Denne siden ble automatisk oversatt og nøyaktigheten av oversettelsen er ikke garantert. Vennligst referer til engelsk versjon for en kildetekst.

Pre- and On-treatment Multi-omics Profiling of Locally Advanced Rectal Cancer

2. november 2026 oppdatert av: Yong Yang, Fujian Medical University Union Hospital

A Prospective Observational Study of Tumour Microenvironment Remodelling During Neoadjuvant Therapy in Locally Advanced Rectal Cancer Using Single-Cell and Spatial Multi-omics

This prospective observational study characterises the tumour immune microenvironment and microbial ecology of locally advanced rectal cancer before and during neoadjuvant therapy. Tumour tissue and peripheral blood are profiled by whole-genome sequencing, single-cell RNA sequencing with paired T-cell and B-cell receptor repertoire sequencing, spatial transcriptomics of formalin-fixed paraffin-embedded sections, multiplex immunofluorescence, and blood-based proteomic, cytokine and bulk T-cell receptor analyses. The study examines how immune and stromal states change during treatment and how they relate to major pathological response.

Studieoversikt

Status

Status

Indikerer gjeldende rekrutteringsstatus eller utvidet tilgangsstatus.
Rekruttering

Forhold

Forhold

Sykdommen, lidelsen, syndromet, sykdommen eller skaden som studeres. På ClinicalTrials.gov kan tilstander også inkludere andre helserelaterte problemer, som levetid, livskvalitet og helserisiko.

Detaljert beskrivelse

Locally advanced rectal cancer is increasingly treated with total neoadjuvant therapy combining short-course radiotherapy, chemotherapy and programmed cell death protein 1 (PD-1) blockade, but the effect of treatment sequence on the tumour microenvironment is unresolved, and few patients have been profiled with matched pre- and on-treatment single-cell data. In this observational study, we collect tumour tissue and peripheral blood from patients with locally advanced rectal cancer at baseline, before any neoadjuvant treatment, and again after completion of short-course hypofractionated radiotherapy (5 Gy in 5 fractions) followed by one cycle of chemo-immunotherapy, together with archival formalin-fixed paraffin-embedded tissue where available. Additional formalin-fixed paraffin-embedded specimens from treatment-naive patients undergoing primary surgery, and from end-of-treatment biopsies, are used as controls for the spatial analyses. Fresh tumour tissue is analysed by whole-genome sequencing and by single-cell RNA sequencing with paired T-cell and B-cell receptor repertoire sequencing. Formalin-fixed paraffin-embedded tissue is analysed by spatial transcriptomics and multiplex immunofluorescence. Peripheral blood mononuclear cells are analysed by bulk T-cell receptor repertoire sequencing, and plasma or serum by proteomic and cytokine profiling where material permits. The principal clinical endpoint is major pathological response (mPR) at resection. We examine changes in immune and stromal populations between baseline and the on-treatment time point, features of the immune microenvironment associated with mPR, and, as exploratory analyses, the tumour microbial ecology associated with response together with differences between neoadjuvant treatment sequences. Analyses are descriptive and hypothesis-generating; no intervention, treatment assignment or change in clinical care is involved. The study was approved by the Ethics Committee of Fujian Medical University Union Hospital (2024KY297, approved 30 December 2024; and 2024KJCX060, approved 18 September 2024); archival specimens are used under a waiver of additional informed consent, and fresh biopsy or surgical tissue and blood are collected with written informed consent.

Studietype

Studietype

Beskriver arten av en klinisk studie. Studietyper inkluderer intervensjonsstudier (også kalt kliniske studier), observasjonsstudier (inkludert pasientregistre) og utvidet tilgang.
Observasjonsmessig

Registrering (Antatt)

Registrering

Antall deltakere i en klinisk studie. Den "forventede" påmeldingen er måltallet for deltakere som forskerne trenger for studien.
100

Kontakter og plasseringer

Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.

Studiekontakt

Studiekontakt

Navn og kontaktinformasjon for personen som kan svare på påmeldingsspørsmål for en klinisk studie. Hvert sted hvor studien gjennomføres kan også ha en spesifikk kontakt, som kan være bedre i stand til å svare på disse spørsmålene.
  • Navn: Wan-cai Que
  • Telefonnummer: 0086-0591-86218304
  • E-post: xhyyjgb@163.com

Studiesteder

  • Kina
    • Fujian
      • Fuzhou, Fujian, Kina, 350001
        • Rekruttering
        • Fujian Medical University Union Hospital

Deltakelseskriterier

Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.

Kvalifikasjonskriterier

Kvalifikasjonskriterier

Nøkkelkravene som personer som ønsker å delta i en klinisk studie må oppfylle eller egenskapene de må ha. Kvalifikasjonskriterier består av både inklusjonskriterier (som kreves for at en person skal delta i studien) og eksklusjonskriterier (som hindrer en person i å delta). Typer kvalifikasjonskriterier inkluderer om en studie godtar friske frivillige, har alders- eller aldersgruppekrav, eller er begrenset av kjønn.

Alder som er kvalifisert for studier

  • Barn
  • Voksen
  • Eldre voksen

Tar imot friske frivillige

Nei

Kjønn som er kvalifisert for studier

Alle

Prøvetakingsmetode

Ikke-sannsynlighetsprøve

Studiepopulasjon

Patients with locally advanced rectal adenocarcinoma treated at Fujian Medical University Union Hospital, China, from whom tumour tissue and peripheral blood were collected before and during neoadjuvant therapy.

Beskrivelse

Inclusion Criteria:

  • Age 18 to 75 years
  • Eastern Cooperative Oncology Group performance status 0-1
  • Histologically confirmed rectal adenocarcinoma
  • Locally advanced disease staged as cT3-T4N0 or cT2-T4N+ without distant metastasis (AJCC 8th edition)
  • Lower border of the tumour within 10 cm of the anal verge
  • Scheduled to receive neoadjuvant therapy followed by surgery, with tumour tissue and peripheral blood available before and during neoadjuvant therapy
  • Written informed consent for fresh biopsy or surgical tissue, or a waiver granted by the institutional ethics committee for archival specimens

Exclusion Criteria:

  • Insufficient tissue or nucleic acid quality for the planned profiling assays
  • Incomplete clinical records precluding assessment of pathological or clinical response
  • A history of other malignancy within 5 years other than adequately treated carcinoma in situ or basal cell carcinoma

Studieplan

Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.

Hvordan er studiet utformet?

Designdetaljer

  • Observasjonsmodeller: COHORT
  • Tidsperspektiver: PROSPECTIVE

Kohorter og intervensjoner

Gruppe / Kohort

Gruppe / Kohort

En gruppe eller undergruppe av deltakere i en observasjonsstudie som vurderes for biomedisinske eller helsemessige utfall.
Achieved pathological or clinical complete response

Patients whose resection specimen showed a pathological complete response (ypT0N0) or who achieved a sustained clinical complete response, from whom pre-treatment and on-treatment tissue and blood were profiled.
Did not achieve pathological or clinical complete response

Patients with residual viable tumour at resection or without a sustained clinical complete response, from whom pre-treatment and on-treatment tissue and blood were profiled.

Hva måler studien?

Primære resultatmål

Primære resultatmål

I en klinisk studies protokoll er det planlagte utfallsmålet som er det viktigste for å evaluere effekten av en intervensjon/behandling. De fleste kliniske studier har ett primært utfallsmål, men noen har mer enn ett.
Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Change in immune and stromal cell composition in tumour tissue during neoadjuvant therapy
Tidsramme: Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation

Cell-type composition and transcriptional states of T, natural killer (NK), B and myeloid populations and of stromal subsets before treatment and during neoadjuvant therapy, determined by single-cell RNA sequencing.
Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation
Major pathological response (mPR) and its association with immune microenvironment features
Tidsramme: Through study completion, an average of 4 years

Proportion of patients achieving major pathological response, defined as 10% or less residual viable tumour at resection, and the association of pre-treatment and on-treatment immune microenvironment features with mPR.
Through study completion, an average of 4 years

Sekundære resultatmål

Sekundære resultatmål

I en klinisk studies protokoll, et planlagt utfallsmål som ikke er like viktig som det primære utfallsmålet for å evaluere effekten av en intervensjon, men som fortsatt er av interesse. De fleste kliniske studier har mer enn ett sekundært utfallsmål.
Resultatmål
Tiltaksbeskrivelse
Tidsramme
Transcriptional states of immune populations before and during treatment
Tidsramme: Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation

