Endogenne retrowirusy w ostrej białaczce szpikowej (ERVAL)
Ludzkie endogenne retrowirusy w ostrej białaczce szpikowej: ekspresja i wpływ immunologiczny
Allogeniczny przeszczep hematopoetycznych komórek macierzystych (HSCT) jest jedyną terapią leczniczą wielu złośliwych chorób hematologicznych. Pomimo ostatnich postępów w tej dziedzinie, wskaźniki nawrotów są nadal wysokie i stanowią pierwszą przyczynę śmierci. Pilnie potrzebna jest zatem identyfikacja nowych odpowiednich celów terapeutycznych.
Ludzkie endogenne retrowirusy (HERV) stanowią 8% ludzkiego genomu. Podczas wyciszania w stanie ustalonym (głównie przez mechanizmy metylacji), reaktywacje HERV zostały opisane w różnych stanach, takich jak choroby autoimmunologiczne lub rak, prowadząc do wrodzonej i nabytej odpowiedzi immunologicznej. W dziedzinie hematologii pojawia się kilka pytań, gdzie dostępnych jest niewiele danych, a dokładna rola HERV w tych chorobach wciąż nie została zdefiniowana.
Nasz zespół pracuje obecnie nad rolą HERV w różnych typach nowotworów. Opracowaliśmy podejście bioinformatyczne do identyfikacji nadeksprymowanych HERV na podstawie danych RNAseq. Opracowaliśmy również testy in vitro do oceny immunogenności różnych peptydów z otwartych ramek odczytu HERV i wykazaliśmy, że kilka epitopów wspólnych dla różnych HERV może indukować specyficzną odpowiedź limfocytów T CD8+. Niedawno przeanalizowaliśmy 151 danych RNAseq ostrej białaczki szpikowej (AML) z TCGA i zidentyfikowaliśmy wiele nadeksprymowanych HERV w tej chorobie. Testy immunogenności są obecnie przeprowadzane z krwi pacjenta w momencie diagnozy.
Głównym celem tej części naszego projektu jest analiza ustalenia odpowiedzi limfocytów T CD8+ specyficznych dla HERV, biorących udział w efekcie przeszczep przeciw białaczce po HSCT u pacjentów z AML. Drugorzędnymi celami są analiza relacji między tą odpowiedzią a różnymi czynnikami klinicznymi, takimi jak początek GVHD lub nawrót choroby.
Komórki jednojądrzaste krwi obwodowej (PBMC) od pacjentów z AML zostaną wyekstrahowane i zamrożone w różnych punktach czasowych: diagnoza, całkowita remisja (przed HSCT) i po HSCT (M3, M6 i M12). Ten prospektywny protokół jest obecnie realizowany w Centre Hospitalier Lyon Sud, gdzie dostępnych jest już około 30 próbek.
Po wybraniu odpowiednich HERVs zostaną zsyntetyzowane specyficzne dekstramery zidentyfikowane przez kod kreskowy DNA. Te dekstramery umożliwiające identyfikację specyficznych odpowiedzi komórek T skierowanych przeciwko nawet 1000 epitopom, będziemy w stanie przeszukiwać specyficzne komórki T skierowane przeciwko HERV nadeksprymowane w AML pod kątem najpowszechniejszego HLA. Barwienie dekstramerem zostanie przeprowadzone na PBMC po rozmrożeniu. Komórki pozytywne zostaną posortowane za pomocą cytometrii przepływowej, a DNA zostanie rozszerzone metodą PCR przed wykonaniem sekwencjonowania, co pozwoli na identyfikację określonych sekwencji za pomocą unikalnego kodu kreskowego DNA.
Analiza specyficznych dla HERV odpowiedzi limfocytów T CD8+ po HSCT pozwoli lepiej określić rolę HERV w powstawaniu efektu przeszczep przeciw białaczce. Specyficzna odpowiedź komórek T bez GvHD określi znaczenie takich peptydów jako antygenów specyficznych dla nowotworu.
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Typ studiów
Typ studiów
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Ostra białaczka szpikowa (wszystkie podtypy)
- Wskazania do przeszczepu komórek macierzystych
- Brak sprzeciwu wobec badania
Kryteria wyłączenia:
- Oddział intensywnej terapii w chwili rozpoznania
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Pacjenci
Pacjenci z nawrotem choroby lub bez niej po przeszczepieniu hematopoetycznych komórek macierzystych.
|
Ocena limfocytów T CD8+ specyficznych dla HERV przed i po przeszczepie hematopoetycznych komórek macierzystych. Porównanie zostanie przeprowadzone u pacjentów z nawrotem choroby i pacjentów bez nawrotu choroby. Pomiar tych odpowiedzi zostanie przeprowadzony za pomocą dextrameru, co umożliwi precyzyjny i specyficzny pomiar limfocytów skierowanych przeciwko HERV będącym przedmiotem zainteresowania. |
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Odpowiedzi komórek T CD8 + specyficzne dla HERV
Ramy czasowe: Dzień 0
|
Odpowiedzi limfocytów T CD8+ specyficzne dla HERV będą monitorowane przy użyciu dekstramerów kodu kreskowego DNA.
|
Dzień 0
|
|
Odpowiedzi komórek T CD8 + specyficzne dla HERV
Ramy czasowe: W remisji <- dzień 0 + 1 miesiąc
|
Odpowiedzi limfocytów T CD8+ specyficzne dla HERV będą monitorowane przy użyciu dekstramerów kodu kreskowego DNA.
|
W remisji <- dzień 0 + 1 miesiąc
|
|
Odpowiedzi komórek T CD8 + specyficzne dla HERV
Ramy czasowe: Przed przeszczepem <- Dzień 0 + 3 miesiące
|
Odpowiedzi limfocytów T CD8+ specyficzne dla HERV będą monitorowane przy użyciu dekstramerów kodu kreskowego DNA.
|
Przed przeszczepem <- Dzień 0 + 3 miesiące
|
|
Odpowiedzi komórek T CD8 + specyficzne dla HERV
Ramy czasowe: 1 miesiąc
|
Odpowiedzi limfocytów T CD8+ specyficzne dla HERV będą monitorowane przy użyciu dekstramerów kodu kreskowego DNA.
|
1 miesiąc
|
|
Odpowiedzi komórek T CD8 + specyficzne dla HERV
Ramy czasowe: 3 miesiące
|
Odpowiedzi limfocytów T CD8+ specyficzne dla HERV będą monitorowane przy użyciu dekstramerów kodu kreskowego DNA.
|
3 miesiące
|
|
Odpowiedzi komórek T CD8 + specyficzne dla HERV
Ramy czasowe: 6 miesięcy
|
Odpowiedzi limfocytów T CD8+ specyficzne dla HERV będą monitorowane przy użyciu dekstramerów kodu kreskowego DNA.
|
6 miesięcy
|
|
Odpowiedzi komórek T CD8 + specyficzne dla HERV
Ramy czasowe: 12 miesięcy
|
Odpowiedzi limfocytów T CD8+ specyficzne dla HERV będą monitorowane przy użyciu dekstramerów kodu kreskowego DNA.
|
12 miesięcy
|
|
Odpowiedzi komórek T CD8 + specyficzne dla HERV
Ramy czasowe: W przypadku nawrotu: do 6 miesięcy po dniu 0
|
Odpowiedzi limfocytów T CD8+ specyficzne dla HERV będą monitorowane przy użyciu dekstramerów kodu kreskowego DNA.
|
W przypadku nawrotu: do 6 miesięcy po dniu 0
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Śledczy
Śledczy
- Główny śledczy: Vincent ALCAZER, MD, Hospices Civils de Lyon
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (RZECZYWISTY)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (RZECZYWISTY)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (RZECZYWISTY)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (RZECZYWISTY)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (RZECZYWISTY)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- 69HCL19_0851
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .