Infekce respiračním syncytiálním virem může být nebezpečnější u novorozenců

Tato průřezová studie s jedním centrem byla provedena v Dětské nemocnici Dr Behçet Uz v dětské nemocnici Dr. Behçet Uz s 400 lůžky v tureckém İzmiru v období od 11. března do 30. dubna 2020. Tato nemocnice je pediatrickým referenčním centrem v Egejském regionu Turecka s přibližně 600 000 ambulantními pacienty ročně a 24 000 hospitalizacemi. Do studie byly zahrnuty všechny děti s horečkou a kašlem, které byly testovány odebranými nazofaryngeálními výtěry na SARS-CoV2 a běžné patogeny lidských dýchacích cest.

Lékař odpovědný za odběr vzorků z dýchacích cest byl vyškolen komisí pro kontrolu infekce ohledně odběru vzorků a používání osobních ochranných prostředků. Nejprve byl odebrán orofaryngeální vzorek a poté byl odebrán vzorek z nosohltanu pomocí stejného výtěru od pacienta s horečkou a kašlem/dušností pro SARS-CoV-2 PCR. Byl použit stejný tampon a umístěn do stejného transportního média. Vzorky byly zaslány do laboratoře určené ministerstvem zdravotnictví podle pravidel chladícího řetězce. Protokol real Time-PCR byl v souladu s doporučením WHO. V místních vládních centrech pro kontrolu a prevenci nemocí byla provedena PCR v reálném čase. Souprava byla aplikována na izoláty nukleových kyselin z nasofaryngeálního aspirátu/výplachu, bronchoalveolární laváže, nazofaryngeálních výtěrů, orofaryngeálních výtěrů a vzorků sputa. Rychlá diagnostika pomocí soupravy je dosažena pomocí jednokrokové reverzní transkripce (RT) a PCR v reálném čase (qPCR) (RT-qPCR) zaměřené na SARS-CoV-2 (2019-nCoV) specifickou RNA-dependentní RNA polymerázu (RdRp) genový fragment. Sada oligonukleotidů Wuhan-RdRp cílená na gen RdRp poskytuje pozitivní výsledky pouze s SARS-CoV-2 (2019-nCoV) (Bio-Speedy®, Turecko SARS-CoV-2 (2019-nCoV) qPCR detekční sada)

Vzorky z dýchacích cest odebrané výtěry z nosohltanu byly testovány na běžné patogeny lidského dýchacího traktu. Pro testování vzorků byl proveden test polymerázové řetězové reakce v reálném čase (PCR). V testu byla použita komerční multiplexní sada PCR v reálném čase (Bosphore Respiratory Pathogens Panel Kit V4, Anatolia Geneworks, Turecko) ke zkoumání přítomnosti chřipkových virů (chřipka A, pandemická chřipka H1N1, sezónní chřipka A a chřipka B) , viry parainfluenzy (PIV) (PIV-1, PIV-2, PIV-3 a PIV-4), lidské koronaviry (HCoV) (CoV OC43, CoV NL63, CoV HKU1 a CoV 229E), respirační syncytiální virus (RSV) A /B, Rhinovirus, Metapneumovirus, Enterovirus, Bocavirus, Adenovirus, Parechovirus a bakteriální patogeny jako Mycoplasma pneumonia, Moraxella catarrhalis, Bordetella pertussis a Haemophilus influenzae typu B v klinických vzorcích.

Demografické, epidemiologické a klinické údaje byly získány ze zdravotnické dokumentace nemocničního elektronického informačního systému. Pro statistické vyhodnocení dat SPSS 20.0 Microsoft pro Windows (IBM Corporation, Armonk, NY, USA). byla použita hodnota P <0,05 byla považována za statisticky významnou.