Exhaustion, activation and memory programmes of T and NK cells and B-cell states, determined by single-cell RNA sequencing with paired T-cell and B-cell receptor repertoire sequencing.
Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation
Spatial organisation of tumour and immune compartments before and during treatment
Tidsramme: Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation

Spatial distribution of tumour, immune and stromal compartments determined by spatial transcriptomics of formalin-fixed paraffin-embedded sections and multiplex immunofluorescence, compared with specimens from treatment-naive patients undergoing primary surgery and from end-of-treatment biopsies as controls.
Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation
Comparison of microenvironment remodelling between neoadjuvant treatment sequences
Tidsramme: Through study completion, an average of 4 years

Between-group comparison of the change in tumour microenvironment composition between baseline and week 4, expressed as the percentage of cluster of differentiation 8 (CD8)-positive T cells, NK cells, B cells and plasma cells among all cells measured by single-cell RNA sequencing, in patients receiving radiotherapy before versus after chemo-immunotherapy.
Through study completion, an average of 4 years
Somatic genomic alterations associated with response to neoadjuvant therapy
Tidsramme: Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation

Somatic mutations, copy-number alterations and mutational signatures determined by whole-genome sequencing of tumour tissue before and during neoadjuvant therapy.
Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation
Clonal diversity of the peripheral blood T-cell receptor repertoire
Tidsramme: Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation

Diversity and distribution of T-cell receptor clonotypes in peripheral blood mononuclear cells, expressed as the Shannon diversity index and the proportion of expanded clonotypes, measured by bulk T-cell receptor repertoire sequencing.
Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation
Correlation of tumour microbial composition with major pathological response
Tidsramme: Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation

Correlation between the relative abundance of tumour-associated bacterial taxa, expressed as the percentage of sequencing reads assigned to each taxon measured by small-subunit ribosomal RNA gene sequencing or shotgun metagenomic sequencing of tumour tissue, and major pathological response, expressed as the percentage of patients with 10% or less residual viable tumour at resection (exploratory).
Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation
Plasma protein and cytokine concentrations before and during neoadjuvant therapy
Tidsramme: Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation

Concentrations of plasma or serum proteins and cytokines, expressed in pg/mL, measured by multiplex proteomic and cytokine assays.
Baseline (before treatment) and week 4 after treatment initiation

Samarbeidspartnere og etterforskere

Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.

Sponsor

Sponsor

Organisasjonen eller personen som initierer studien og som har myndighet og kontroll over studien.
Fujian Medical University Union Hospital

Etterforskere

Etterforskere

En forsker involvert i en klinisk studie. Beslektede termer inkluderer stedets hovedetterforsker, stedsunderetterforsker, studieleder, studieleder og studiehovedetterforsker.
  • Studieleder: Jian Liu (jianliu@nankai.edu.cn), PhD, Nankai University

Studierekorddatoer

Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.

Studer hoveddatoer

Studiestart (Faktiske)

Studiestart

Den faktiske datoen da den første deltakeren ble registrert i en klinisk studie. Den "forventede" studiestartdatoen er datoen som forskerne tror vil være studiestartdatoen.
1. januar 2025

Primær fullføring (Antatt)

Primær fullføring

Datoen da den siste deltakeren i en klinisk studie ble undersøkt eller mottok en intervensjon for å samle inn endelige data for det primære utfallsmålet. Hvorvidt den kliniske studien ble avsluttet i henhold til protokollen eller ble avsluttet, påvirker ikke denne datoen. For kliniske studier med mer enn ett primært utfallsmål med ulike fullføringsdatoer, refererer dette begrepet til datoen da datainnsamlingen er fullført for alle de primære utfallsmålene. Den "forventede" primære fullføringsdatoen er datoen som forskerne tror vil være den primære fullføringsdatoen for studien.
31. desember 2028

Studiet fullført (Antatt)

Studiet fullført

Datoen da den siste deltakeren i en klinisk studie ble undersøkt eller mottok en intervensjon/behandling for å samle inn endelige data for de primære utfallsmålene, sekundære utfallsmålene og uønskede hendelsene (det vil si siste deltakers siste besøk). Den "forventede" studiens fullføringsdato er datoen som forskerne tror vil være studiens fullføringsdato.
31. desember 2028

Datoer for studieregistrering

Først innsendt

Først innsendt

Datoen da studiesponsoren eller etterforskeren først sendte inn en studiepost til ClinicalTrials.gov. Det er vanligvis en forsinkelse på noen dager mellom første innsendte dato og postens tilgjengelighet på ClinicalTrials.gov (den første postedatoen).
27. oktober 2026

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene

Datoen da studiesponsoren eller etterforskeren først sender inn en studiepost som er i samsvar med gjennomgangskriteriene for National Library of Medicine (NLM) kvalitetskontroll (QC). Sponsoren eller etterforskeren må kanskje revidere og sende inn en studiepost én eller flere ganger før NLMs kvalitetskontrollkriterier oppfylles. Det er sponsorens eller etterforskerens ansvar å sikre at studieposten er i samsvar med NLM QC-gjennomgangskriteriene.
2. november 2026

Først lagt ut (Faktiske)

Først lagt ut

Datoen da studieposten først var tilgjengelig på ClinicalTrials.gov etter at National Library of Medicine (NLM) kvalitetskontroll (QC) gjennomgang har konkludert. Det er vanligvis en forsinkelse på noen dager mellom datoen studiesponsoren eller etterforskeren sendte inn studieposten og den første postedatoen.
6. november 2026

Oppdateringer av studieposter

Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)

Sist oppdatering lagt ut

Den siste datoen da endringer i en studiepost ble gjort tilgjengelig på ClinicalTrials.gov. Det kan være en forsinkelse mellom når endringene ble sendt til ClinicalTrials.gov av studiens sponsor eller etterforsker (datoen for siste innsending av oppdatering) og datoen for siste oppdatering.
6. november 2026

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene

Den siste datoen da studiesponsoren eller etterforskeren sendte inn endringer i en studiepost som er i samsvar med gjennomgangskriteriene for National Library of Medicine (NLM) kvalitetskontroll (QC). Det er sponsorens eller etterforskerens ansvar å sikre at studieposten er i samsvar med NLM QC-gjennomgangskriteriene.
2. november 2026

Sist bekreftet

Sist bekreftet

Den siste datoen da studiesponsoren eller etterforskeren bekreftet at informasjonen om en klinisk studie på ClinicalTrials.gov var nøyaktig og oppdatert. Hvis en studie med rekrutteringsstatus for rekruttering; ikke rekrutterer ennå; eller aktiv, ikke rekruttering har ikke blitt bekreftet de siste 2 årene, studiens rekrutteringsstatus vises som ukjent.
1. november 2026

Mer informasjon

Begreper knyttet til denne studien

Nøkkelord

Ytterligere relevante MeSH-vilkår

Andre studie-ID-numre

Andre studie-ID-numre

Identifikatorer eller ID-numre andre enn NCT-nummeret som er tildelt en klinisk studie av studiens sponsor, finansierere eller andre. Disse tallene kan inkludere unike identifikatorer fra andre prøveregistre og National Institutes of Health-stipendnumre.
  • FJMUUH-RECT-OMICS-2024-01

Plan for individuelle deltakerdata (IPD)

Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?

NEI

IPD-planbeskrivelse

Individual participant data, including clinical records and sample-level identifiers, will not be shared. De-identified single-cell, bulk RNA sequencing and spatial transcriptomic data will be deposited in the Genome Sequence Archive for Human (GSA-Human), National Genomics Data Center, China, and will be made available for research use through the repository according to its access policy after publication.

Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter

Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt

Nei

Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt

Nei

Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .

Innstillinger for informasjonskapsler

Vi bruker informasjonskapsler for å sikre at vi gir deg den beste opplevelsen på nettstedet vårt. For mer informasjon, les nøye vår Retningslinjer for personvern og informasjonskapsler. ...>>>Du kan når som helst endre preferansene dine eller trekke tilbake samtykket ditt ved å slette informasjonskapslene fra nettstedet ditt eller datamaskinen som beskrevet i policyen. Godta det og velg dine preferanser ved å krysse av i de tilhørende rutene i delen "Administrer innstillinger" nedenfor. Les nøye gjennom servicevilkårene før du fortsetter å bruke noen del av dette nettstedet.
«Administrer innstillinger