Infekcja syncytialnym wirusem oddechowym może być bardziej niebezpieczna u noworodków

To jednoośrodkowe badanie przekrojowe przeprowadzono w Szpitalu Dziecięcym Dr Behçet Uz Uniwersytetu Nauk o Zdrowiu wraz ze szpitalem trzeciego stopnia opieki na 400 łóżek w Izmirze w Turcji w okresie od 11 marca do 30 kwietnia 2020 r. Ten szpital jest pediatrycznym centrum referencyjnym w regionie Morza Egejskiego w Turcji, w którym rocznie przyjmuje się około 600 000 pacjentów ambulatoryjnych i 24 000 hospitalizacji. Do badania włączono wszystkie dzieci z gorączką i kaszlem, u których pobrano wymazy z nosogardzieli na SARS-CoV2 i powszechne patogeny dróg oddechowych człowieka.

Lekarz odpowiedzialny za pobieranie próbek z dróg oddechowych został przeszkolony przez komisję ds. kontroli zakażeń w zakresie pobierania próbek i stosowania środków ochrony indywidualnej. Najpierw pobrano próbkę z jamy ustnej i gardła, a następnie pobrano próbkę z nosogardzieli przy użyciu tego samego wymazu od pacjenta z gorączką i kaszlem/dusznością w kierunku SARS-CoV-2 PCR. Zastosowano ten sam wymaz i umieszczono w tym samym podłożu transportowym. Próbki zostały przesłane do laboratorium wskazanego przez Ministerstwo Zdrowia z zachowaniem zasad łańcucha chłodniczego. Protokół Real Time-PCR był zgodny z zaleceniami WHO. PCR w czasie rzeczywistym przeprowadzono w lokalnych rządowych ośrodkach kontroli i zapobiegania chorobom. Zestaw nanoszono na izolaty kwasu nukleinowego z aspiratu/płukania nosogardzieli, popłuczyn oskrzelowo-pęcherzykowych, wymazu z nosogardzieli, wymazu z jamy ustnej i gardła oraz próbek plwociny. Szybka diagnoza za pomocą zestawu jest osiągana za pomocą jednoetapowej odwrotnej transkrypcji (RT) i PCR w czasie rzeczywistym (qPCR) (RT-qPCR) ukierunkowanej na specyficzną dla SARS-CoV-2 (2019-nCoV) polimerazę RNA zależną od RNA (RdRp) fragment genu. Zestaw oligonukleotydów Wuhan-RdRp ukierunkowany na gen RdRp daje pozytywne wyniki tylko z zestawem do wykrywania SARS-CoV-2 (2019-nCoV) (Bio-Speedy®, Turcja SARS-CoV-2 (2019-nCoV) qPCR Detection Kit)

Próbki oddechowe pobrane przez wymazy z jamy nosowo-gardłowej zbadano pod kątem powszechnych patogenów ludzkich dróg oddechowych. W celu zbadania próbek przeprowadzono reakcję łańcuchową polimerazy (PCR) w czasie rzeczywistym. W teście zastosowano komercyjny multipleksowy zestaw PCR w czasie rzeczywistym (Bosphore Respiratory Pathogens Panel Kit V4, Anatolia Geneworks, Turcja) do zbadania obecności wirusów grypy (grypa A, grypa pandemiczna H1N1 A, sezonowa grypa H1N1 A i grypa B) , wirusy paragrypy (PIV) (PIV-1, PIV-2, PIV-3 i PIV-4), ludzkie koronawirusy (HCoV) (CoV OC43, CoV NL63, CoV HKU1 i CoV 229E), syncytialny wirus oddechowy (RSV) A /B, rinowirusa, metapneumowirusa, enterowirusa, bokawirusa, adenowirusa, parechowirusa i patogenów bakteryjnych, takich jak Mycoplasma pneumonia, Moraxella catarrhalis, Bordetella pertussis i Haemophilus influenzae typu B w próbkach klinicznych.

Dane demograficzne, epidemiologiczne i kliniczne uzyskano z dokumentacji medycznej szpitalnego elektronicznego systemu informacyjnego. Do statystycznej oceny danych SPSS 20.0 Microsoft dla Windows (IBM Corporation, Armonk, NY, USA). zastosowano, a wartość P <0,05 uznano za istotną statystycznie.