Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Prospective Analysis of Seasonal Influenza - Viral Transmission and Evolution in the City of Basel, Switzerland

11 februari 2019 bijgewerkt door: University Hospital, Basel, Switzerland

Prospective Analysis of Seasonal Influenza - Viral Transmission and Evolution in the City of Basel, Switzerland [Prospektive Systemanalyse Der Saisonalen Influenza - Virustransmission Und Evolution in Der Stadt Basel] in German

Influenza associated illness has a global annual impact with high morbidity and mortality. Transmission mechanisms and rates are under-investigated and overall poorly understood.

This project aims to use epidemiological tools to understand the transmission and evolution of influenza viruses at an individual and population level within a small-scale city (Basel) through a combination of experimental, clinical and mathematical advances. The investigators aim to quantitatively characterize the viral transmission using novel molecular-epidemiological tools based on whole genome sequencing.

Studie Overzicht

Toestand

Voltooid

Conditie

Gedetailleerde beschrijving

In this prospective observational study, paediatric and adult outpatients presenting with influenza-like illness will be enrolled at the emergency departments of the University Hospital Basel (USB), the paediatric University Hospital of both Basel (UKBB), or a network of family doctors (associated with Center of Primary Health Care).

The Clinical Trial Unit at the University Hospital Basel will coordinated the recruitment process, collect data and sample all patients during the influenza season 2016/17. Samples will be collected such as whole blood, serum and DNA, nasopharyngeal swamps to diagnose influenza by polymerase chain reaction (PCR) assay and to determine colonization rates with Staphylococcus aureus and Streptococcus pneumonia. All samples except the first naso-pharyngeal swab for influenza diagnostics will be stored in a biobank and analysed in batches. Each influenza virus isolate will be sequenced using a "whole genome sequencing" approach. The viral transmission and evolution will be analysed using whole genome data for a detailed molecular and phylogenetic tree analysis, respectively. The epidemiological and geographical data will be incorporated into the phylogenetic model.

Specific aims are:

(i) to determine the impact of the most important epidemiological parameters, first focusing on the age profile, followed by children per house hold, and population density, on influenza transmission at an individual and population level, drawing on an analysis of baseline humoral immunity and whole genome sequencing data, (ii) to understand the viral evolution during seasonal epidemics, (iii) to develop dynamic mathematical models that are able to predict viral transmission and evolution based on the retrospective results from (i) and (ii) and to validate this model in future influenza seasons.

To realize the interdisciplinary approach, the investigators will rely on the expertise in mathematical modelling of viral epidemiology and evolution and established geographical expertise, next generation sequencing, clinical epidemiology, and immunologic diagnostic techniques.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Werkelijk)

800

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studie Locaties

  • Zwitserland
      • Basel, Zwitserland, 4031
        • University Hospital Basel
      • Basel, Zwitserland, 4031
        • Federal Institute of Technology Zurich
      • Basel, Zwitserland, 4031
        • University Children's Hospital
      • Basel, Zwitserland, 4031
        • Universitätres Zentrum für Hausarztmedizin beider Basel, University of Basel

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

  • Kind
  • Volwassen
  • Oudere volwassene

Accepteert gezonde vrijwilligers

Nee

Geslachten die in aanmerking komen voor studie

Allemaal

Bemonsteringsmethode

Kanssteekproef

Studie Bevolking

Paediatric or adult patients fulfilling the World Health Organization (WHO) definition of an influenza-like illness. A total number of 1000 influenza PCR-confirmed cases should be included.

Beschrijving

Inclusion Criteria:

  • Each pediatric or adult patient, which fulfill the Worl Health Organization (WHO) definition of Influenza like illness.
  • The case definition includes an acute respiratory infection with coughing, fever ≥38°C, and start of symptoms within the last 10 days.
  • Presentation of the patient with influenza-like illness on the emergency ward of the University Hospital Basel or the University Children Hospital of both Basel or a collaborating private practise.
  • Patient has to live in the city of Basel.

Exclusion Criteria:

  • Patients who are not living in the City of Basel.
  • Case definition for influenza like illness is not fulfilled.

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Investigation of the phylogenetic relation of viral isolates from participating patients using whole-genome sequencing and bioinformatics
Tijdsspanne: Baseline
The primary microbiological endpoint is the connection of two viral isolates via comparison and phylogenetic analysis by using the genetic information
Baseline

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

University Hospital, Basel, Switzerland

Medewerkers

University of Basel
Swiss Federal Institute of Technology
University Children's Hospital Basel

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Adrian Egli, PD Dr. FAMH, Clinical Microbiology, University Hospital Basel

Publicaties en nuttige links

De persoon die verantwoordelijk is voor het invoeren van informatie over het onderzoek stelt deze publicaties vrijwillig ter beschikking. Dit kan gaan over alles wat met het onderzoek te maken heeft.

Algemene publicaties

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start

1 januari 2017

Primaire voltooiing (Werkelijk)

1 mei 2018

Studie voltooiing (Werkelijk)

1 mei 2018

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

22 december 2016

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

2 januari 2017

Eerst geplaatst (Schatting)

4 januari 2017

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Werkelijk)

15 februari 2019

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

11 februari 2019

Laatst geverifieerd

1 februari 2019

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Trefwoorden

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • Influenza in Basel 2016/2017

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

NEE

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Klinische onderzoeken op Influenza

Zoek naar vergelijkbare onderzoeken

Sponsors en medewerkers

Medische omstandigheden

Geneesmiddelinterventies

CROs by country

CROs in Kazakhstan

Voorwaarden

Zeldzame ziekten

Geneesmiddelinterventies

Voedingssupplementen

Sponsor / medewerkers

Locaties

Abonneren