Luftvägssyncytialvirusinfektion kan vara farligare hos nyfödda

Denna tvärsnittsstudie med ett enda centrum genomfördes på University of Health Sciences Dr Behçet Uz Children's Hospital med ett sjukhus med 400 bäddar för tertiärvård i Izmir, Turkiet, under perioden 11 mars - 30 april 2020. Detta sjukhus är ett pediatriskt remisscenter i Egeiska regionen i Turkiet med årliga cirka 600 000 polikliniska patienter och 24 000 sjukhusinläggningar. Alla barn med feber och hosta som testades med tagna nasofarynxprover för SARS-CoV2 och vanliga humana luftvägspatogener inkluderades i studien.

Den läkare som ansvarar för att ta andningsproverna utbildades av smittskyddskommittén i provtagning och användning av personlig skyddsutrustning. Först togs ett orofarynxprov, och sedan togs ett nasofarynxprov med samma pinne från patient med feber och hosta/andnöd för SARS-CoV-2 PCR. Samma svabb användes och placerades i samma transportmedium. Proverna skickades till det laboratorium som fastställts av hälsoministeriet, enligt kylkedjans regler. Protokollet för Real Time-PCR överensstämde med WHO:s rekommendation. Realtids-PCR utfördes vid de lokala statliga centra för sjukdomskontroll och förebyggande. Satsen applicerades på nukleinsyraisolat från nasofaryngeal aspirat/sköljning, bronkoalveolär sköljning, nasofaryngeal pinnprover, orofaryngeala pinnprover och sputumprover. Snabb diagnos med kitet uppnås via ettstegs omvänd transkription (RT) och realtids-PCR (qPCR) (RT-qPCR) inriktad på SARS-CoV-2 (2019-nCoV)-specifikt RNA-beroende RNA-polymeras (RdRp) genfragment. Den RdRp-geninriktade Wuhan-RdRp-oligonukleotiduppsättningen ger positiva resultat endast med SARS-CoV-2 (2019-nCoV) (Bio-Speedy®, Turkiet SARS-CoV-2 (2019-nCoV) qPCR Detection Kit)

Andningsprov tagna med nasofaryngeala pinnprover testades för vanliga humana luftvägspatogener. För testning av prover utfördes realtidsanalys av polymeraskedjereaktion (PCR). I analysen användes ett kommersiellt multiplex realtids-PCR-kit (Bosphore Respiratory Pathogens Panel Kit V4, Anatolia Geneworks, Turkiet) för att undersöka förekomsten av influensavirus (Influensa A, Pandemic H1N1 Influenza A, Seasonal H1N1 Influenza A och Influenza B) , Parainfluensa (PIV)-virus (PIV-1, PIV-2, PIV-3 och PIV-4), humana coronavirus (HCoV) (CoV OC43, CoV NL63, CoV HKU1 och CoV 229E), respiratoriskt syncytialvirus (RSV) A /B, Rhinovirus, Metapneumovirus, Enterovirus, Bocavirus, Adenovirus, Parechovirus och bakteriella patogener såsom Mycoplasma pneumonia, Moraxella catarrhalis, Bordetella pertussis och Haemophilus influenzae typ B i de kliniska proverna.

Demografiska, epidemiologiska och kliniska data erhölls från sjukhusets elektroniska informationssystem medicinska journaler. För den statistiska utvärderingen av data, SPSS 20.0 Microsoft för Windows (IBM Corporation, Armonk, NY, USA). användes och P <0,05-värdet ansågs vara statistiskt signifikant.