NGS w raku pęcherzyka żółciowego i odpowiedzi na leczenie

Rak pęcherzyka żółciowego (GBC) jest najczęstszym rodzajem raka dróg żółciowych i trzecim najczęstszym nowotworem przewodu pokarmowego w Indiach. GBC powstaje w przebiegu przewlekłego stanu zapalnego, a jego najczęstszym źródłem są cholesterolowe kamienie żółciowe (u ponad 75% pacjentów). Inne przyczyny przewlekłego stanu zapalnego obejmują pierwotne stwardniające zapalenie dróg żółciowych, wrzodziejące zapalenie jelita grubego, przywry wątrobowe, przewlekłe zakażenia Salmonella typhi i paratyphi oraz zakażenie Helicobacter. Zidentyfikowano również wiele innych czynników, takich jak spożycie niektórych chemikaliów, narażenie na zanieczyszczenie wody, metale ciężkie i narażenie na promieniowanie. Tylko niewielka część GBC jest związana z zespołami dziedzicznymi, takimi jak zespół Gardnera, nerwiakowłókniakowatość typu I i dziedziczny rak okrężnicy niezwiązany z polipowatością.

Spośród wielu zmian molekularnych obserwowanych w GBC nie było jeszcze możliwe określenie, które z nich są genami „sterującymi” lub kontrolującymi proces nowotworowy i odróżnienie ich od genów „pasażerskich”, tych obserwowanych głównie w sporadycznych nowotworach złośliwych, takich jak GBC, w którym dominują zmiany epigenetyczne. Najczęściej mutowanymi genami w GBC są: TP53 (41%), CDKN2A (28%), KRAS (19%), TERT (8%), CTNNB1 (8%) i PI3K (7%). Szlak sygnałowy rodziny ERBB jest jednym z najczęściej mutowanych w GBC. Receptory te uczestniczą w regulowaniu proliferacji, różnicowania i przeżycia komórek. Ich amplifikacja przekłada się głównie na nadekspresję białka. Receptor HER2/NEU, po dimeryzacji, aktywuje wiele różnych dalszych szlaków, takich jak RAS-RAF-MEK-ERK1/2 lub PI3k-AKT-MTOR, które mają ogromny wpływ na proliferację komórek. Z drugiej strony, PTEN (homolog fosfatazy i tensyny) jest genem supresorowym guza, który koduje białko z funkcją fosfatazy, które dezaktywuje substraty takie jak PI3K. Brak funkcjonalnego białka PTEN pozwala na aktywację PI3k z jeszcze większą intensywnością niż mutacja aktywująca samego PI3K. Niekontrolowana produkcja PIP3 jest jednym z najważniejszych efektorów szlaku PI3K/AKT z mTOR stymulującym syntezę białek regulujących apoptozę. Immunohistochemiczna ekspresja białka PTEN jest uważana za dobry sposób oceny stanu funkcjonalnego genu.

1. Kompleksowa historia i badanie fizykalne pacjentów oraz wszystkie szczegóły zostaną zapisane w gotowym formularzu. Wszystkie rutynowe badania, zgodnie ze wskazaniami, w tym biopsja w celu ustalenia diagnozy i CT/MRI/MRCP jamy brzusznej w celu zmierzenia wymiarów guza i określenia stopnia zaawansowania choroby przed rozpoczęciem leczenia, zostaną zarejestrowane.
2. Tkanka archiwalna zostanie zbadana pod kątem ekspresji mutacji genów za pomocą analizy molekularnej przy użyciu sekwencjonowania nowej generacji. Pacjenci leczeni w latach 2017-2020, dla których dostępne są informacje NGS, również zostaną uwzględnieni w retrospekcji. Ich dane zostaną wyodrębnione z dokumentacji medycznej i zostaną podjęte próby skontaktowania się z nimi w celu dalszych działań.