Respiratorisk syncytial virusinfeksjon kan være farligere hos nyfødte

Denne enkeltsenter-tverrsnittsstudien ble utført ved University of Health Sciences Dr Behçet Uz Children's Hospital med et 400-sengers tertiærsykehus i İzmir, Tyrkia, i perioden 11. mars til 30. april 2020. Dette sykehuset er et pediatrisk henvisningssenter i Egeer-regionen i Tyrkia med årlige ca. 600 000 polikliniske pasienter og 24 000 sykehusinnleggelser. Alle barn med feber og hoste som ble testet ved tatt nasofaryngeale vattpinner for SARS-CoV2 og vanlige humane luftveispatogener ble inkludert i studien.

Klinikeren som var ansvarlig for å ta luftveisprøvene ble opplært av smittevernutvalget i prøvetaking og bruk av personlig verneutstyr. Først ble det tatt en orofaryngeal prøve, og deretter en nasopharyngeal prøve tatt med samme vattpinne fra pasient med feber og hoste/kortpustethet for SARS-CoV-2 PCR. Samme vattpinne ble brukt og plassert i samme transportmedium. Prøvene ble sendt til laboratoriet bestemt av Helsedepartementet, i henhold til kjølekjedereglene. Protokollen for Real Time-PCR var i samsvar med anbefalingen fra WHO. Sanntids-PCR ble utført ved de lokale statlige sentrene for sykdomskontroll og forebygging. Settet ble brukt på nukleinsyreisolater fra nasofaryngeal aspirat/skylling, bronkoalveolær skylling, nasofaryngeal vattpinne, orofaryngeal vattpinne og sputumprøver. Rask diagnose med settet oppnås via ett-trinns revers transkripsjon (RT) og sanntids PCR (qPCR) (RT-qPCR) rettet mot SARS-CoV-2 (2019-nCoV)-spesifikk RNA-avhengig RNA-polymerase (RdRp) genfragment. Det RdRp-genmålrettede Wuhan-RdRp-oligonukleotidsettet gir positive resultater bare med SARS-CoV-2 (2019-nCoV) (Bio-Speedy®, Tyrkia SARS-CoV-2 (2019-nCoV) qPCR Detection Kit)

Luftveisprøver tatt med nasofaryngeale vattpinner ble testet for vanlige menneskelige luftveispatogener. For testing av prøver ble det utført sanntids polymerasekjedereaksjon (PCR) assay. I analysen ble et kommersielt multipleks sanntids PCR-sett (Bosphore Respiratory Pathogens Panel Kit V4, Anatolia Geneworks, Tyrkia) brukt for å undersøke tilstedeværelsen av influensavirus (influensa A, pandemi H1N1 influensa A, sesongmessig H1N1 influensa A og influensa B) , Parainfluensa (PIV)-virus (PIV-1, PIV-2, PIV-3 og PIV-4), humant koronavirus (HCoV) (CoV OC43, CoV NL63, CoV HKU1 og CoV 229E), respiratorisk syncytialvirus (RSV) A /B, Rhinovirus, Metapneumovirus, Enterovirus, Bocavirus, Adenovirus, Parechovirus og bakterielle patogener som Mycoplasma pneumonia, Moraxella catarrhalis, Bordetella pertussis og Haemophilus influenzae type B i de kliniske prøvene.

Demografiske, epidemiologiske og kliniske data ble hentet fra sykehusets elektroniske informasjonssystemjournaler. For statistisk evaluering av dataene, SPSS 20.0 Microsoft for Windows (IBM Corporation, Armonk, NY, USA). ble brukt og P <0,05 verdi ble ansett som statistisk signifikant.