PaCIFiC-CUP klassifiserer kreft av ukjent primær
22. april 2026 oppdatert av: Xiao-Peng Tian, Sun Yat-sen University
PaCIFiC-CUP：Pan-Cancer Integrert Fingerprinting Classifier for identifisering av opprinnelsen til kreft hos ukjent primær: En multisenter toveis kohortstudie
Denne studien tar sikte på i første omgang å bruke maskinlæring på pan-cancer DNA-metyleringsdata fra offentlige databaser for å konstruere en DNA-metyleringsklassifiseringsmodell (PaCIFiC-CUP, pan-cancer integrert fingeravtrykkklassifisering av CUP) for diagnostisering av ulike typer kreft, spesielt det primære stedet av kreft av ukjent primær.
Målet er å oppnå diagnose av kreftpatologitype ved å analysere DNA-metyleringsmønstrene til kreftprøver, og dermed veilede etterfølgende presisjonsbehandling for kreft.
Studieoversikt
Status
Status
Rekruttering
Forhold
Forhold
Studietype
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Antatt)
Registrering
120
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Yiyang Zhang
- Telefonnummer: +8615652797092
- E-post: zhangyy@sysucc.org.cn
Studiesteder
-
-
Guangdong
-
Guangzhou, Guangdong, Kina, 510060
- Rekruttering
- Sun Yat-sen University Cancer Center
-
Ta kontakt med:
- Yiyang Zhang
- Telefonnummer: +8615652797092
- E-post: zhangyy@sysucc.org.cn
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Nei
Prøvetakingsmetode
Ikke-sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
Studiepopulasjonen består av pasienter diagnostisert med CUP som oppfyller inklusjons- og eksklusjonskriteriene.
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Pasientprøvene ble innhentet fra Sun Yat-sen University Cancer Center og tilknyttede samarbeidende sentre, med skriftlig samtykke fra pasientene som godkjente bruken av prøvene til forskningsformål.
- Etter standardvurderinger (sykehistorie, fysisk undersøkelse, fullstendig blodtelling, biokjemi, computertomografi av nakke, bryst, mage og bekken, målrettede evalueringer av alle symptomatiske områder, patologi og immunhistokjemi), ble diagnosen bestemt som en primær sted ukjent tumor (inkludert adenokarsinom, plateepitelkarsinom, udifferensiert karsinom, nevroendokrint karsinom, sarkom, etc).
- Diagnosen ble bekreftet ved deltakende institusjon og pasienten hadde fått systemisk terapi.
- Fullstendige kliniske, patologiske og oppfølgingsdata for pasientene kan innhentes.
- ECOG ytelsesstatusscore: 0-2 poeng.
Ekskluderingskriterier:
- Gravide eller ammende kvinnelige pasienter.
- Størrelsen på svulstvevsprøven er for liten (svulstvev utgjør <70 % i biopsien eller skjærevevet).
- Organtransplantasjon eller historie med ikke-autolog (allogen) benmarg- eller stamcelletransplantasjon.
- Historie med tidligere svulster, med den nåværende tilstanden som en tilbakevendende svulst.
- Hematologiske maligniteter (unntatt lymfom).
- Andre sykdommer som kan påvirke pasientens overlevelse alvorlig, for eksempel alvorlige kardiovaskulære eller cerebrovaskulære sykdommer, sepsis, alvorlige traumer eller brannskader, etc.
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Antall grupper / kohorter
2
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / KohortGruppe / Kohort |
|---|
|
Stedsspesifikk terapigruppe
Disse pasientene med kreft av ukjent primær fikk stedsspesifikk behandling som matchet det bestemte stedet forutsagt av DNA-metyleringsklassifikatoren.
|
|
Empirisk terapigruppe
Disse pasientene med kreft av ukjent primær fikk empirisk terapi som ikke samsvarte med det bestemte stedet forutsagt av DNA-metyleringsklassifikatoren.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Samlet overlevelse
Tidsramme: Fra dato for diagnose til dato for død uansett årsak, vurdert opp til 24 måneder
|
Samlet overlevelse refererer til hvor lenge en person lever etter å ha blitt diagnostisert med kreft av ukjent primær, uten hensyn til noen spesifikk dødsårsak.
|
Fra dato for diagnose til dato for død uansett årsak, vurdert opp til 24 måneder
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Progresjonsfri overlevelse
Tidsramme: Fra dato for diagnose til dato for første dokumenterte progresjon eller dato for død uansett årsak, avhengig av hva som kom først, vurdert opp til 24 måneder
|
Progresjonsfri overlevelse refererer til hvor lang tid en pasient med kreft av ukjent primær forblir i live uten tegn eller symptomer på sykdomsprogresjon
|
Fra dato for diagnose til dato for første dokumenterte progresjon eller dato for død uansett årsak, avhengig av hva som kom først, vurdert opp til 24 måneder
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Sponsor
Sponsor
Samarbeidspartnere
Samarbeidspartnere
Publikasjoner og nyttige lenker
Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.
Generelle publikasjoner
- Kramer A, Bochtler T, Pauli C, Baciarello G, Delorme S, Hemminki K, Mileshkin L, Moch H, Oien K, Olivier T, Patrikidou A, Wasan H, Zarkavelis G, Pentheroudakis G, Fizazi K; ESMO Guidelines Committee. Electronic address: clinicalguidelines@esmo.org. Cancer of unknown primary: ESMO Clinical Practice Guideline for diagnosis, treatment and follow-up. Ann Oncol. 2023 Mar;34(3):228-246. doi: 10.1016/j.annonc.2022.11.013. Epub 2022 Dec 20. No abstract available.
- Paziewska A, Dabrowska M, Goryca K, Antoniewicz A, Dobruch J, Mikula M, Jarosz D, Zapala L, Borowka A, Ostrowski J. DNA methylation status is more reliable than gene expression at detecting cancer in prostate biopsy. Br J Cancer. 2014 Aug 12;111(4):781-9. doi: 10.1038/bjc.2014.337. Epub 2014 Jun 17.
- Wehmas LC, Hester SD, Wood CE. Direct formalin fixation induces widespread transcriptomic effects in archival tissue samples. Sci Rep. 2020 Sep 2;10(1):14497. doi: 10.1038/s41598-020-71521-w.
- Capper D, Jones DTW, Sill M, Hovestadt V, Schrimpf D, Sturm D, Koelsche C, Sahm F, Chavez L, Reuss DE, Kratz A, Wefers AK, Huang K, Pajtler KW, Schweizer L, Stichel D, Olar A, Engel NW, Lindenberg K, Harter PN, Braczynski AK, Plate KH, Dohmen H, Garvalov BK, Coras R, Holsken A, Hewer E, Bewerunge-Hudler M, Schick M, Fischer R, Beschorner R, Schittenhelm J, Staszewski O, Wani K, Varlet P, Pages M, Temming P, Lohmann D, Selt F, Witt H, Milde T, Witt O, Aronica E, Giangaspero F, Rushing E, Scheurlen W, Geisenberger C, Rodriguez FJ, Becker A, Preusser M, Haberler C, Bjerkvig R, Cryan J, Farrell M, Deckert M, Hench J, Frank S, Serrano J, Kannan K, Tsirigos A, Bruck W, Hofer S, Brehmer S, Seiz-Rosenhagen M, Hanggi D, Hans V, Rozsnoki S, Hansford JR, Kohlhof P, Kristensen BW, Lechner M, Lopes B, Mawrin C, Ketter R, Kulozik A, Khatib Z, Heppner F, Koch A, Jouvet A, Keohane C, Muhleisen H, Mueller W, Pohl U, Prinz M, Benner A, Zapatka M, Gottardo NG, Driever PH, Kramm CM, Muller HL, Rutkowski S, von Hoff K, Fruhwald MC, Gnekow A, Fleischhack G, Tippelt S, Calaminus G, Monoranu CM, Perry A, Jones C, Jacques TS, Radlwimmer B, Gessi M, Pietsch T, Schramm J, Schackert G, Westphal M, Reifenberger G, Wesseling P, Weller M, Collins VP, Blumcke I, Bendszus M, Debus J, Huang A, Jabado N, Northcott PA, Paulus W, Gajjar A, Robinson GW, Taylor MD, Jaunmuktane Z, Ryzhova M, Platten M, Unterberg A, Wick W, Karajannis MA, Mittelbronn M, Acker T, Hartmann C, Aldape K, Schuller U, Buslei R, Lichter P, Kool M, Herold-Mende C, Ellison DW, Hasselblatt M, Snuderl M, Brandner S, Korshunov A, von Deimling A, Pfister SM. DNA methylation-based classification of central nervous system tumours. Nature. 2018 Mar 22;555(7697):469-474. doi: 10.1038/nature26000. Epub 2018 Mar 14.
- Koelsche C, Schrimpf D, Stichel D, Sill M, Sahm F, Reuss DE, Blattner M, Worst B, Heilig CE, Beck K, Horak P, Kreutzfeldt S, Paff E, Stark S, Johann P, Selt F, Ecker J, Sturm D, Pajtler KW, Reinhardt A, Wefers AK, Sievers P, Ebrahimi A, Suwala A, Fernandez-Klett F, Casalini B, Korshunov A, Hovestadt V, Kommoss FKF, Kriegsmann M, Schick M, Bewerunge-Hudler M, Milde T, Witt O, Kulozik AE, Kool M, Romero-Perez L, Grunewald TGP, Kirchner T, Wick W, Platten M, Unterberg A, Uhl M, Abdollahi A, Debus J, Lehner B, Thomas C, Hasselblatt M, Paulus W, Hartmann C, Staszewski O, Prinz M, Hench J, Frank S, Versleijen-Jonkers YMH, Weidema ME, Mentzel T, Griewank K, de Alava E, Martin JD, Gastearena MAI, Chang KT, Low SYY, Cuevas-Bourdier A, Mittelbronn M, Mynarek M, Rutkowski S, Schuller U, Mautner VF, Schittenhelm J, Serrano J, Snuderl M, Buttner R, Klingebiel T, Buslei R, Gessler M, Wesseling P, Dinjens WNM, Brandner S, Jaunmuktane Z, Lyskjaer I, Schirmacher P, Stenzinger A, Brors B, Glimm H, Heining C, Tirado OM, Sainz-Jaspeado M, Mora J, Alonso J, Del Muro XG, Moran S, Esteller M, Benhamida JK, Ladanyi M, Wardelmann E, Antonescu C, Flanagan A, Dirksen U, Hohenberger P, Baumhoer D, Hartmann W, Vokuhl C, Flucke U, Petersen I, Mechtersheimer G, Capper D, Jones DTW, Frohling S, Pfister SM, von Deimling A. Sarcoma classification by DNA methylation profiling. Nat Commun. 2021 Jan 21;12(1):498. doi: 10.1038/s41467-020-20603-4.
- Hovestadt V, Remke M, Kool M, Pietsch T, Northcott PA, Fischer R, Cavalli FM, Ramaswamy V, Zapatka M, Reifenberger G, Rutkowski S, Schick M, Bewerunge-Hudler M, Korshunov A, Lichter P, Taylor MD, Pfister SM, Jones DT. Robust molecular subgrouping and copy-number profiling of medulloblastoma from small amounts of archival tumour material using high-density DNA methylation arrays. Acta Neuropathol. 2013 Jun;125(6):913-6. doi: 10.1007/s00401-013-1126-5. Epub 2013 May 14. No abstract available.
- Pajtler KW, Witt H, Sill M, Jones DT, Hovestadt V, Kratochwil F, Wani K, Tatevossian R, Punchihewa C, Johann P, Reimand J, Warnatz HJ, Ryzhova M, Mack S, Ramaswamy V, Capper D, Schweizer L, Sieber L, Wittmann A, Huang Z, van Sluis P, Volckmann R, Koster J, Versteeg R, Fults D, Toledano H, Avigad S, Hoffman LM, Donson AM, Foreman N, Hewer E, Zitterbart K, Gilbert M, Armstrong TS, Gupta N, Allen JC, Karajannis MA, Zagzag D, Hasselblatt M, Kulozik AE, Witt O, Collins VP, von Hoff K, Rutkowski S, Pietsch T, Bader G, Yaspo ML, von Deimling A, Lichter P, Taylor MD, Gilbertson R, Ellison DW, Aldape K, Korshunov A, Kool M, Pfister SM. Molecular Classification of Ependymal Tumors across All CNS Compartments, Histopathological Grades, and Age Groups. Cancer Cell. 2015 May 11;27(5):728-43. doi: 10.1016/j.ccell.2015.04.002.
- Sturm D, Orr BA, Toprak UH, Hovestadt V, Jones DTW, Capper D, Sill M, Buchhalter I, Northcott PA, Leis I, Ryzhova M, Koelsche C, Pfaff E, Allen SJ, Balasubramanian G, Worst BC, Pajtler KW, Brabetz S, Johann PD, Sahm F, Reimand J, Mackay A, Carvalho DM, Remke M, Phillips JJ, Perry A, Cowdrey C, Drissi R, Fouladi M, Giangaspero F, Lastowska M, Grajkowska W, Scheurlen W, Pietsch T, Hagel C, Gojo J, Lotsch D, Berger W, Slavc I, Haberler C, Jouvet A, Holm S, Hofer S, Prinz M, Keohane C, Fried I, Mawrin C, Scheie D, Mobley BC, Schniederjan MJ, Santi M, Buccoliero AM, Dahiya S, Kramm CM, von Bueren AO, von Hoff K, Rutkowski S, Herold-Mende C, Fruhwald MC, Milde T, Hasselblatt M, Wesseling P, Rossler J, Schuller U, Ebinger M, Schittenhelm J, Frank S, Grobholz R, Vajtai I, Hans V, Schneppenheim R, Zitterbart K, Collins VP, Aronica E, Varlet P, Puget S, Dufour C, Grill J, Figarella-Branger D, Wolter M, Schuhmann MU, Shalaby T, Grotzer M, van Meter T, Monoranu CM, Felsberg J, Reifenberger G, Snuderl M, Forrester LA, Koster J, Versteeg R, Volckmann R, van Sluis P, Wolf S, Mikkelsen T, Gajjar A, Aldape K, Moore AS, Taylor MD, Jones C, Jabado N, Karajannis MA, Eils R, Schlesner M, Lichter P, von Deimling A, Pfister SM, Ellison DW, Korshunov A, Kool M. New Brain Tumor Entities Emerge from Molecular Classification of CNS-PNETs. Cell. 2016 Feb 25;164(5):1060-1072. doi: 10.1016/j.cell.2016.01.015.
- Pisanic TR 2nd, Wang Y, Sun H, Considine M, Li L, Wang TH, Wang TL, Shih IM. Methylomic Landscapes of Ovarian Cancer Precursor Lesions. Clin Cancer Res. 2020 Dec 1;26(23):6310-6320. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-20-0270. Epub 2020 Aug 17.
- Muller D, Gyorffy B. DNA methylation-based diagnostic, prognostic, and predictive biomarkers in colorectal cancer. Biochim Biophys Acta Rev Cancer. 2022 May;1877(3):188722. doi: 10.1016/j.bbcan.2022.188722. Epub 2022 Mar 17.
- Liu MC, Oxnard GR, Klein EA, Swanton C, Seiden MV; CCGA Consortium. Sensitive and specific multi-cancer detection and localization using methylation signatures in cell-free DNA. Ann Oncol. 2020 Jun;31(6):745-759. doi: 10.1016/j.annonc.2020.02.011. Epub 2020 Mar 30.
- Nunes SP, Moreira-Barbosa C, Salta S, Palma de Sousa S, Pousa I, Oliveira J, Soares M, Rego L, Dias T, Rodrigues J, Antunes L, Henrique R, Jeronimo C. Cell-Free DNA Methylation of Selected Genes Allows for Early Detection of the Major Cancers in Women. Cancers (Basel). 2018 Sep 26;10(10):357. doi: 10.3390/cancers10100357.
- Moran S, Martinez-Cardus A, Sayols S, Musulen E, Balana C, Estival-Gonzalez A, Moutinho C, Heyn H, Diaz-Lagares A, de Moura MC, Stella GM, Comoglio PM, Ruiz-Miro M, Matias-Guiu X, Pazo-Cid R, Anton A, Lopez-Lopez R, Soler G, Longo F, Guerra I, Fernandez S, Assenov Y, Plass C, Morales R, Carles J, Bowtell D, Mileshkin L, Sia D, Tothill R, Tabernero J, Llovet JM, Esteller M. Epigenetic profiling to classify cancer of unknown primary: a multicentre, retrospective analysis. Lancet Oncol. 2016 Oct;17(10):1386-1395. doi: 10.1016/S1470-2045(16)30297-2. Epub 2016 Aug 27.
- Zhang Z, Lu Y, Vosoughi S, Levy JJ, Christensen BC, Salas LA. HiTAIC: hierarchical tumor artificial intelligence classifier traces tissue of origin and tumor type in primary and metastasized tumors using DNA methylation. NAR Cancer. 2023 Apr 19;5(2):zcad017. doi: 10.1093/narcan/zcad017. eCollection 2023 Jun.
- Greco FA, Lennington WJ, Spigel DR, Hainsworth JD. Molecular profiling diagnosis in unknown primary cancer: accuracy and ability to complement standard pathology. J Natl Cancer Inst. 2013 Jun 5;105(11):782-90. doi: 10.1093/jnci/djt099. Epub 2013 May 2.
- Maros ME, Capper D, Jones DTW, Hovestadt V, von Deimling A, Pfister SM, Benner A, Zucknick M, Sill M. Machine learning workflows to estimate class probabilities for precision cancer diagnostics on DNA methylation microarray data. Nat Protoc. 2020 Feb;15(2):479-512. doi: 10.1038/s41596-019-0251-6. Epub 2020 Jan 13.
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
1. juli 2023
Primær fullføring (Antatt)
Primær fullføring
31. desember 2026
Studiet fullført (Antatt)
Studiet fullført
31. desember 2026
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt
14. november 2023
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
20. november 2023
Først lagt ut (Faktiske)
Først lagt ut
21. november 2023
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Sist oppdatering lagt ut
23. april 2026
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
22. april 2026
Sist bekreftet
Sist bekreftet
1. april 2026
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
Andre studie-ID-numre
- PaCIFiC-CUP
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
NEI
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
produkt produsert i og eksportert fra USA
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .