van genetische ziekten is een grote medische uitdaging, vooral tijdens de zwangerschap.

De afgelopen twintig jaar heeft next-generation sequencing (NGS) een revolutie teweeggebracht in ons vermogen om de genetische aandoening die verband houdt met CA te identificeren. Tijdens de zwangerschap identificeerde prenatale exoomsequencing een aanvullende diagnose bij ongeveer 30% van de foetussen met CA wanneer standaard chromosomaal onderzoek (karyotype en chromosomale microarray-analyse, CMA) geen diagnose opleverde.

Ondanks deze grote vooruitgang blijft ongeveer 40% van de zeldzame ziekten onopgelost, waaronder 10-15% van de patiënten met varianten van onzekere betekenis (VUS).

Na de geboorte kunnen aanvullende functionele analyses ("multi-OMICS"), waaronder genoombrede DNA-methylatiestudies, worden aangeboden om VUS opnieuw te classificeren.

DNA-methyleringsafwijkingen spelen een belangrijke rol bij pathologieën (ontwikkelingsstoornissen en oncologie).

DNA-methylatie Episignaturen, gedefinieerd als de cumulatieve DNA-methylatiepatronen die voorkomen bij meerdere CpG-dinucleotiden in het genoom, zijn op ingewikkelde wijze geassocieerd met veel menselijke eigenschappen, waaronder leeftijd, geslacht en ziektestatus. Onlangs zijn DNA-methylatie-episignaturen geïdentificeerd in het bloed van kinderen of volwassenen voor verschillende goed gekarakteriseerde genetische ziekten. Deze postnatale DNA-methylatie-episignaturen kunnen echter niet tijdens de zwangerschap worden gebruikt, omdat DNA-methylatie van het ene weefsel naar het andere en in de loop van de tijd verandert, vooral tijdens de ontwikkeling van de foetus. Bovendien zijn de weefsels die beschikbaar zijn tijdens de zwangerschap anders dan de weefsels die postnataal worden geanalyseerd (bloed).

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Geschat)

63

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Contact Back-up

Studie Locaties

      • Paris, Frankrijk, 75015
        • Werving
        • Department of Genomic Medicine for Rare Diseases and the Multidisciplinary Center for Prenatal Diagnosis of the Necker-Enfants malades Hospital
        • Contact:

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

  • Kind
  • Volwassen

Accepteert gezonde vrijwilligers

Ja

Bemonsteringsmethode

Niet-waarschijnlijkheidssteekproef

Studie Bevolking

De onderzoekspopulatie is afkomstig van de afdeling Genomische Geneeskunde voor Zeldzame Ziekten en het Multidisciplinaire Centrum voor Prenatale Diagnose van het Necker-Enfants malades Ziekenhuis - APHP - GHU Paris Cité.

De ouders ondertekenden een toestemming voor de opslag en het gebruik van biologische monsters, waarin stond dat deze monsters, genomen als onderdeel van de behandeling, hergebruikt konden worden voor medisch onderzoek.

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  • Patiëntinclusiecriteria:

    • Foetussen met een postmortemonderzoek als onderdeel van de etiologische diagnose van ontwikkelingsstoornissen op de afdeling Genomische Geneeskunde van Zeldzame Ziekten van het Necker Kinderziekenhuis, en van wie het uit long- en vruchtwater geëxtraheerde DNA beschikbaar is
    • OF een kind dat wordt verzorgd op de afdeling Genomische Geneeskunde voor Zeldzame Ziekten van het Necker Kinderziekenhuis en wiens DNA uit volbloed beschikbaar is
    • met pathogene of waarschijnlijk pathogene variatie in een gen volgend op CHD7, KMT2D, HYLS1, TCTN3 of FLVCR2
    • wiens ouders hebben ingestemd met moleculair genetisch testen als onderdeel van diagnose en onderzoek
  • Negatieve controles:

    • Foetussen met een postmortemonderzoek als onderdeel van de etiologische diagnose van ontwikkelingsstoornissen op de afdeling Genomische Geneeskunde van Zeldzame Ziekten van het Necker Kinderziekenhuis, en wier DNA geëxtraheerd uit long- en vruchtwater beschikbaar is
    • OF een kind dat wordt verzorgd op de afdeling Genomische Geneeskunde voor Zeldzame Ziekten van het Necker Kinderziekenhuis en wiens DNA uit volbloed beschikbaar is
    • heeft geen pathogene of waarschijnlijk pathogene variatie in een gen volgend op CHD7, KMT2D, HYLS1, TCTN3 of FLVCR2
    • wiens ouders hebben ingestemd met moleculair genetisch testen als onderdeel van diagnose en onderzoek
  • Voor iedereen:

    • Voor levende deelnemers: Geen bezwaar van houders van ouderlijk gezag tegen het hergebruik van klinische gegevens en biologische monsters die zijn verzameld en opgeslagen in het kader van de zorg (toestemming van zorg).

    • Voor overleden deelnemers:

  • Toestemming van de houders van het ouderlijk gezag voor het gebruik van de bewaarde monsters voor onderzoeksdoeleinden, ondertekend als onderdeel van de behandeling
  • Geen melding gemaakt van verzet tegen hergebruik van klinische gegevens uit de behandeling in het medisch dossier van de patiënt

Uitsluitingscriteria:

  • Weigering van postmortemonderzoek in geval van verlies van de foetus
  • Weigering van ouders om moleculair onderzoek te doen

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Cohorten en interventies

Groep / Cohort
Interventie / Behandeling
Werkpakket 1, groep 1
Patiënten (kinderen) met CHARGE-syndroom
Genomisch DNA zal worden behandeld met bisulfiet. 500 ng verwerkt DNA wordt vervolgens gehybriseerd op een EPICv2-array Infinium-methylatie (Illumina, San Diego, CA, VS). Deze microarray maakt de analyse mogelijk van ongeveer 865.000 methyleringsplaatsen op promoters, versterkers, CpG-eilanden, intergene en intragene regio's. Het is de meest gebruikte chip in de literatuur en omvat bijna alle EPIGENETISCHE HANDTEKENINGEN die in de menselijke pathologie zijn gerapporteerd.
Werkpakket 1, groep 2
Gezonde negatieve controles (kinderen) kwamen overeen op basis van leeftijd en geslacht
Genomisch DNA zal worden behandeld met bisulfiet. 500 ng verwerkt DNA wordt vervolgens gehybriseerd op een EPICv2-array Infinium-methylatie (Illumina, San Diego, CA, VS). Deze microarray maakt de analyse mogelijk van ongeveer 865.000 methyleringsplaatsen op promoters, versterkers, CpG-eilanden, intergene en intragene regio's. Het is de meest gebruikte chip in de literatuur en omvat bijna alle EPIGENETISCHE HANDTEKENINGEN die in de menselijke pathologie zijn gerapporteerd.
Werkpakket 1, groep 3
Foetussen met CHARGE-syndroom
Genomisch DNA zal worden behandeld met bisulfiet. 500 ng verwerkt DNA wordt vervolgens gehybriseerd op een EPICv2-array Infinium-methylatie (Illumina, San Diego, CA, VS). Deze microarray maakt de analyse mogelijk van ongeveer 865.000 methyleringsplaatsen op promoters, versterkers, CpG-eilanden, intergene en intragene regio's. Het is de meest gebruikte chip in de literatuur en omvat bijna alle EPIGENETISCHE HANDTEKENINGEN die in de menselijke pathologie zijn gerapporteerd.
Werkpakket 1, groep 4
Foetussen zonder genetische pathologie
Genomisch DNA zal worden behandeld met bisulfiet. 500 ng verwerkt DNA wordt vervolgens gehybriseerd op een EPICv2-array Infinium-methylatie (Illumina, San Diego, CA, VS). Deze microarray maakt de analyse mogelijk van ongeveer 865.000 methyleringsplaatsen op promoters, versterkers, CpG-eilanden, intergene en intragene regio's. Het is de meest gebruikte chip in de literatuur en omvat bijna alle EPIGENETISCHE HANDTEKENINGEN die in de menselijke pathologie zijn gerapporteerd.
Werkpakket 2, groep 5
Patiënten (kinderen) met het KABUKI-syndroom
Genomisch DNA zal worden behandeld met bisulfiet. 500 ng verwerkt DNA wordt vervolgens gehybriseerd op een EPICv2-array Infinium-methylatie (Illumina, San Diego, CA, VS). Deze microarray maakt de analyse mogelijk van ongeveer 865.000 methyleringsplaatsen op promoters, versterkers, CpG-eilanden, intergene en intragene regio's. Het is de meest gebruikte chip in de literatuur en omvat bijna alle EPIGENETISCHE HANDTEKENINGEN die in de menselijke pathologie zijn gerapporteerd.
Werkpakket 2, groep 6
Foetussen met het KABUKI-syndroom
Genomisch DNA zal worden behandeld met bisulfiet. 500 ng verwerkt DNA wordt vervolgens gehybriseerd op een EPICv2-array Infinium-methylatie (Illumina, San Diego, CA, VS). Deze microarray maakt de analyse mogelijk van ongeveer 865.000 methyleringsplaatsen op promoters, versterkers, CpG-eilanden, intergene en intragene regio's. Het is de meest gebruikte chip in de literatuur en omvat bijna alle EPIGENETISCHE HANDTEKENINGEN die in de menselijke pathologie zijn gerapporteerd.
Werkpakket 3, groep 7
Foetussen met het hydrolethalussyndroom
Genomisch DNA zal worden behandeld met bisulfiet. 500 ng verwerkt DNA wordt vervolgens gehybriseerd op een EPICv2-array Infinium-methylatie (Illumina, San Diego, CA, VS). Deze microarray maakt de analyse mogelijk van ongeveer 865.000 methyleringsplaatsen op promoters, versterkers, CpG-eilanden, intergene en intragene regio's. Het is de meest gebruikte chip in de literatuur en omvat bijna alle EPIGENETISCHE HANDTEKENINGEN die in de menselijke pathologie zijn gerapporteerd.
Werkpakket 3, groep 8
Foetussen met het Meckel/OFD IV-syndroom
Genomisch DNA zal worden behandeld met bisulfiet. 500 ng verwerkt DNA wordt vervolgens gehybriseerd op een EPICv2-array Infinium-methylatie (Illumina, San Diego, CA, VS). Deze microarray maakt de analyse mogelijk van ongeveer 865.000 methyleringsplaatsen op promoters, versterkers, CpG-eilanden, intergene en intragene regio's. Het is de meest gebruikte chip in de literatuur en omvat bijna alle EPIGENETISCHE HANDTEKENINGEN die in de menselijke pathologie zijn gerapporteerd.
Werkpakket 3, groep 9
Foetussen met het Fowler-syndroom
Genomisch DNA zal worden behandeld met bisulfiet. 500 ng verwerkt DNA wordt vervolgens gehybriseerd op een EPICv2-array Infinium-methylatie (Illumina, San Diego, CA, VS). Deze microarray maakt de analyse mogelijk van ongeveer 865.000 methyleringsplaatsen op promoters, versterkers, CpG-eilanden, intergene en intragene regio's. Het is de meest gebruikte chip in de literatuur en omvat bijna alle EPIGENETISCHE HANDTEKENINGEN die in de menselijke pathologie zijn gerapporteerd.

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Epigenetische signatuur geassocieerd met pathogene variaties in het CHD7-gen (CHARGE-syndroom)
Tijdsspanne: 12 maanden
Bewijs van epigenetische signatuur van foetaal weefsel-DNA bij foetussen met pathogene of waarschijnlijk pathogene variatie
12 maanden
Epigenetische signatuur geassocieerd met pathogene variaties in het KMT2D-gen (KABUKI-syndroom)
Tijdsspanne: 12 maanden
Bewijs van epigenetische signatuur van foetaal weefsel-DNA bij foetussen met pathogene of waarschijnlijk pathogene variatie
12 maanden

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Differentiële methylatie tussen foetale en postnatale epigenetische signatuur
Tijdsspanne: 12 maanden
Bewijs van differentiële methylatie tussen foetale en postnatale epigenetische signatuur
12 maanden
Differentiële methylatie tussen epigenetische handtekeningen van weefsel en vruchtwater
Tijdsspanne: 12 maanden
Bewijs van differentiële methylatie tussen epigenetische handtekeningen van weefsel en vruchtwater
12 maanden
Statistische voorspellingsparameter voor elke epigenetische signatuur
Tijdsspanne: 12 maanden
Meting van de statistische voorspellingsparameter voor elke epigenetische signatuur
12 maanden
Identificatie van een nieuwe epigenetische signatuur in foetale pathologieën
Tijdsspanne: 12 maanden
Identificatie van nieuws-epigenetische handtekeningen van uitsluitend pathologieën geassocieerd met de HYLS1-, TCTN3- en FLVCR2-genen
12 maanden

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Onderzoekers

  • Studie directeur: Manon TESSIER, MD, PhD, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris

Publicaties en nuttige links

De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.

Algemene publicaties

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

26 februari 2026

Primaire voltooiing (Geschat)

26 augustus 2026

Studie voltooiing (Geschat)

26 augustus 2026

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

20 juni 2024

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

20 juni 2024

Eerst geplaatst (Werkelijk)

26 juni 2024

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

27 maart 2026

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

24 maart 2026

Laatst geverifieerd

1 maart 2026

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

NEE

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren