Verschillende soorten genetische gebeurtenissen bij patiënten met een verstandelijke beperking (CNV-Seq)

Momenteel is voor een patiënt met een verstandelijke beperking zonder een herkenbaar syndroom (in de meeste gevallen) de weg naar de diagnose vaak lang, vervelend en duur omdat verschillende benaderingen na elkaar worden gebruikt om structurele varianten (duplicaties, deleties en andere) te identificeren en aan te wijzen mutaties (sequencing van een of meer kandidaatgenen). De ontwikkeling van high-throughput sequencing-technieken (next generation sequencing: NGS) heeft de detectie van puntmutaties drastisch vergroot en biedt de mogelijkheid om een ​​groot aantal genen tegelijk te testen. NGS toont ook een enorm potentieel in het detecteren van structurele varianten. Het doel van dit onderzoek is het beoordelen van de gevoeligheid van een gelijktijdige detectie van puntmutaties en structurele varianten door NGS-benaderingen. Dit zou in één enkele stap het equivalent van het uitvoeren van een array-vergelijkende genomische hybridisatie (CGH)-analyse plus het uitvoeren van een gerichte sequentiebepaling van kandidaatgenen samenbrengen. Onderzoekers zullen twee benaderingen vergelijken voor deze gelijktijdige detectie: een gerichte verrijking van kandidaat-genen die coderen voor regio's met behulp van sondes die deze regio's bedekken die geassocieerd zijn met een ruggengraat van genomische sondes, een aanpak die onmiddellijk kan worden geïmplementeerd in de diagnostiek in het ziekenhuis, en een sequentiebepaling van het hele genoom ( WGS), dat momenteel een te duur hulpmiddel is voor routinematige diagnose, maar dat zou in de toekomst de benadering moeten zijn. Onderzoekers zullen deze twee benaderingen vergelijken met de traditionele: CGH-array + WGS. De implementatie van een "eenstaps"-strategie om beide soorten mutaties (punctueel en structureel) te detecteren, zou de toegang van patiënten tot een moleculaire diagnose versnellen en verbeteren.