NGS w raku pęcherzyka żółciowego i odpowiedzi na leczenie
Mutacje genetyczne i odpowiedź na leczenie raka pęcherzyka żółciowego: szpitalne badanie kohortowe
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Rak pęcherzyka żółciowego (GBC) jest najczęstszym rodzajem raka dróg żółciowych i trzecim najczęstszym nowotworem przewodu pokarmowego w Indiach. GBC powstaje w przebiegu przewlekłego stanu zapalnego, a jego najczęstszym źródłem są cholesterolowe kamienie żółciowe (u ponad 75% pacjentów). Inne przyczyny przewlekłego stanu zapalnego obejmują pierwotne stwardniające zapalenie dróg żółciowych, wrzodziejące zapalenie jelita grubego, przywry wątrobowe, przewlekłe zakażenia Salmonella typhi i paratyphi oraz zakażenie Helicobacter. Zidentyfikowano również wiele innych czynników, takich jak spożycie niektórych chemikaliów, narażenie na zanieczyszczenie wody, metale ciężkie i narażenie na promieniowanie. Tylko niewielka część GBC jest związana z zespołami dziedzicznymi, takimi jak zespół Gardnera, nerwiakowłókniakowatość typu I i dziedziczny rak okrężnicy niezwiązany z polipowatością.
Spośród wielu zmian molekularnych obserwowanych w GBC nie było jeszcze możliwe określenie, które z nich są genami „sterującymi” lub kontrolującymi proces nowotworowy i odróżnienie ich od genów „pasażerskich”, tych obserwowanych głównie w sporadycznych nowotworach złośliwych, takich jak GBC, w którym dominują zmiany epigenetyczne. Najczęściej mutowanymi genami w GBC są: TP53 (41%), CDKN2A (28%), KRAS (19%), TERT (8%), CTNNB1 (8%) i PI3K (7%). Szlak sygnałowy rodziny ERBB jest jednym z najczęściej mutowanych w GBC. Receptory te uczestniczą w regulowaniu proliferacji, różnicowania i przeżycia komórek. Ich amplifikacja przekłada się głównie na nadekspresję białka. Receptor HER2/NEU, po dimeryzacji, aktywuje wiele różnych dalszych szlaków, takich jak RAS-RAF-MEK-ERK1/2 lub PI3k-AKT-MTOR, które mają ogromny wpływ na proliferację komórek. Z drugiej strony, PTEN (homolog fosfatazy i tensyny) jest genem supresorowym guza, który koduje białko z funkcją fosfatazy, które dezaktywuje substraty takie jak PI3K. Brak funkcjonalnego białka PTEN pozwala na aktywację PI3k z jeszcze większą intensywnością niż mutacja aktywująca samego PI3K. Niekontrolowana produkcja PIP3 jest jednym z najważniejszych efektorów szlaku PI3K/AKT z mTOR stymulującym syntezę białek regulujących apoptozę. Immunohistochemiczna ekspresja białka PTEN jest uważana za dobry sposób oceny stanu funkcjonalnego genu.
- Kompleksowa historia i badanie fizykalne pacjentów oraz wszystkie szczegóły zostaną zapisane w gotowym formularzu. Wszystkie rutynowe badania, zgodnie ze wskazaniami, w tym biopsja w celu ustalenia diagnozy i CT/MRI/MRCP jamy brzusznej w celu zmierzenia wymiarów guza i określenia stopnia zaawansowania choroby przed rozpoczęciem leczenia, zostaną zarejestrowane.
- Tkanka archiwalna zostanie zbadana pod kątem ekspresji mutacji genów za pomocą analizy molekularnej przy użyciu sekwencjonowania nowej generacji. Pacjenci leczeni w latach 2017-2020, dla których dostępne są informacje NGS, również zostaną uwzględnieni w retrospekcji. Ich dane zostaną wyodrębnione z dokumentacji medycznej i zostaną podjęte próby skontaktowania się z nimi w celu dalszych działań.
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Zapisy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Manoj Pandey, MS, PhD
- Numer telefonu: 2361014
- E-mail: mpandey66@bhu.ac.in
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: S K Singh, MD, DM
- Numer telefonu: 2361014
- E-mail: mdean.ims@gmail.com
Lokalizacje studiów
-
-
UP
-
Varanasi, UP, Indie, 221005
- Rekrutacyjny
- Banaras Hindu University
-
Kontakt:
- Manoj Pandey, MS, PhD
- E-mail: mpandey66@bhu.ac.in
-
Kontakt:
- Manoj Pandey, MS, PhD
- Numer telefonu: 2361014
- E-mail: mpandey66@bhu.ac.in
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Nieleczeni dotychczas pacjenci z histologicznie potwierdzonym rakiem pęcherzyka żółciowego.
Kryteria wyłączenia:
- Brak histologicznych dowodów na złośliwość
- Kobiety w ciąży i karmiące piersią
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Rak pęcherzyka żółciowego
Pacjenci z potwierdzonym rozpoznaniem raka pęcherzyka żółciowego
|
NGS przeprowadza się na DNA wyizolowanym z tkanki zatopionej w parafinie
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Odpowiedź na leczenie
Ramy czasowe: 1 rok
|
Odpowiedź na leczenie w zakresie chemioterapii
|
1 rok
|
|
Ogólne przetrwanie
Ramy czasowe: 5 lat
|
Przeżycie pacjentów od daty rozpoznania do zakończenia badania lub zgonu, w zależności od tego, co nastąpi wcześniej
|
5 lat
|
Miary wyników drugorzędnych
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
PFS
Ramy czasowe: 5 lat
|
Przeżycie bez progresji od daty rozpoznania do progresji choroby
|
5 lat
|
|
RFS
Ramy czasowe: 5 lat
|
Przeżycie bez nawrotów od daty rozpoznania do wystąpienia nawrotu lub przerzutów
|
5 lat
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Śledczy
Śledczy
- Główny śledczy: Manoj Pandey, MS, PhD, Banaras Hindu University
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Begnami MD, Fukuda E, Fregnani JH, Nonogaki S, Montagnini AL, da Costa WL Jr, Soares FA. Prognostic implications of altered human epidermal growth factor receptors (HERs) in gastric carcinomas: HER2 and HER3 are predictors of poor outcome. J Clin Oncol. 2011 Aug 1;29(22):3030-6. doi: 10.1200/JCO.2010.33.6313. Epub 2011 Jun 27.
- Sanders G, Kingsnorth AN. Gallstones. BMJ. 2007 Aug 11;335(7614):295-9. doi: 10.1136/bmj.39267.452257.AD. No abstract available.
- Hsing AW, Gao YT, Han TQ, Rashid A, Sakoda LC, Wang BS, Shen MC, Zhang BH, Niwa S, Chen J, Fraumeni JF Jr. Gallstones and the risk of biliary tract cancer: a population-based study in China. Br J Cancer. 2007 Dec 3;97(11):1577-82. doi: 10.1038/sj.bjc.6604047. Epub 2007 Nov 13.
- Ishiguro S, Inoue M, Kurahashi N, Iwasaki M, Sasazuki S, Tsugane S. Risk factors of biliary tract cancer in a large-scale population-based cohort study in Japan (JPHC study); with special focus on cholelithiasis, body mass index, and their effect modification. Cancer Causes Control. 2008 Feb;19(1):33-41. doi: 10.1007/s10552-007-9067-8. Epub 2007 Sep 30.
- Trajber HJ, Szego T, de Camargo HS Jr, Mester M, Marujo WC, Roll S. Adenocarcinoma of the gallbladder in two siblings. Cancer. 1982 Sep 15;50(6):1200-3. doi: 10.1002/1097-0142(19820915)50:63.0.co;2-a.
- Weiss KM, Ferrell RE, Hanis CL, Styne PN. Genetics and epidemiology of gallbladder disease in New World native peoples. Am J Hum Genet. 1984 Nov;36(6):1259-78.
- Tafe LJ, Tsongalis GJ. The human epidermal growth factor receptor 2 (HER2). Clin Chem Lab Med. 2011 Sep 15;50(1):23-30. doi: 10.1515/CCLM.2011.707.
- Ocana A, Vera-Badillo F, Al-Mubarak M, Templeton AJ, Corrales-Sanchez V, Diez-Gonzalez L, Cuenca-Lopez MD, Seruga B, Pandiella A, Amir E. Activation of the PI3K/mTOR/AKT pathway and survival in solid tumors: systematic review and meta-analysis. PLoS One. 2014 Apr 28;9(4):e95219. doi: 10.1371/journal.pone.0095219. eCollection 2014.
- Lavorato-Rocha AM, Anjos LG, Cunha IW, Vassallo J, Soares FA, Rocha RM. Immunohistochemical assessment of PTEN in vulvar cancer: best practices for tissue staining, evaluation, and clinical association. Methods. 2015 May;77-78:20-4. doi: 10.1016/j.ymeth.2014.12.017. Epub 2015 Jan 3.
- Sakr RA, Barbashina V, Morrogh M, Chandarlapaty S, Andrade VP, Arroyo CD, Olvera N, King TA. Protocol for PTEN expression by immunohistochemistry in formalin-fixed paraffin-embedded human breast carcinoma. Appl Immunohistochem Mol Morphol. 2010 Jul;18(4):371-4. doi: 10.1097/PAI.0b013e3181d50bd5.
- Djordjevic B, Hennessy BT, Li J, Barkoh BA, Luthra R, Mills GB, Broaddus RR. Clinical assessment of PTEN loss in endometrial carcinoma: immunohistochemistry outperforms gene sequencing. Mod Pathol. 2012 May;25(5):699-708. doi: 10.1038/modpathol.2011.208. Epub 2012 Feb 3.
- Rajput M, Chigurupati S, Purwar R, Shukla M, Pandey M. MAP kinase and mammalian target of rapamycin are main pathways of gallbladder carcinogenesis: results from bioinformatic analysis of next generation sequencing data from a hospital-based cohort (NCT05404347). Mol Biol Rep. 2022 Nov;49(11):10153-10163. doi: 10.1007/s11033-022-07874-4. Epub 2022 Aug 26.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Szacowany)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- NGSGB1
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Opis planu IPD
Ramy czasowe udostępniania IPD
Kryteria dostępu do udostępniania IPD
Typ informacji pomocniczych dotyczących udostępniania IPD
- PROTOKÓŁ BADANIA
- SOK ROŚLINNY
- ICF
- ANALITYCZNY_KOD
- CSR
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .